More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0077 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0077  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 387 aa  798    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0087  Extracellular ligand-binding receptor  80.11 
 
 		 394 aa  587  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0214  extracellular ligand-binding receptor  72.97 
 
 		 393 aa  565  1e-160  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.486026  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3653  extracellular ligand-binding receptor  73.3 
 
 		 390 aa  561  1.0000000000000001e-159  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2950  extracellular ligand-binding receptor  74.86 
 
 		 387 aa  559  1e-158  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1622  extracellular ligand-binding receptor  68.94 
 
 		 389 aa  539  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4744  extracellular ligand-binding receptor  66.67 
 
 		 390 aa  531  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1779  extracellular ligand-binding receptor  69.04 
 
 		 392 aa  530  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205301 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1329  extracellular ligand-binding receptor  65.7 
 
 		 395 aa  522  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1226  extracellular ligand-binding receptor  64.34 
 
 		 397 aa  514  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15047  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2772  extracellular ligand-binding receptor  64.77 
 
 		 390 aa  506  9.999999999999999e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000645997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3089  Extracellular ligand-binding receptor  64.46 
 
 		 390 aa  491  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3135  Extracellular ligand-binding receptor  62.4 
 
 		 395 aa  481  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4035  plasmid encoded RepA protein  60.42 
 
 		 406 aa  461  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2984  twin-arginine translocation pathway signal  60.22 
 
 		 395 aa  461  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808904  normal  0.464937 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1907  extracellular ligand-binding receptor  59.23 
 
 		 395 aa  456  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.780883 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4371  twin-arginine translocation pathway signal  58.45 
 
 		 402 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.392335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4662  twin-arginine translocation pathway signal  58.45 
 
 		 402 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4822  extracellular ligand-binding receptor  57.3 
 
 		 395 aa  439  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.623024  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1017  twin-arginine translocation pathway signal  51.45 
 
 		 392 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0735  Extracellular ligand-binding receptor  52.8 
 
 		 392 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2689  Extracellular ligand-binding receptor  37.5 
 
 		 395 aa  237  3e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000331787  normal  0.185218 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2686  putative ABC transporter substrate binding protein  35.79 
 
 		 390 aa  227  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192979  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3998  extracellular ligand-binding receptor  35.73 
 
 		 389 aa  226  4e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0350284  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2302  Extracellular ligand-binding receptor  34.16 
 
 		 410 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4181  Extracellular ligand-binding receptor  34.22 
 
 		 412 aa  213  3.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3174  extracellular ligand-binding receptor  34.32 
 
 		 399 aa  208  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0541097  normal  0.740982 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3643  response regulator receiver protein  37.31 
 
 		 396 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0732  hypothetical protein  33.24 
 
 		 390 aa  207  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4043  extracellular ligand-binding receptor  32.29 
 
 		 388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1987  extracellular ligand-binding receptor  33.15 
 
 		 389 aa  200  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.378551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0366  Extracellular ligand-binding receptor  34.2 
 
 		 401 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1212  Extracellular ligand-binding receptor  37.98 
 
 		 398 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.787629  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2120  Extracellular ligand-binding receptor  34.26 
 
 		 389 aa  196  5.000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.671824 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0994  extracellular ligand-binding receptor  30.94 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000312387 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0631  Extracellular ligand-binding receptor  33.72 
 
 		 390 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5126  extracellular ligand-binding receptor  30.98 
 
 		 388 aa  189  8e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0794  extracellular ligand-binding receptor  37.05 
 
 		 386 aa  187  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4610  extracellular ligand-binding receptor  31.84 
 
 		 389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0193  extracellular ligand-binding receptor  33.88 
 
 		 414 aa  184  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2846  Extracellular ligand-binding receptor  34.32 
 
 		 400 aa  183  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.530964 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5379  Extracellular ligand-binding receptor  32.44 
 
 		 395 aa  182  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4211  extracellular ligand-binding receptor  32.1 
 
 		 379 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0456551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4488  extracellular ligand-binding receptor  33.43 
 
 		 391 aa  181  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2460  extracellular ligand-binding receptor  33.7 
 
 		 390 aa  179  5.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0862  extracellular ligand-binding receptor  31.71 
 
 		 379 aa  179  8e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284446  normal  0.223955 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0641  Extracellular ligand-binding receptor  31.04 
 
 		 389 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.474288  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3830  Extracellular ligand-binding receptor  32.43 
 
 		 390 aa  178  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3268  hypothetical protein  35.61 
 
 		 387 aa  177  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.781038 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4395  extracellular ligand-binding receptor  30.59 
 
 		 395 aa  172  7.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1747  Extracellular ligand-binding receptor  33.85 
 
 		 391 aa  163  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.877738  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4401  extracellular ligand-binding receptor  29.83 
 
 		 407 aa  162  9e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.933784  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6211  extracellular ligand-binding receptor  29.59 
 
 		 413 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0159  extracellular ligand-binding receptor  31.09 
 
 		 395 aa  161  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4559  Extracellular ligand-binding receptor  32.13 
 
 		 392 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0288  extracellular ligand-binding receptor  31.62 
 
 		 390 aa  157  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2730  extracellular ligand-binding receptor  32.7 
 
 		 390 aa  157  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0102883  hitchhiker  0.00729362 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0986  extracellular ligand-binding receptor  34.53 
 
 		 399 aa  156  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.763691  unclonable  0.00000240352 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5150  extracellular ligand-binding receptor  31.58 
 
 		 397 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.156171 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1586  twin-arginine translocation pathway signal  32.58 
 
 		 392 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2237  extracellular ligand-binding receptor  30.62 
 
 		 376 aa  153  5e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.246635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1579  extracellular ligand-binding receptor  32.07 
 
 		 392 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.409097 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3384  extracellular ligand-binding receptor  31.62 
 
 		 390 aa  152  8e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3183  Extracellular ligand-binding receptor  32.42 
 
 		 390 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.596586 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2056  Extracellular ligand-binding receptor  31.61 
 
 		 388 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3688  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  29.84 
 
 		 399 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00171007  normal  0.751271 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2449  Extracellular ligand-binding receptor  31.61 
 
 		 388 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5707  branched-chain amino acid ABC transporter  31.78 
 
 		 392 aa  150  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0701  extracellular ligand-binding receptor  32.13 
 
 		 423 aa  149  7e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161591  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0175  putative ABC transporter binding protein  28.21 
 
 		 393 aa  149  8e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.673441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  28.53 
 
 		 390 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4136  Extracellular ligand-binding receptor  31.3 
 
 		 399 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.831108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5095  ABC transporter substrate binding protei  30.18 
 
 		 381 aa  147  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.263393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3317  Extracellular ligand-binding receptor  29.86 
 
 		 401 aa  147  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0610  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  31.98 
 
 		 390 aa  147  4.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.110277  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  29.64 
 
 		 384 aa  146  6e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3475  Extracellular ligand-binding receptor  32.39 
 
 		 390 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4775  putative ABC transporter substrate binding protein  32.18 
 
 		 393 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00131883  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0759  extracellular ligand-binding receptor  30.91 
 
 		 426 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.561575  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0648  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  31.71 
 
 		 390 aa  144  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3730  extracellular ligand-binding receptor  31.42 
 
 		 390 aa  144  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1177  Extracellular ligand-binding receptor  29.89 
 
 		 390 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4217  extracellular ligand-binding receptor  30.28 
 
 		 390 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2270  extracellular ligand-binding receptor  30.89 
 
 		 391 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.733577  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4017  extracellular ligand-binding receptor  30.92 
 
 		 391 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2244  substrate-binding periplasmic ABC transporter protein  30.66 
 
 		 392 aa  138  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.219706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1365  extracellular ligand-binding receptor  27.7 
 
 		 392 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4528  extracellular ligand-binding receptor  29.25 
 
 		 413 aa  134  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5444  ABC transporter substrate binding protein (branched amino acid)  29.89 
 
 		 406 aa  129  7.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5038  extracellular ligand-binding receptor  27.95 
 
 		 398 aa  125  9e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0851  extracellular ligand-binding receptor  26.81 
 
 		 396 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.532444  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5186  Extracellular ligand-binding receptor  29.33 
 
 		 425 aa  120  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1208  extracellular ligand-binding receptor  25.71 
 
 		 396 aa  119  9e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0417  extracellular ligand-binding receptor  30.35 
 
 		 393 aa  117  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0821  Extracellular ligand-binding receptor  29.07 
 
 		 368 aa  115  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4821  putative ABC transport system, periplasmic substrate-binding protein  27.45 
 
 		 416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.675554 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  26.53 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  27.25 
 
 		 419 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1392  extracellular ligand-binding receptor  26.91 
 
 		 386 aa  107  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>