More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0072 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_0095  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  75.4 
 
 
428 aa  678  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0734  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  74.19 
 
 
424 aa  665  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.197929  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0072  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  100 
 
 
439 aa  906  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.860838  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1630  benzoyl-CoA oxygenase, component A  68.41 
 
 
426 aa  626  1e-178  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170592  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2942  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  69.7 
 
 
427 aa  624  1e-177  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.453854  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3661  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  67.49 
 
 
431 aa  615  1e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0222  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  70.14 
 
 
423 aa  607  1e-172  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1424  benzoyl-CoA oxygenase, component A  63.26 
 
 
413 aa  554  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2694  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  62.33 
 
 
413 aa  548  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0890  benzoyl-CoA oxygenase, component A  61.4 
 
 
414 aa  547  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.48377 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1538  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  61.86 
 
 
416 aa  539  1e-152  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1323  benzoyl-CoA oxygenase, component A  58.84 
 
 
417 aa  518  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1220  benzoyl-CoA oxygenase subunit A  57.44 
 
 
415 aa  503  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.655891  normal  0.0139439 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6638  benzoyl-CoA oxygenase, component A  51.05 
 
 
393 aa  428  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297273  normal  0.0982181 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1086  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  38.14 
 
 
370 aa  202  1e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.569863  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11651  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  38.14 
 
 
384 aa  202  1e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11821  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  38.14 
 
 
321 aa  201  2e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.140856  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11811  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  37.8 
 
 
326 aa  197  3e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11131  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  33.24 
 
 
361 aa  191  3e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.93922 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0675  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  36.18 
 
 
381 aa  189  8e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15081  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  36.18 
 
 
387 aa  189  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.459762  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09411  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  34.88 
 
 
366 aa  186  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0946789 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1917  ferredoxin--NADP reductase (FNR)  36.64 
 
 
396 aa  181  2e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.484005  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0749  ferredoxin--NADP reductase (FNR)  34.37 
 
 
398 aa  180  4e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.14944  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3658  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  36.08 
 
 
405 aa  180  4e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108889  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5201  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.64 
 
 
403 aa  176  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86768e-21 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0782  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  32.19 
 
 
440 aa  174  3e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00024869  unclonable  7.85266e-08 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5047  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.6 
 
 
400 aa  172  8e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0978  ferredoxin-NADP oxidoreductase  33.9 
 
 
403 aa  171  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  2.02848e-06  normal  0.0244193 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2543  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.59 
 
 
406 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3563  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.59 
 
 
406 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4840  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  31.01 
 
 
439 aa  157  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00169429  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_23717  predicted protein  31.29 
 
 
340 aa  149  9e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.239668  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28333  predicted protein  32.88 
 
 
360 aa  141  3e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0642636  normal  0.462802 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_42018  predicted protein  33.01 
 
 
320 aa  139  7e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.953925  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15777  predicted protein  35.64 
 
 
299 aa  137  3e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.112856  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12813  predicted protein  33.45 
 
 
298 aa  137  3e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0992  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  29.8 
 
 
245 aa  93.2  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0107588 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2921  NADPH-cytochrome P450 reductase  35.33 
 
 
1065 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2981  NADPH-cytochrome P450 reductase  35.33 
 
 
1065 aa  89.7  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.313998  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2936  cytochrome P450  34.78 
 
 
1065 aa  89.7  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.807105  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3239  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  35.33 
 
 
1065 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2720  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.92 
 
 
588 aa  89.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.893392  unclonable  7.26752e-11 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3121  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha component  31.92 
 
 
588 aa  89.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.500128  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2016  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  34.78 
 
 
1065 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3231  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  33.18 
 
 
1006 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3229  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  35.33 
 
 
1065 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3221  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  35.33 
 
 
1065 aa  88.2  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2194  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.91 
 
 
595 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.194055  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2993  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  35.33 
 
 
1065 aa  88.2  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5020  molybdopterin oxidoreductase  35.19 
 
 
1396 aa  86.7  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2236  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.48 
 
 
595 aa  84.3  4e-15  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.680816  normal  0.170477 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3159  sulfite reductase subunit alpha  33.48 
 
 
599 aa  84.3  4e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.87087  normal  0.534662 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2512  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.48 
 
 
595 aa  83.6  6e-15  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.49097  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0827  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  34.06 
 
 
607 aa  83.6  7e-15  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3250  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  34.24 
 
 
1065 aa  83.6  7e-15  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.95935  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3365  sulfite reductase subunit alpha  33.04 
 
 
609 aa  83.2  8e-15  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.834699  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3748  sulfite reductase  34.5 
 
 
540 aa  83.2  8e-15  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0682  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  35.81 
 
 
613 aa  82.8  1e-14  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0858  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.62 
 
 
605 aa  82  2e-14  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3260  sulfite reductase subunit alpha  33.48 
 
 
599 aa  81.6  2e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.25406 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3056  FAD-binding domain protein  34.8 
 
 
554 aa  82  2e-14  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0948  sulfite reductase subunit alpha  33.48 
 
 
599 aa  81.6  3e-14  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.404353 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0810  sulfite reductase subunit alpha  32.9 
 
 
599 aa  81.6  3e-14  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0924  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  33.48 
 
 
599 aa  81.6  3e-14  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3807  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.98 
 
 
591 aa  81.3  3e-14  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0251884 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0546  molybdopterin oxidoreductase  33.47 
 
 
1409 aa  81.6  3e-14  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3066  sulfite reductase subunit alpha  33.48 
 
 
599 aa  81.6  3e-14  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.944096  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3227  sulfite reductase subunit alpha  33.04 
 
 
601 aa  80.9  5e-14  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000595634  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4018  sulfite reductase subunit alpha  33.04 
 
 
599 aa  80.5  5e-14  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.104123  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3111  sulfite reductase subunit alpha  33.04 
 
 
599 aa  80.5  5e-14  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3527  sulfite reductase subunit alpha  32.61 
 
 
609 aa  80.5  6e-14  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.400097  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4136  sulfite reductase  34.06 
 
 
535 aa  80.1  7e-14  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1395  molybdopterin oxidoreductase  34.8 
 
 
1384 aa  79.7  8e-14  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427794  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2892  sulfite reductase subunit alpha  33.04 
 
 
599 aa  79.7  9e-14  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2904  sulfite reductase subunit alpha  33.04 
 
 
599 aa  79.7  9e-14  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02609  sulfite reductase, alpha subunit, flavoprotein  33.04 
 
 
599 aa  79.7  9e-14  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02572  hypothetical protein  33.04 
 
 
599 aa  79.7  9e-14  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3934  molybdopterin oxidoreductase  35.27 
 
 
1397 aa  79.7  1e-13  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0590  sulphite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  36.36 
 
 
613 aa  79  1e-13  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.257613  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2733  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  34.62 
 
 
584 aa  79.3  1e-13  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.461724  hitchhiker  3.24313e-06 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1346  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  34.53 
 
 
1395 aa  79.3  1e-13  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.635163 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3078  sulfite reductase subunit alpha  33.04 
 
 
599 aa  79.3  1e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.282259  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3102  sulfite reductase subunit alpha  33.04 
 
 
599 aa  79.3  1e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271703  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3143  sulfite reductase subunit alpha  33.04 
 
 
599 aa  79.7  1e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.49504  normal  0.285573 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1803  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.53 
 
 
593 aa  79  1e-13  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.336845  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2866  sulfite reductase  34.67 
 
 
537 aa  79  2e-13  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0890512  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2298  sulfite reductase  34.67 
 
 
534 aa  79  2e-13  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.253537  normal  0.965047 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4398  molybdopterin oxidoreductase  36.18 
 
 
1397 aa  78.6  2e-13  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0909646  normal  0.0233897 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1753  sulfite reductase  34.5 
 
 
539 aa  77.8  3e-13  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274813  normal  0.0164644 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02133  sulfite reductase  36.12 
 
 
615 aa  78.2  3e-13  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.887727  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1172  nitrate reductase  34.98 
 
 
1427 aa  78.2  3e-13  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0614569  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1331  molybdopterin oxidoreductase  36.7 
 
 
1342 aa  77.4  4e-13  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0643917 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1784  sulfite reductase  32.2 
 
 
526 aa  77.4  4e-13  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1784  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.52 
 
 
589 aa  77.8  4e-13  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.108282 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_44507  predicted protein  30.57 
 
 
563 aa  77.4  4e-13  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5007  sulfite reductase  33.33 
 
 
535 aa  77.4  5e-13  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.125173  normal  0.198772 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3080  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  32.51 
 
 
604 aa  77.4  5e-13  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274835  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4796  cytochrome P450  35.12 
 
 
1074 aa  77  6e-13  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1381  molybdopterin oxidoreductase  35.96 
 
 
1232 aa  77  6e-13  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>