79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0126 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0126  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  756    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447116  normal  0.743413 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4323  hypothetical protein  68.57 
 
 		 378 aa  478  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113559 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1408  protein of unknown function DUF214  59.33 
 
 		 379 aa  428  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.485745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1553  hypothetical protein  29.49 
 
 		 376 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3894  hypothetical protein  27.62 
 
 		 402 aa  115  8.999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3338  hypothetical protein  27.56 
 
 		 401 aa  107  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7062  putative ABC transporter, permease protein  27.42 
 
 		 377 aa  106  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4023  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.06 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5155  protein of unknown function DUF214  26.73 
 
 		 407 aa  99.8  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1251  DevC protein  25.57 
 
 		 389 aa  91.7  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0933437  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1218  DevC protein  25.77 
 
 		 389 aa  90.1  5e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.188524  normal  0.730906 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2146  protein of unknown function DUF214  23.46 
 
 		 392 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0104  protein of unknown function DUF214  24.1 
 
 		 378 aa  88.2  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.33773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0102  ABC transporter, permease protein, putative  24.1 
 
 		 378 aa  88.2  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1317  efflux ABC transporter, permease protein  25.32 
 
 		 378 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2626  efflux ABC transporter, permease protein  25.32 
 
 		 378 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0172  efflux ABC transporter, permease protein  25.32 
 
 		 378 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.776599  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0146  ABC transporter, permease protein  25.32 
 
 		 378 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1034  ABC transporter, permease protein  25.32 
 
 		 378 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778603  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0313  protein of unknown function DUF214  22.89 
 
 		 380 aa  84.7  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5592  protein of unknown function DUF214  25.06 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00756234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3083  hypothetical protein  24.07 
 
 		 376 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262583  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0444  ABC transporter, permease protein  24.81 
 
 		 378 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147924  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0167  hypothetical protein  25.13 
 
 		 380 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7011  hypothetical protein  25.38 
 
 		 378 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0792174  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2769  ABC transporter, permease protein, putative  25.06 
 
 		 378 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715584  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1223  DevC protein  24.12 
 
 		 392 aa  80.9  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0757  ABC transporter transmembrane protein  25.25 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.750458  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5886  hypothetical protein  24.94 
 
 		 378 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0698  protein of unknown function DUF214  24.21 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112552 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1293  hypothetical protein  25.38 
 
 		 384 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1222  hypothetical protein  24.44 
 
 		 398 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08351  ABC-transporter, membrane spanning component  23.8 
 
 		 390 aa  77  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2114  hypothetical protein  21.8 
 
 		 380 aa  75.9  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000213217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10141  ABC-transporter, membrane spanning component  24.69 
 
 		 390 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8535  normal  0.0327944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4104  DevC protein  20.76 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.312226  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16601  ABC-transporter, membrane spanning component  24.49 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.513807 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0010  protein of unknown function DUF214  23.31 
 
 		 380 aa  73.2  0.000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000261565  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08091  ABC-transporter, membrane spanning component  24.5 
 
 		 390 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.270503  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08101  ABC-transporter, membrane spanning component  24.5 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0827  ABC transporter, permease protein, putative  25.19 
 
 		 410 aa  69.7  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0153  ABC transporter transmembrane protein  23.54 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3639  DevC protein  23 
 
 		 388 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.543907  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1117  protein of unknown function DUF214  21.39 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2797  hypothetical protein  22.25 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3587  DevC protein  23.06 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.694594  normal  0.0264093 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0091  DevC protein  27.06 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07851  ABC-transporter, membrane spanning component  23.29 
 
 		 391 aa  67  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.165508  normal  0.803737 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2730  DevC protein  26 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.890192 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4558  protein of unknown function DUF214  22.25 
 
 		 378 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.987497  normal  0.0915843 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4425  protein of unknown function DUF214  22.25 
 
 		 378 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.144574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0009  DevC protein  22.87 
 
 		 384 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.611516 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3920  DevC protein  29.3 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0600  DevC protein  25 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2092  DevC protein  22.14 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000758237 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1505  hypothetical protein  20.15 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.481293  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2891  DevC protein  23.21 
 
 		 395 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.822086  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0999  protein of unknown function DUF214  25.06 
 
 		 414 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.59064  normal  0.175396 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2646  ABC transporter, permease component  21.53 
 
 		 374 aa  63.2  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1233  DevC protein  27.66 
 
 		 392 aa  62.8  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000657909  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0469  protein of unknown function DUF214  21.86 
 
 		 386 aa  61.6  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2250  DevC protein  24.9 
 
 		 385 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0331  DevC protein  21.95 
 
 		 385 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1808  ABC-transporter permease protein, putative  21.3 
 
 		 366 aa  60.8  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218527  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3751  DevC protein  22.78 
 
 		 383 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3709  protein of unknown function DUF214  20.76 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2586  DevC protein  29.37 
 
 		 392 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.131635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1630  protein of unknown function DUF214  23.77 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4445  DevC protein  25.88 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3800  DevC protein  22.53 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4544  protein of unknown function DUF214  21.36 
 
 		 372 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0301435  normal  0.636617 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2783  ABC transporter, membrane spanning subunit, devC-like  23.16 
 
 		 393 aa  50.1  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.301274  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1432  hypothetical protein  21.33 
 
 		 402 aa  47.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.696316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  31.75 
 
 		 847 aa  47  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1327  protein of unknown function DUF214  26.38 
 
 		 400 aa  45.8  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.674334  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1574  hypothetical protein  27.11 
 
 		 789 aa  45.8  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1242  hypothetical protein  28.83 
 
 		 400 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1835  hypothetical protein  25.15 
 
 		 399 aa  43.5  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515684  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3776  hypothetical protein  23.93 
 
 		 380 aa  43.1  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.71489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>