28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0082 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0082  hypothetical protein  100 
 
 
281 aa  569  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5649  hypothetical protein  82.03 
 
 
230 aa  371  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00621516  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01415  hypothetical protein  58.3 
 
 
307 aa  314  9.999999999999999e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.134141  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4573  hypothetical protein  59.19 
 
 
293 aa  312  4.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0767452  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0911  hypothetical protein  56.46 
 
 
300 aa  290  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.442547 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5454  hypothetical protein  47.96 
 
 
289 aa  260  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.806789  normal  0.501577 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2054  hypothetical protein  47.29 
 
 
310 aa  253  4.0000000000000004e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.627069  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6339  hypothetical protein  44.98 
 
 
289 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6554  hypothetical protein  49.59 
 
 
281 aa  236  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0145506  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3270  hypothetical protein  37.59 
 
 
303 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1303  hypothetical protein  39.01 
 
 
300 aa  186  3e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.138879  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0787  hypothetical protein  37.93 
 
 
312 aa  176  5e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.251982  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0508  hypothetical protein  37.64 
 
 
312 aa  175  7e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.647298  normal  0.0833781 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0654  hypothetical protein  37.64 
 
 
312 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.163272  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3139  hypothetical protein  36.5 
 
 
305 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1931  hypothetical protein  37.26 
 
 
306 aa  168  7e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2876  hypothetical protein  35.2 
 
 
287 aa  124  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1285  abortive infection protein AbiGII  29.76 
 
 
281 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4516  hypothetical protein  34.89 
 
 
283 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0557  hypothetical protein  27.91 
 
 
285 aa  102  6e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000428757 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0680  hypothetical protein  26.77 
 
 
278 aa  101  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5578  hypothetical protein  35.82 
 
 
303 aa  91.3  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3734  hypothetical protein  67.86 
 
 
62 aa  85.9  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3282  hypothetical protein  32.46 
 
 
299 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1070  hypothetical protein  31.58 
 
 
299 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11069  hypothetical protein  29.27 
 
 
251 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.204604 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25040  protein of unknown function (DUF1814)  26.05 
 
 
302 aa  51.2  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2937  hypothetical protein  24.47 
 
 
269 aa  48.5  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.283866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>