More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0096 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 
167 aa  342  1e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  61.69 
 
 
170 aa  203  8e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  63.29 
 
 
172 aa  201  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  59.63 
 
 
169 aa  197  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  60 
 
 
168 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  60.87 
 
 
173 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  58.64 
 
 
186 aa  195  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0126  flavin reductase-like, FMN-binding  61.04 
 
 
186 aa  194  6e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  58.02 
 
 
186 aa  193  9e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5008  flavin reductase domain-containing protein  62.11 
 
 
173 aa  189  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442904  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0092  flavin reductase domain-containing protein  58.44 
 
 
172 aa  186  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  52.15 
 
 
169 aa  167  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2646  flavin reductase-like, FMN-binding  53.7 
 
 
204 aa  166  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  52.15 
 
 
169 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  52.15 
 
 
169 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  52.15 
 
 
169 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  52.15 
 
 
169 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  52.15 
 
 
169 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  52.15 
 
 
169 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  50.92 
 
 
169 aa  164  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  51.52 
 
 
171 aa  163  8e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  51.52 
 
 
171 aa  163  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  51.52 
 
 
171 aa  163  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  51.52 
 
 
171 aa  163  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  51.52 
 
 
171 aa  163  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  51.52 
 
 
171 aa  163  8e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  51.52 
 
 
171 aa  163  8e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0763  putative monooxygenase oxidoreductase protein  55.56 
 
 
191 aa  162  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.205709 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0510  flavin reductase domain-containing protein  50.92 
 
 
174 aa  161  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.094349  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0713  flavin reductase domain protein FMN-binding  53.99 
 
 
192 aa  161  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0114519  normal  0.0515265 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0779  flavin reductase domain protein FMN-binding  53.99 
 
 
192 aa  160  6e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0273259  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  50.92 
 
 
171 aa  160  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  49.08 
 
 
169 aa  159  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0811  flavin reductase-like, FMN-binding  49.44 
 
 
186 aa  158  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0442  flavin reductase domain protein FMN-binding  48.98 
 
 
166 aa  151  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2119  flavin reductase domain-containing protein  47.68 
 
 
322 aa  149  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1792  flavin reductase domain-containing protein  50 
 
 
175 aa  149  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.688973 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1345  flavin reductase-like, FMN-binding  48.67 
 
 
174 aa  144  5e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000569792  hitchhiker  0.00000938161 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0065  flavin reductase-like, FMN-binding  46.75 
 
 
166 aa  144  6e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.99238e-16  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  46.1 
 
 
180 aa  143  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  48.67 
 
 
309 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  46.1 
 
 
180 aa  141  5e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  45.33 
 
 
304 aa  139  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  45.39 
 
 
408 aa  138  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2957  flavin reductase-like, FMN-binding  44.74 
 
 
171 aa  137  7e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  44.67 
 
 
313 aa  135  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3468  flavin reductase-like, FMN-binding  44.9 
 
 
174 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235276  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  44.22 
 
 
172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6306  flavin reductase domain-containing protein  45.27 
 
 
175 aa  130  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.357776 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6010  flavin reductase domain-containing protein  44.59 
 
 
175 aa  129  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3185  flavin reductase domain-containing protein  42.14 
 
 
182 aa  128  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1836  hypothetical protein  41.33 
 
 
183 aa  127  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0567658  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1916  flavin reductase domain-containing protein  48.28 
 
 
166 aa  127  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.751349 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6121  flavin reductase domain-containing protein  42.31 
 
 
311 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272267  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3603  putative oxygenase  42 
 
 
172 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000048428  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7180  flavin reductase-like, FMN-binding  44.59 
 
 
175 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.050322 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2478  flavin reductase domain-containing protein  44.53 
 
 
302 aa  125  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1265  flavin reductase domain-containing protein  49.67 
 
 
166 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.463145 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2607  nitrilotriacetate monooxygenase component B  49.67 
 
 
166 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.396427  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3429  flavin reductase domain-containing protein  48.98 
 
 
172 aa  122  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.316172 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  43.51 
 
 
311 aa  122  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0378  flavin reductase domain-containing protein  44.94 
 
 
168 aa  122  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.557848  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3360  flavin reductase-like, FMN-binding  42.77 
 
 
172 aa  121  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.439324 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.61 
 
 
165 aa  121  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5488  flavin reductase-like, FMN-binding  43.12 
 
 
175 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968149  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6774  flavin reductase domain-containing protein  43.12 
 
 
175 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4835  flavin reductase-like, FMN-binding  41.78 
 
 
186 aa  121  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6362  flavin reductase domain-containing protein  43.12 
 
 
175 aa  121  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.38 
 
 
311 aa  120  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.18 
 
 
311 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.82 
 
 
311 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3822  flavin reductase domain-containing protein  41.06 
 
 
175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.57201 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  40.14 
 
 
170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4664  flavin reductase-like, FMN-binding  41.06 
 
 
191 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2755  flavin reductase domain protein  39.74 
 
 
177 aa  118  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0570474 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3699  flavin reductase domain-containing protein  41.06 
 
 
191 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.927223  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  40.38 
 
 
226 aa  118  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  40.38 
 
 
226 aa  117  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  40.38 
 
 
226 aa  117  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5305  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.18 
 
 
184 aa  117  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0470  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  42.86 
 
 
170 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2411  flavin reductase-like, FMN-binding  41.45 
 
 
182 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2672  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  38.51 
 
 
161 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0580  flavin reductase-like  36.36 
 
 
163 aa  115  3e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00229165  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3318  flavin reductase-like, FMN-binding  40 
 
 
170 aa  115  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000349305  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  41.98 
 
 
306 aa  115  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2406  flavin reductase-like  37.84 
 
 
161 aa  114  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.17627  normal  0.747967 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3017  nitrilotriacetate monooxygenase  39.74 
 
 
172 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3743  flavin reductase domain-containing protein  39.74 
 
 
172 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  36.42 
 
 
179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3647  oxidoreductase, putative  37.16 
 
 
161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0722443  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2283  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.99 
 
 
191 aa  113  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0153986  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38 
 
 
190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2083  flavin reductase domain-containing protein  37.16 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1841  flavin reductase-like, FMN-binding  39.07 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2256  flavin reductase domain-containing protein  37.16 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550172  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2261  flavin reductase domain-containing protein  37.16 
 
 
161 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2261  flavin reductase domain-containing protein  39.19 
 
 
161 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3234  flavin reductase-like, FMN-binding  36.49 
 
 
161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6217  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.71 
 
 
158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>