20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0054 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0054  cytochrome c, class I  100 
 
 		 115 aa  223  5.0000000000000005e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0034  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorB  81.4 
 
 		 109 aa  147  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.551832  normal  0.0979537 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3017  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorB  61.54 
 
 		 107 aa  103  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.526573 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4217  hypothetical protein  52.75 
 
 		 120 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0188082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2727  putative cytochrome c protein  53.66 
 
 		 113 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1286  cytochrome c class I  55.36 
 
 		 701 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.277764 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1510  cytochrome c class I  60.53 
 
 		 174 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5965  putative cytochrome c like protein  35.64 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2513  cytochrome c family protein  33.75 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4247  hypothetical protein  39.47 
 
 		 165 aa  43.9  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.803221  normal  0.4086 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1827  cytochrome c class I  35.63 
 
 		 280 aa  42.7  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1845  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  36.14 
 
 		 349 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1779  cytochrome c, class I  33.78 
 
 		 214 aa  42  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0282319 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1651  hypothetical protein  34.33 
 
 		 109 aa  41.6  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1153  cytochrome c family protein  33.78 
 
 		 218 aa  42  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1587  hypothetical protein  28.57 
 
 		 291 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0317  cytochrome c, class I  36 
 
 		 285 aa  41.6  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00320646 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2358  cytochrome c, class I  34.21 
 
 		 217 aa  40.8  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  35.87 
 
 		 344 aa  40.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1406  hypothetical protein  28.57 
 
 		 291 aa  40  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>