More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0080 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  100 
 
 
252 aa  499  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0084  ABC transporter related  77.64 
 
 
248 aa  339  2.9999999999999998e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2953  ABC transporter related  69.26 
 
 
258 aa  330  1e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.121974 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0211  ABC transporter related  67.21 
 
 
245 aa  322  5e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3650  ABC transporter-related protein  69.96 
 
 
282 aa  316  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1332  ABC transporter related  64.78 
 
 
255 aa  302  4.0000000000000003e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13455  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1229  ABC transporter-related protein  65.04 
 
 
255 aa  302  4.0000000000000003e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0988028  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3132  ABC transporter related  58.17 
 
 
251 aa  276  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  57.09 
 
 
254 aa  272  3e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4819  ABC transporter related  55.69 
 
 
257 aa  267  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  57.55 
 
 
250 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4747  ABC transporter related  55.82 
 
 
253 aa  265  8e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  57.14 
 
 
250 aa  263  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2769  ABC transporter related  52.61 
 
 
257 aa  261  6.999999999999999e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0502459  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4659  ABC transporter related  55.6 
 
 
252 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3086  ABC transporter related  51.41 
 
 
258 aa  254  8e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.983712  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4368  ABC transporter related  52.38 
 
 
252 aa  248  9e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324003  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  50.2 
 
 
250 aa  240  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  47.58 
 
 
250 aa  235  7e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3640  ABC transporter related  53.06 
 
 
249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  49.2 
 
 
251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  53.41 
 
 
248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  52.05 
 
 
246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.54 
 
 
256 aa  232  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  49 
 
 
251 aa  231  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  50.41 
 
 
594 aa  228  8e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1209  ABC transporter related  53.85 
 
 
250 aa  227  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.714157  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  47.04 
 
 
251 aa  224  9e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  47.98 
 
 
250 aa  224  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1989  ABC transporter related  48 
 
 
249 aa  223  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599945  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2234  ABC transporter related  48.36 
 
 
249 aa  223  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.886454  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  49.39 
 
 
597 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  50.2 
 
 
251 aa  222  4e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  43.95 
 
 
271 aa  217  1e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2527  ABC transporter related  47.79 
 
 
266 aa  217  1e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.727233  normal  0.57543 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3171  ABC transporter-related protein  51.59 
 
 
255 aa  216  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0188228  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3271  ABC transporter related  51.2 
 
 
250 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.910977  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  50.2 
 
 
264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  45.71 
 
 
250 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3461  ABC transporter related  46.61 
 
 
259 aa  210  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  47.13 
 
 
256 aa  209  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4398  ABC transporter related  45.56 
 
 
251 aa  209  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3804  ABC transporter related  47.01 
 
 
267 aa  209  4e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162202  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0662  ABC transporter related  44.58 
 
 
251 aa  208  7e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.289976  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0616  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.58 
 
 
250 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0633  ABC transporter related  49.39 
 
 
251 aa  207  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0656  ABC transporter related  44.58 
 
 
250 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561275  normal  0.139906 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7683  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.63 
 
 
254 aa  206  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  45.75 
 
 
256 aa  206  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5098  ABC transporter related  47.79 
 
 
254 aa  206  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.688998  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0859  ABC transporter related  48.99 
 
 
250 aa  206  4e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240847  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6026  ABC transporter related  45.82 
 
 
259 aa  205  5e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.77 
 
 
250 aa  205  7e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5725  ABC transporter related  45.56 
 
 
255 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6089  ABC transporter related  45.56 
 
 
255 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.589988  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6572  ABC transporter related  45.56 
 
 
255 aa  204  8e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.25899  normal  0.0683418 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1985  ABC transporter related  44.98 
 
 
255 aa  204  8e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.356154  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3828  ABC transporter related  43.65 
 
 
256 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1605  ABC transporter related  46.37 
 
 
256 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4269  ABC transporter related  44.84 
 
 
255 aa  204  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4905  ABC transporter related  43.65 
 
 
256 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3296  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  43.55 
 
 
257 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.119386  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4028  ABC transporter related  43.55 
 
 
257 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4478  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  45.34 
 
 
255 aa  203  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423389  hitchhiker  0.00964914 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0363  ABC transporter related  46.25 
 
 
251 aa  202  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.37 
 
 
250 aa  202  4e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4057  ABC transporter related  44.98 
 
 
254 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0519536  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1320  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.9 
 
 
250 aa  202  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4753  ABC transporter-related protein  45.75 
 
 
257 aa  201  8e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0760  ABC transporter related  46.18 
 
 
273 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  43.6 
 
 
252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  43.9 
 
 
256 aa  199  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  43.9 
 
 
256 aa  199  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0178  ABC transporter related  48.58 
 
 
249 aa  199  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2947  ABC transporter related  46.34 
 
 
233 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.921249  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  45.2 
 
 
249 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1288  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  46.34 
 
 
233 aa  199  5e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4205  ABC transporter related  44.58 
 
 
254 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2849  ABC transporter related protein  45.27 
 
 
247 aa  199  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.485647  normal  0.511604 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1801  ABC transporter related  47.41 
 
 
253 aa  198  6e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.627304  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1373  ABC transporter related  43.37 
 
 
254 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  42.8 
 
 
859 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2718  ABC transporter related  46.75 
 
 
233 aa  197  9e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.743331  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3304  ABC transporter component  43.43 
 
 
250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1791  ABC transporter related  47.81 
 
 
253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1584  ABC transporter related  43.72 
 
 
255 aa  196  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4883  ABC transporter related  44.18 
 
 
254 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0839  ABC transporter related  43.5 
 
 
246 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6728  ABC transporter related  42 
 
 
260 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2451  ABC transporter related  42.21 
 
 
257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4998  ABC transporter related  43.09 
 
 
250 aa  195  6e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101708  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2064  ABC transporter related  43.6 
 
 
260 aa  195  7e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  43.37 
 
 
842 aa  195  7e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0954  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.48 
 
 
271 aa  194  8.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276985  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4056  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  46.09 
 
 
256 aa  194  9e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2865  ABC transporter related  43.55 
 
 
261 aa  194  9e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5822  ABC transporter related  42.4 
 
 
260 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.545268  normal  0.0926857 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1362  ABC transporter related  43.62 
 
 
251 aa  193  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3869  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.31 
 
 
256 aa  193  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2815  ABC transporter related  44.9 
 
 
250 aa  193  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454528  normal  0.076686 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>