16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1448 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1448  hypothetical protein  100 
 
 
46 aa  94.7  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000871419  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1250  hypothetical protein  97.83 
 
 
46 aa  92.8  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141622  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1413  hypothetical protein  53.33 
 
 
53 aa  61.2  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1591  hypothetical protein  48.89 
 
 
581 aa  61.6  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28410  hypothetical protein  54.55 
 
 
55 aa  58.2  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0945803 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3109  hypothetical protein  54.35 
 
 
49 aa  57.4  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000507516 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0733  hypothetical protein  54.55 
 
 
47 aa  57  0.00000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.818237 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0089  hypothetical protein  51.06 
 
 
54 aa  55.8  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.763011  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0871  hypothetical protein  54.55 
 
 
57 aa  55.1  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000236449  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0980  hypothetical protein  52.27 
 
 
57 aa  53.9  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0205462  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14080  hypothetical protein  54.55 
 
 
49 aa  53.5  0.0000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1628  hypothetical protein  40.48 
 
 
170 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0890036  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11420  hypothetical protein  47.73 
 
 
52 aa  42.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.929313  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0615  hypothetical protein  42.86 
 
 
260 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.70319  normal  0.0524669 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4226  hypothetical protein  45.65 
 
 
50 aa  40.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1594  hypothetical protein  45.65 
 
 
49 aa  40.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.114976 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>