More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1570 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1570  hydrogenase, group 4, HycG subunit, putative  100 
 
 
171 aa  346  1e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000101329  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1448  hydrogenase, HycG subunit  94.74 
 
 
171 aa  330  7.000000000000001e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000829996  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1316  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  85.38 
 
 
171 aa  304  5.0000000000000004e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1122  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  63.74 
 
 
172 aa  230  8.000000000000001e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.588826  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1817  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  55.03 
 
 
170 aa  187  8e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1265  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  50.99 
 
 
177 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.181899 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3850  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  54.89 
 
 
177 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.100692  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2465  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  46.79 
 
 
279 aa  156  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.150245  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1612  putative hydrogenase subunit  44.81 
 
 
172 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1527  putative hydrogenase subunit  44.81 
 
 
172 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.178756  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0796  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  49.65 
 
 
236 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3287  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  51.47 
 
 
171 aa  150  7e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.576351  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1266  formate hydrogenlyase subunit 7  46.36 
 
 
174 aa  150  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292542  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0324  putative hydrogenase/oxidoreductase subunit  45.75 
 
 
177 aa  148  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0698  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  49.66 
 
 
173 aa  147  6e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.645243  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4666  hydrogenase 4 subunit I  44.51 
 
 
171 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.81615 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1686  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  49.32 
 
 
266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0921  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  42.26 
 
 
181 aa  144  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1137  hydrogenase subunit  44.31 
 
 
169 aa  143  9e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.319967  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6070  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  50.36 
 
 
176 aa  144  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00174464 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0174  putative hydrogenase/oxidoreductase subunit  44.37 
 
 
175 aa  143  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0171  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  50 
 
 
170 aa  142  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.786655  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0934  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  47.06 
 
 
174 aa  141  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2479  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  44.85 
 
 
177 aa  140  6e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.544782 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0938  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  48.48 
 
 
246 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.358765  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2467  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  49.24 
 
 
285 aa  132  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65286  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1812  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  49.6 
 
 
165 aa  132  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.718239  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2154  hydrogenase-4, I subunit  49.6 
 
 
165 aa  132  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.5376  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1401  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  43.14 
 
 
167 aa  130  7.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2984  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  49.21 
 
 
162 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000799744  hitchhiker  0.00426294 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3660  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  46.1 
 
 
256 aa  124  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2783  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  44.27 
 
 
179 aa  124  7e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2791  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  44.27 
 
 
179 aa  124  7e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3718  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  45.45 
 
 
256 aa  123  9e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0184008  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3801  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  45.45 
 
 
259 aa  123  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4470  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  50 
 
 
162 aa  122  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1868  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  45.52 
 
 
274 aa  122  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3786  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  46.26 
 
 
256 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.531576  normal  0.312558 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4283  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  47.58 
 
 
155 aa  121  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3218  hypothetical protein  46.28 
 
 
290 aa  119  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325028  normal  0.252924 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3429  hypothetical protein  46.28 
 
 
290 aa  119  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2553  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  44.44 
 
 
252 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0321  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  43.7 
 
 
173 aa  118  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1637  hypothetical protein  46.72 
 
 
274 aa  118  3e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.019853  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0607  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  48.39 
 
 
264 aa  118  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.514043  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1789  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  50.39 
 
 
274 aa  117  6e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.760847  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0886  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  46.62 
 
 
263 aa  117  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1070  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  44.63 
 
 
142 aa  117  9e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0713  hydrogenase-4 component I  45.26 
 
 
274 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0121746  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2596  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  44.06 
 
 
244 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01010  Ni,Fe-hydrogenase III small subunit  43.51 
 
 
283 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0125  hydrogenase-Ni,Fe-hydrogenase III small subunit  47.97 
 
 
271 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1074  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  45.93 
 
 
252 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.56717e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3187  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  45.19 
 
 
252 aa  114  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00105058  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2623  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  39.33 
 
 
263 aa  114  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0341  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  44.6 
 
 
252 aa  114  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000925299  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0745  NAD-dependent dehydrogenase subunit  44.29 
 
 
229 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.901132  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4702  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  50.41 
 
 
158 aa  112  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2715  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  40.14 
 
 
263 aa  110  8.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.669488  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0673  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  39.39 
 
 
146 aa  110  9e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1132  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  42.19 
 
 
149 aa  110  9e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1278  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  40.14 
 
 
263 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.499713  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4568  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  40.14 
 
 
246 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1302  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  44.26 
 
 
165 aa  107  7.000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10083  oxidoreductase  50.83 
 
 
159 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0168847  normal  0.111213 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2184  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  41.98 
 
 
252 aa  107  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.245512 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0773  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  42.97 
 
 
254 aa  106  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.22855  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2428  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  44.29 
 
 
265 aa  105  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.674115  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3300  NADH dehydrogenase subunit B  39.04 
 
 
170 aa  104  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  37.5 
 
 
172 aa  104  7e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  37.5 
 
 
172 aa  103  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11251  hypothetical protein  40.71 
 
 
211 aa  102  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  37.5 
 
 
172 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  37.5 
 
 
172 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  37.5 
 
 
179 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  37.5 
 
 
179 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  37.5 
 
 
179 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  37.5 
 
 
172 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1175  NADH dehydrogenase subunit B  36.81 
 
 
176 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2513  NADH dehydrogenase subunit B  36.81 
 
 
174 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  37.5 
 
 
172 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1084  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  38.93 
 
 
154 aa  102  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00491903  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2726  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  38.93 
 
 
147 aa  103  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0851861  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2220  NADH dehydrogenase subunit B  33.14 
 
 
202 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160755  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3634  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  36.55 
 
 
167 aa  103  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  37.5 
 
 
172 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2503  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  40.44 
 
 
157 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3412  NADH dehydrogenase subunit B  42.06 
 
 
170 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02569  hydrogenase 3 and formate hydrogenase complex, HycG subunit  41.55 
 
 
255 aa  102  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0970  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  41.55 
 
 
255 aa  102  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2844  formate hydrogenlyase, subunit G  41.55 
 
 
255 aa  102  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0598328 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02534  hypothetical protein  41.55 
 
 
255 aa  102  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2229  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  37.4 
 
 
183 aa  102  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0705013  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2006  NADH dehydrogenase subunit B  36.81 
 
 
174 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2855  formate hydrogenlyase, subunit G  41.55 
 
 
255 aa  102  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3157  formate hydrogenlyase, subunit G  41.55 
 
 
255 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.102122 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0742  NADH dehydrogenase subunit B  35.1 
 
 
174 aa  102  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.848967  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3007  formate hydrogenlyase, subunit G  41.55 
 
 
255 aa  102  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3970  formate hydrogenlyase, subunit G  41.55 
 
 
255 aa  102  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0993  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  41.55 
 
 
255 aa  102  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0465314 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>