172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0071 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0071  aspartate racemase  100 
 
 		 253 aa  493  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.937931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3108  aspartate racemase  55.6 
 
 		 259 aa  259  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4736  aspartate racemase  57.08 
 
 		 246 aa  259  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2001  aspartate racemase  54.27 
 
 		 251 aa  246  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1547  aspartate racemase  54.19 
 
 		 245 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1663  aspartate racemase  54.2 
 
 		 254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.977225  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0308  aspartate racemase  28.94 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1090  aspartate racemase  30.05 
 
 		 239 aa  102  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0452  aspartate racemase  32.09 
 
 		 226 aa  101  1e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00000396457  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1511  aspartate racemase  30.21 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.071584  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4701  aspartate racemase  37.45 
 
 		 233 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0254125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1573  aspartate racemase  30.84 
 
 		 236 aa  98.2  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0521541  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4590  aspartate racemase  35.66 
 
 		 301 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0144088  normal  0.0378027 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1302  aspartate racemase  37.74 
 
 		 241 aa  97.8  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00152087  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4841  aspartate racemase  33.19 
 
 		 244 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4912  aspartate racemase  33.19 
 
 		 244 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.902486  normal  0.107391 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4865  aspartate racemase  33.19 
 
 		 244 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.629158  normal  0.603958 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3504  aspartate racemase  35.17 
 
 		 233 aa  95.9  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4914  aspartate racemase  33.19 
 
 		 244 aa  95.9  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4766  aspartate racemase  33.19 
 
 		 244 aa  95.9  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.782175 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3987  aspartate racemase  34.75 
 
 		 233 aa  95.9  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767014  normal  0.191158 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2004  aspartate racemase  28.45 
 
 		 237 aa  95.1  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.272891  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0629  aspartate racemase  28.51 
 
 		 244 aa  94.7  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.578464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2418  aspartate racemase  31.01 
 
 		 254 aa  93.2  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.790687  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2531  aspartate racemase  27.68 
 
 		 240 aa  92.8  4e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5991  aspartate racemase  34.33 
 
 		 233 aa  93.2  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1048  aspartate racemase  30.34 
 
 		 233 aa  92.4  7e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.688459  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0465  aspartate racemase  29.65 
 
 		 242 aa  92  9e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3003  aspartate racemase  32.8 
 
 		 518 aa  90.5  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.145787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4295  aspartate racemase  35.27 
 
 		 250 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.467897  normal  0.0102162 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1720  aspartate racemase  35.17 
 
 		 233 aa  88.2  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.377946  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2741  aspartate racemase  35.93 
 
 		 236 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1034  aspartate racemase  28.15 
 
 		 232 aa  87.8  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00115826  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1378  aspartate racemase  29.3 
 
 		 238 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.438637  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5944  aspartate racemase  30.89 
 
 		 489 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.843392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1778  aspartate racemase  29.3 
 
 		 238 aa  86.3  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6217  aspartate racemase  29.88 
 
 		 484 aa  86.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6736  aspartate racemase  30.17 
 
 		 497 aa  85.5  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.973623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1263  aspartate racemase  29.15 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00631674  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5339  aspartate racemase  30.83 
 
 		 487 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302098  normal  0.0375198 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1405  aspartate racemase  31.36 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2731  aspartate racemase  29.05 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0917762  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1731  aspartate racemase  31.54 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0565132  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3181  aspartate racemase  32.72 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.405773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4384  aspartate racemase  31.6 
 
 		 241 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1886  aspartate racemase  32.49 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0282  aspartate racemase  26.82 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1803  aspartate racemase  30.13 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0021  aspartate racemase  26.11 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0279038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2161  aspartate racemase  27.6 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.779512  normal  0.822901 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5638  aspartate racemase  29.91 
 
 		 499 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.635745  normal  0.372877 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5934  aspartate racemase  28.38 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137693  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2143  aspartate racemase  28.38 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.578734  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4503  aspartate racemase  25.74 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1732  aspartate racemase  26.69 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000037531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2506  aspartate racemase  26.01 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2180  aspartate racemase  27.15 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4895  aspartate racemase family protein  23.73 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0053  aspartate racemase  32.35 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2053  aspartate racemase  26.79 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4873  probable amino-acid racemase  25 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1127  aspartate racemase  28.44 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.10247  normal  0.372995 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2497  aspartate racemase  23.18 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0870  aspartate racemase  21.86 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0325955  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4485  aspartate racemase  24.58 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4865  aspartate racemase family protein  24.47 
 
 		 224 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4650  aspartate racemase family protein  25 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5005  aspartate racemase family protein  25 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1530  aspartate racemase  27.1 
 
 		 232 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.204202 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3426  aspartate racemase  23.83 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4889  probable amino-acid racemase  24.26 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2599  aspartate racemase  26.64 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577714  normal  0.0780411 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4583  aspartate racemase  23.73 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3404  aspartate racemase  26.91 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.568997 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0972  aspartate racemase  26.48 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000098  aspartate racemase  24.79 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.220289  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0374  probable amino-acid racemase  24.12 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2253  aspartate racemase family protein  26.09 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.159416  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1468  aspartate racemase  25.21 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.283507  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3286  putative racemase  32.14 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.989342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2728  hypothetical protein  31.39 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.881231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1262  aspartate racemase  25.11 
 
 		 231 aa  57  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.399281  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2977  aspartate racemase  28.05 
 
 		 246 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85375  normal  0.0977004 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1970  aspartate racemase  26.24 
 
 		 239 aa  57  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298402  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5449  aspartate racemase  26.67 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2205  aspartate racemase family protein  25.74 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2335  aspartate racemase family protein  21.97 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.209175  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0080  aspartate racemase, putative  21.58 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.28039  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0120  aspartate racemase, putative  21.58 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0734  aspartate racemase  26.49 
 
 		 227 aa  55.1  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000319838  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2048  aspartate racemase  21.92 
 
 		 232 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00935047  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2067  aspartate racemase family protein  20.18 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2223  aspartate racemase family protein  20.18 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3120  aspartate racemase family protein  26.28 
 
 		 231 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.755099  hitchhiker  0.0000148082 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4003  putative aspartate racemase  25.7 
 
 		 242 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3160  aspartate racemase  27.27 
 
 		 236 aa  53.5  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000632506  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02688  predicted racemase  29.1 
 
 		 230 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0850  aspartate racemase  29.1 
 
 		 230 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3023  putative racemase  29.1 
 
 		 230 aa  53.1  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4108  putative racemase  29.1 
 
 		 230 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000397336 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>