26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0014 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0014  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  355  1.9999999999999998e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0006  protein of unknown function UPF0153  70.68 
 
 		 137 aa  209  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4149  hypothetical protein  69.92 
 
 		 137 aa  207  7e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0008  hypothetical protein  70.54 
 
 		 142 aa  197  5e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3618  hypothetical protein  56 
 
 		 155 aa  159  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0357  hypothetical protein  55.2 
 
 		 137 aa  154  8e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0351  hypothetical protein  52.8 
 
 		 137 aa  152  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0348  hypothetical protein  53.54 
 
 		 145 aa  151  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.908167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3669  hypothetical protein  53.6 
 
 		 137 aa  151  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0504  hypothetical protein  56.1 
 
 		 131 aa  151  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5042  hypothetical protein  50.76 
 
 		 165 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3109  hypothetical protein  60.68 
 
 		 119 aa  147  5e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63680  hypothetical protein  54.4 
 
 		 164 aa  147  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0265426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5536  hypothetical protein  54.4 
 
 		 130 aa  147  8e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4916  hypothetical protein  52.03 
 
 		 134 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5092  hypothetical protein  52.03 
 
 		 134 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.637088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0467  hypothetical protein  50.39 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0421  hypothetical protein  52.03 
 
 		 134 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.887447 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45660  hypothetical protein  49.19 
 
 		 134 aa  135  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4354  Fe-S-cluster oxidoreductase  57.14 
 
 		 108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0830  protein of unknown function UPF0153  30.39 
 
 		 166 aa  50.1  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0729  hypothetical protein  28.28 
 
 		 127 aa  43.9  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121863  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0146  hypothetical protein  26.61 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0057515  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1308  protein of unknown function UPF0153  30.39 
 
 		 126 aa  41.6  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0836472  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1546  hypothetical protein  45.71 
 
 		 229 aa  41.2  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.231581  hitchhiker  0.0000778031 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3525  protein of unknown function UPF0153  25.62 
 
 		 276 aa  40.8  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>