16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0023 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0023  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  363  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0015  protein of unknown function DUF1520  52.34 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0017  hypothetical protein  43.72 
 
 		 189 aa  105  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.343432 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0011  hypothetical protein  40.74 
 
 		 181 aa  97.8  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00169291  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0007  hypothetical protein  48.65 
 
 		 209 aa  96.3  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.906518 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0025  protein of unknown function DUF1520  47.75 
 
 		 209 aa  95.1  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0029  hypothetical protein  56.84 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0024  hypothetical protein  47.24 
 
 		 187 aa  92.4  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1386  hypothetical protein  40.45 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000111197  normal  0.104164 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4985  hypothetical protein  38.83 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1776  hypothetical protein  32.35 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.073575  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0921  hypothetical protein  27.67 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4587  hypothetical protein  31.31 
 
 		 199 aa  43.9  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0375188  normal  0.913544 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2943  hypothetical protein  27.67 
 
 		 152 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0257  hypothetical protein  29.84 
 
 		 179 aa  41.6  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.821198 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0739  hypothetical protein  28 
 
 		 183 aa  41.2  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.371354  normal  0.125366 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>