38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET_tRNA-Glu-1 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET_tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.068843  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0033  tRNA-Glu  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000114551  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_895  tRNA-Glu  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000162495  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0005  tRNA-Glu  85.71 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0033  tRNA-Glu  89.29 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0516198  hitchhiker  0.000000402532 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0012  tRNA-Glu  85.92 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0050  tRNA-Glu  85.92 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.199689  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0018  tRNA-Glu  85.92 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0023  tRNA-Glu  87.72 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000000272439  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0047  tRNA-Glu  87.72 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00511598  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0014  tRNA-Glu  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807422  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0012  tRNA-Glu  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.418114  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0019  tRNA-Glu  88.14 
 
 
73 bp  54  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0023  tRNA-Glu  88.14 
 
 
73 bp  54  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.294422  unclonable  0.0000000304821 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0022  tRNA-Glu  88.14 
 
 
73 bp  54  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.572486  hitchhiker  0.00000059439 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0024  tRNA-Glu  88.14 
 
 
73 bp  54  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.229893  normal  0.201113 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0023  tRNA-Glu  88.14 
 
 
73 bp  54  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0770759  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0044  tRNA-Glu  88.14 
 
 
73 bp  54  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.424597 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18590  tRNA-Glu  86.89 
 
 
73 bp  50.1  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.2903  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18600  tRNA-Glu  86.89 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204503  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0003  tRNA-Glu  85.71 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0763147  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0057  tRNA-Glu  85.71 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0065  tRNA-Glu  86.44 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0045  tRNA-Glu  93.55 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1606  tRNA-Asp  88.37 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.847365 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0021  tRNA-Glu  83.1 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1597  tRNA-Asp  88.37 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287009  normal  0.565179 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1571  tRNA-Asp  88.37 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0046  tRNA-Glu  93.55 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0041  tRNA-Glu  84.75 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000102386  normal  0.397694 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0016  tRNA-Asp  96.15 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.330685  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0050  tRNA-Glu  91.18 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.499869  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0067  tRNA-Glu  91.18 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0066  tRNA-Glu  91.18 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.659746  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0062  tRNA-Glu  91.18 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.216976  normal  0.206697 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0060  tRNA-Glu  91.18 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.790027  normal  0.68606 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0016  tRNA-Glu  91.18 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.671374  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0015  tRNA-Glu  91.18 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.879975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>