More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1474 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 
386 aa  801    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  54.69 
 
 
368 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  46.11 
 
 
385 aa  334  2e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  42.11 
 
 
435 aa  300  3e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  40.74 
 
 
390 aa  278  1e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  43.09 
 
 
383 aa  273  3e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  39.13 
 
 
381 aa  258  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  38.89 
 
 
370 aa  250  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  39.24 
 
 
379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  35.64 
 
 
374 aa  229  7e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  35.64 
 
 
374 aa  229  7e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  35.98 
 
 
414 aa  228  1e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  35.28 
 
 
363 aa  228  1e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  37.89 
 
 
383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  35.23 
 
 
392 aa  219  6e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  34.38 
 
 
400 aa  218  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  37.9 
 
 
325 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  38.82 
 
 
377 aa  211  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  35.34 
 
 
377 aa  209  7e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  32.03 
 
 
369 aa  208  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  31.77 
 
 
369 aa  208  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  34.31 
 
 
369 aa  206  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  32.98 
 
 
370 aa  204  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  40 
 
 
305 aa  203  4e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  37.97 
 
 
378 aa  202  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  33.76 
 
 
387 aa  199  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  35.26 
 
 
378 aa  196  7e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  32.46 
 
 
477 aa  193  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  32.22 
 
 
392 aa  192  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  32.15 
 
 
389 aa  190  4e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  31.94 
 
 
391 aa  188  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  32.32 
 
 
426 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  34.95 
 
 
391 aa  186  7e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  29.59 
 
 
463 aa  170  4e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  30.62 
 
 
376 aa  169  7e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  31.41 
 
 
373 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  32.38 
 
 
370 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  30.39 
 
 
431 aa  163  6e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  31.69 
 
 
381 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  29.66 
 
 
388 aa  159  6e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  32.83 
 
 
404 aa  159  9e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  31.69 
 
 
381 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  28.26 
 
 
413 aa  151  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  31.96 
 
 
391 aa  150  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  27.74 
 
 
443 aa  147  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  28.47 
 
 
422 aa  144  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  29.18 
 
 
371 aa  142  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  28.72 
 
 
386 aa  142  8e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  29.55 
 
 
402 aa  142  9e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  29.53 
 
 
384 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  29.1 
 
 
409 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  28.22 
 
 
422 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  31.11 
 
 
416 aa  139  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  26.89 
 
 
442 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  30.03 
 
 
379 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  30.03 
 
 
379 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0644  integrase family protein  26.39 
 
 
406 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  27.56 
 
 
403 aa  133  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  30.39 
 
 
357 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  29.23 
 
 
367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  30.46 
 
 
487 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  26.33 
 
 
451 aa  128  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  33.86 
 
 
393 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0878  phage integrase  38.59 
 
 
429 aa  123  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2157  hypothetical protein  52.21 
 
 
120 aa  123  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00218836  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2095  phage integrase  52.21 
 
 
120 aa  123  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000441723  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2312  hypothetical protein  52.21 
 
 
120 aa  123  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.430324  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2337  hypothetical protein  52.21 
 
 
120 aa  123  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  32.79 
 
 
471 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  28.83 
 
 
416 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3794  integrase family protein  25.19 
 
 
445 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0397442 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3743  integrase family protein  25.19 
 
 
445 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  32.79 
 
 
471 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  28.17 
 
 
374 aa  119  7.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  26.67 
 
 
370 aa  119  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  24.57 
 
 
443 aa  116  6e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  27.23 
 
 
393 aa  115  8.999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0172  integrase family protein  27.57 
 
 
437 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398776  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15860  site-specific recombinase XerD  27.67 
 
 
398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0008266  hitchhiker  0.0000733221 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  29.08 
 
 
385 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  26.71 
 
 
378 aa  113  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  26.27 
 
 
383 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  31.11 
 
 
506 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  32.35 
 
 
209 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  28.53 
 
 
454 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  25.41 
 
 
376 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913824  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  27.51 
 
 
368 aa  103  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8572  DNA binding domain protein, excisionase family  24.12 
 
 
507 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167813  normal  0.0589685 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0058  phage integrase family protein  25.71 
 
 
395 aa  103  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251229  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  24.78 
 
 
423 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6721  integrase family protein  27.17 
 
 
494 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.917048  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7037  hypothetical protein  24.79 
 
 
387 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  25.97 
 
 
388 aa  101  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  27.16 
 
 
393 aa  100  4e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  26.22 
 
 
365 aa  100  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4274  phage integrase  24.35 
 
 
407 aa  99.8  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.75 
 
 
376 aa  99.8  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.75 
 
 
376 aa  99.8  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  26.9 
 
 
397 aa  99.4  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0563  phage integrase family protein  24.8 
 
 
361 aa  99  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>