More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0043 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0043  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 257 aa  506  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1602  IclR family transcriptional regulator  44.66 
 
 		 270 aa  205  7e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4440  regulatory protein IclR  35.1 
 
 		 276 aa  149  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3948  IclR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 288 aa  144  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.026727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6293  IclR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 261 aa  142  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2518  regulatory proteins, IclR  35.12 
 
 		 289 aa  139  6e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2404  regulatory proteins, IclR  36.18 
 
 		 275 aa  138  7.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187611  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2525  transcriptional regulator, IclR family  33.88 
 
 		 279 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2369  IclR family transcriptional regulator  34 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4726  IclR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 300 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3637  IclR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 300 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792944  normal  0.338947 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2336  regulatory proteins, IclR  33.47 
 
 		 279 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.477637  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3204  IclR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 275 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3542  IclR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 295 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0890  IclR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 304 aa  133  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0840  IclR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 271 aa  133  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0889831 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5378  IclR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 295 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.60703 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5934  regulatory protein, IclR  33.2 
 
 		 266 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5057  IclR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 292 aa  132  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.864293  normal  0.0584294 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1440  regulatory protein IclR  37.96 
 
 		 282 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21696  hitchhiker  0.00000381695 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3889  IclR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 272 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3080  transcriptional regulator, IclR family  32.81 
 
 		 281 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3613  IclR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4432  transcriptional regulator, IclR family  34.96 
 
 		 292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.560872  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0751  IclR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0309  transcriptional regulator, IclR family  31.35 
 
 		 286 aa  125  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6503  IclR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6631  IclR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 281 aa  123  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000095727  normal  0.978308 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6282  regulatory protein, IclR  37.29 
 
 		 255 aa  118  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302936  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0650  transcriptional regulator, IclR family  33.04 
 
 		 263 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0492  IclR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 302 aa  115  7.999999999999999e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3321  transcriptional regulator, IclR family  32.74 
 
 		 289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0186986  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3646  regulatory proteins, IclR  32.81 
 
 		 290 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.146273 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4894  regulatory proteins, IclR  33.19 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3971  IclR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 301 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.306814 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4262  IclR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 269 aa  112  6e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647357 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4627  regulatory protein, IclR  33.05 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4612  IclR family transcriptional regulator family  33.9 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  27.76 
 
 		 249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8145  transcriptional regulator IclR family  31.88 
 
 		 271 aa  108  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.122254  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 249 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 249 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2715  IclR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 249 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 249 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2997  transcriptional regulator, IclR family  26.94 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000293237  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  27.35 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2734  IclR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 249 aa  106  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.16584e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4818  regulatory proteins, IclR  38.7 
 
 		 279 aa  105  8e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.189718  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2248  transcriptional regulator, IclR family  26.53 
 
 		 249 aa  103  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.000278056 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2324  regulatory protein IclR  26.32 
 
 		 250 aa  102  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0258  IclR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 259 aa  102  9e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0905  regulatory proteins, IclR  32.79 
 
 		 241 aa  95.5  7e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.712353  normal  0.790003 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4127  IclR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 273 aa  95.1  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0121119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 255 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 255 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 255 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 255 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 255 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 255 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1795  IclR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 271 aa  91.3  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0248874  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6076  transcriptional regulator, IclR family  32.43 
 
 		 286 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 268 aa  89.7  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2805  regulatory protein IclR  38.73 
 
 		 302 aa  87.8  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 273 aa  88.2  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3835  transcriptional regulator, IclR family  31.58 
 
 		 271 aa  86.7  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.790714  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0796  IclR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 268 aa  86.7  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 283 aa  86.3  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  27.35 
 
 		 256 aa  85.5  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4820  transcriptional regulator, IclR family  34.14 
 
 		 279 aa  85.5  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 276 aa  85.1  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4007  regulatory proteins, IclR  28.76 
 
 		 284 aa  84  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.556635  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5383  IclR family transcriptional regulator family  32.13 
 
 		 268 aa  83.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3345  regulatory protein, IclR  27.76 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  30.64 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  27.13 
 
 		 261 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  26.72 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  29.46 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5473  regulatory protein IclR  28.74 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3208  IclR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.129719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2670  transcriptional regulator, IclR family  23.69 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6634  IclR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 283 aa  79  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0992864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26680  transcriptional regulator  29.02 
 
 		 270 aa  79  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0674048  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  31.15 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  25.4 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  26.69 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8178  Transcriptional regulator  24.69 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0340255  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0481  transcriptional regulator IclR  31.3 
 
 		 284 aa  78.2  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1099  transcriptional regulator, IclR family  31.97 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.544817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  25.2 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2270  transcriptional regulator, IclR family  29.41 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  28.07 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  29.18 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0549  DNA-binding transcriptional repressor AllR  27.98 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00461  hypothetical protein  27.98 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3326  transcriptional regulator, IclR family  30.56 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.021393  hitchhiker  0.00795692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>