More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0087 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0054  acetoacetyl-CoA synthetase  75.12 
 
 		 754 aa  643    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0764  acetoacetyl-CoA synthetase  56.03 
 
 		 671 aa  729    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839024  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3179  acetoacetyl-CoA synthetase  79.33 
 
 		 695 aa  1118    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3829  acetoacetyl-CoA synthetase  52.02 
 
 		 657 aa  669    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3963  acetoacetyl-CoA synthetase  68.98 
 
 		 711 aa  994    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.191797  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0120  acetoacetyl-CoA synthetase  71.93 
 
 		 696 aa  1023    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.666374  normal  0.260377 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1970  acetoacetyl-CoA synthetase  47.35 
 
 		 676 aa  659    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129339  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2699  acetoacetyl-CoA synthetase  55.96 
 
 		 669 aa  739    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.329478 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0699  acetoacetyl-CoA synthetase  56.15 
 
 		 684 aa  721    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0880431  normal  0.786479 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1953  acetoacetyl-CoA synthetase  51.87 
 
 		 657 aa  663    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0087  acetoacetyl-CoA synthetase  100 
 
 		 704 aa  1437    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.387097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0107  acetoacetyl-CoA synthetase  70.21 
 
 		 671 aa  974    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.924378  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0655  acetoacetyl-CoA synthetase  55.86 
 
 		 684 aa  724    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0662658 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0074  acetoacetyl-CoA synthetase  77.58 
 
 		 695 aa  1054    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2277  acetoacetyl-CoA synthetase  49.7 
 
 		 667 aa  669    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0119  acetoacetyl-CoA synthetase  78.29 
 
 		 727 aa  1095    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2342  acetoacetyl-CoA synthetase  48.66 
 
 		 660 aa  633  1e-180  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2133  acetoacetyl-CoA synthase  49.25 
 
 		 667 aa  629  1e-179  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.569736  decreased coverage  0.00936242 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2270  acetoacetyl-CoA synthase  50 
 
 		 654 aa  622  1e-177  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0824261 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4014  acetoacetyl-CoA synthase  49.55 
 
 		 667 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0246  acetoacetyl-CoA synthetase  46.54 
 
 		 661 aa  605  1.0000000000000001e-171  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0879  acetoacetyl-CoA synthetase  48.96 
 
 		 664 aa  595  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.361725  normal  0.0726893 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3253  acetoacetyl-CoA synthase  47.09 
 
 		 685 aa  591  1e-167  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4482  acetoacetyl-CoA synthase  46.75 
 
 		 662 aa  588  1e-166  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.984378  normal  0.928665 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1154  acetoacetyl-CoA synthetase  44.61 
 
 		 666 aa  586  1e-166  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.527463  normal  0.586098 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2245  acetoacetyl-CoA synthetase  47.89 
 
 		 654 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115691  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4421  acetoacetyl-CoA synthase  44.4 
 
 		 656 aa  583  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0937  acetoacetyl-CoA synthetase  49.7 
 
 		 665 aa  584  1.0000000000000001e-165  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0788  acetoacetyl-CoA synthase  47.69 
 
 		 645 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4892  acetoacetyl-CoA synthase  46.2 
 
 		 666 aa  570  1e-161  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2192  acetoacetyl-CoA synthetase  45.75 
 
 		 669 aa  563  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3920  acetoacetyl-CoA synthase  43.86 
 
 		 649 aa  561  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1444  acetyl-CoA synthetase  45.52 
 
 		 681 aa  557  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1473  acetoacetyl-CoA synthetase  45.43 
 
 		 637 aa  549  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.598373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1209  acetoacetyl-CoA synthetase  45.12 
 
 		 665 aa  548  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.926672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0152  acetoacetyl-CoA synthase  45.72 
 
 		 651 aa  545  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5085  acetoacetyl-CoA synthetase  44.89 
 
 		 643 aa  544  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293812  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4700  acetoacetyl-CoA synthetase  44.89 
 
 		 643 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4786  acetoacetyl-CoA synthetase  44.89 
 
 		 643 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01880  acetoacetyl-CoA synthase  45.31 
 
 		 673 aa  536  1e-151  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6018  acetoacetyl-CoA synthase  44.36 
 
 		 667 aa  530  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0304  acetoacetyl-CoA synthase  44.46 
 
 		 667 aa  531  1e-149  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5298  acetoacetyl-CoA synthetase  44.14 
 
 		 632 aa  530  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150351 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3504  acetoacetyl-CoA synthetase  44.54 
 
 		 709 aa  528  1e-148  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.315612 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1569  acetoacetyl-CoA synthetase  44.53 
 
 		 664 aa  511  1e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504924  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3863  acetoacetyl-CoA synthase  44.04 
 
 		 669 aa  499  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0556445  normal  0.0884622 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0554  acetoacetyl-CoA synthase  41.32 
 
 		 658 aa  481  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2047  acetoacetyl-CoA synthetase  41.83 
 
 		 651 aa  472  1e-132  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3080  acetoacetyl-CoA synthetase  40.21 
 
 		 651 aa  475  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1610  acetoacetyl-CoA synthase  39.58 
 
 		 651 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.787437  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3297  acetoacetyl-CoA synthetase  41.77 
 
 		 651 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.70953  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1363  acetoacetyl-CoA synthase  41.91 
 
 		 654 aa  472  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0502256  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2028  acetoacetyl-CoA synthetase  41.5 
 
 		 651 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.720983  normal  0.488067 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2108  acetoacetyl-CoA synthetase  42.07 
 
 		 651 aa  469  1.0000000000000001e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.188473 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38690  acetoacetyl-CoA synthetase  41.28 
 
 		 651 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0021  acetoacetyl-CoA synthetase  40.72 
 
 		 662 aa  468  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0177  acetoacetyl-CoA synthetase  40.68 
 
 		 651 aa  468  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.618251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2019  acetoacetyl-CoA synthase  41.31 
 
 		 658 aa  468  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000482159  normal  0.0114668 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0018  acetoacetyl-CoA synthetase  40.72 
 
 		 662 aa  468  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.677245  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1820  acetoacetyl-CoA synthetase  40.18 
 
 		 649 aa  466  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000185409  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1247  acetoacetyl-CoA synthase  40.6 
 
 		 651 aa  469  9.999999999999999e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.916706  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0089  acetoacetyl-CoA synthetase  41.63 
 
 		 662 aa  468  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0848036  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0036  acetoacetyl-CoA synthetase  40.15 
 
 		 662 aa  463  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2653  acetoacetyl-CoA synthetase  42.01 
 
 		 650 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3071  acetoacetyl-CoA synthetase  41.25 
 
 		 650 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.922751  normal  0.501607 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2720  acetoacetyl-CoA synthetase  39.32 
 
 		 653 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.199771  normal  0.0612564 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0168  acetoacetyl-CoA synthetase  40.45 
 
 		 652 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2795  acetoacetyl-CoA synthetase  41.25 
 
 		 652 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0816359  normal  0.10488 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0779  acetoacetyl-CoA synthetase  37.69 
 
 		 650 aa  448  1.0000000000000001e-124  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3695  acetoacetyl-CoA synthetase  40.09 
 
 		 668 aa  444  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506313  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1185  acetoacetyl-CoA synthetase  37.54 
 
 		 650 aa  442  1e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0315  acetoacetyl-CoA synthetase  39.53 
 
 		 650 aa  441  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3889  acetoacetyl-CoA synthase  39.68 
 
 		 653 aa  441  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00052085  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3315  acetoacetyl-CoA synthase  38.52 
 
 		 620 aa  437  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4886  acetoacetyl-CoA synthase  36.18 
 
 		 657 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1794  acetoacetyl-CoA synthetase  37.43 
 
 		 646 aa  430  1e-119  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1795  acetoacetyl-CoA synthetase  37.43 
 
 		 646 aa  429  1e-119  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1658  acetoacetyl-CoA synthetase  40.66 
 
 		 662 aa  428  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1149  acetoacetyl-CoA synthase  39.45 
 
 		 654 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.335784  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0380  acetoacetyl-CoA synthetase  38.54 
 
 		 650 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044282 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0412  acetoacetyl-CoA synthetase  36.47 
 
 		 650 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0370757  hitchhiker  0.0000659795 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1714  acetoacetyl-CoA synthetase  36.56 
 
 		 687 aa  396  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.776218  normal  0.102104 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0406  acetoacetyl-CoA synthetase  34.94 
 
 		 659 aa  375  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000302212  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01103  acetoacetyl-CoA synthase (AFU_orthologue; AFUA_1G11880)  33.84 
 
 		 690 aa  369  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.75348 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4181  acetoacetyl-CoA synthase  34.33 
 
 		 646 aa  368  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.166817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3294  acetoacetyl-CoA synthetase  36.81 
 
 		 676 aa  367  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001479  acetoacetyl-CoA synthetase  34.14 
 
 		 657 aa  363  5.0000000000000005e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.525178  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05420  acetoacetyl-CoA synthetase  34.14 
 
 		 656 aa  360  4e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000409  acetoacetyl-CoA synthetase  33.82 
 
 		 695 aa  358  1.9999999999999998e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0006  acetoacetyl-CoA synthetase  32.39 
 
 		 646 aa  321  3e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.497617  normal  0.392863 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1238  AMP-dependent synthetase and ligase  37.07 
 
 		 568 aa  316  9e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280007 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04900  conserved hypothetical protein  31.52 
 
 		 698 aa  316  9.999999999999999e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.18393  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0916  acetoacetyl-CoA synthase  34.08 
 
 		 971 aa  311  2e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199641  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4720  acetoacetyl-CoA synthase  33.62 
 
 		 1021 aa  310  8e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7003  acetoacetyl-CoA synthase  33.58 
 
 		 1056 aa  308  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01482  acetoacetyl-CoA synthase (AFU_orthologue; AFUA_8G04770)  30.82 
 
 		 698 aa  296  1e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0443  acetoacetyl-CoA synthase  34.03 
 
 		 988 aa  281  4e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.303442  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1441  AMP-dependent synthetase and ligase  29.79 
 
 		 642 aa  255  2.0000000000000002e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.692743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2222  AMP-dependent synthetase and ligase  31.14 
 
 		 641 aa  244  5e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1808  AMP-dependent synthetase and ligase  27.31 
 
 		 646 aa  238  3e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00809823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>