More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1409 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1409  putative translaldolase  100 
 
 
216 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000145663  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1190  transaldolase-like protein  100 
 
 
216 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000125483  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1216  putative translaldolase  97.22 
 
 
216 aa  416  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000404996  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1110  putative translaldolase  57.08 
 
 
216 aa  263  1e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4615  putative transaldolase  56.94 
 
 
217 aa  259  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.463616 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0473  transaldolase  54.93 
 
 
223 aa  258  6e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0553  putative translaldolase  55.87 
 
 
215 aa  258  7e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0417  putative transaldolase  55.56 
 
 
217 aa  256  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.67449  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0285  putative translaldolase  55.4 
 
 
215 aa  256  2e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4411  putative transaldolase  55.61 
 
 
221 aa  256  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2403  putative translaldolase  57.41 
 
 
215 aa  256  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1864  transaldolase  54.25 
 
 
226 aa  255  3e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0278  putative translaldolase  56.48 
 
 
216 aa  255  3e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.415561  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03280  putative transaldolase  53.7 
 
 
216 aa  253  1.0000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0309181  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0618  putative translaldolase  54.46 
 
 
215 aa  251  9.000000000000001e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.911017  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0636  putative translaldolase  54.72 
 
 
218 aa  249  3e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1366  putative translaldolase  54.17 
 
 
215 aa  249  3e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.705012  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3442  putative translaldolase  54.25 
 
 
213 aa  249  3e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1229  putative translaldolase  53.7 
 
 
217 aa  248  3e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4063  putative translaldolase  53.24 
 
 
217 aa  248  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.379343  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4211  putative translaldolase  53.24 
 
 
217 aa  248  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3332  putative translaldolase  53.77 
 
 
213 aa  247  9e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21800  putative transaldolase  53.55 
 
 
213 aa  247  1e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0617  putative translaldolase  54.25 
 
 
218 aa  247  1e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000452349  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4186  putative translaldolase  52.78 
 
 
217 aa  247  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1619  putative translaldolase  53.95 
 
 
216 aa  246  2e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0364  putative translaldolase  54.63 
 
 
215 aa  246  2e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0396985  normal  0.678872 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0010  transaldolase  53.7 
 
 
214 aa  245  3e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.896491  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0058  transaldolase  56.07 
 
 
219 aa  245  4e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0401075  hitchhiker  0.00104949 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2410  transaldolase  54.25 
 
 
213 aa  245  4e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00815052  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0584  putative translaldolase  53.24 
 
 
215 aa  244  6.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3175  putative transaldolase  54.98 
 
 
216 aa  243  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000196987  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4636  putative translaldolase  53.24 
 
 
215 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0957059  unclonable  2.60878e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0799  putative translaldolase  53.24 
 
 
215 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000767356  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0702  putative translaldolase  53.24 
 
 
215 aa  241  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0738  putative translaldolase  53.24 
 
 
215 aa  241  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0637  putative translaldolase  53.24 
 
 
215 aa  241  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0581  putative translaldolase  53.24 
 
 
215 aa  241  3.9999999999999997e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0580  putative translaldolase  53.24 
 
 
215 aa  241  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0670  putative translaldolase  53.24 
 
 
215 aa  241  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0907799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0727  putative translaldolase  53.24 
 
 
215 aa  241  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.53489e-39 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0636  transaldolase  52.8 
 
 
217 aa  240  1e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2877  transaldolase  53.42 
 
 
215 aa  238  4e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000016267  hitchhiker  0.00000329415 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0565  putative translaldolase  51.85 
 
 
215 aa  238  4e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000239698  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2783  transaldolase  53.7 
 
 
215 aa  236  2e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0128008  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1253  transaldolase  54.63 
 
 
218 aa  236  2e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0294047  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0051  putative transaldolase  50.68 
 
 
221 aa  235  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.809521 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0013  transaldolase  53.7 
 
 
217 aa  235  4e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0684  putative translaldolase  50 
 
 
215 aa  234  8e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1161  putative translaldolase  52.09 
 
 
221 aa  232  3e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1809  putative translaldolase  52.31 
 
 
215 aa  232  4.0000000000000004e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2977  putative translaldolase  49.07 
 
 
214 aa  231  5e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.324896  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4838  transaldolase  51.16 
 
 
213 aa  231  5e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000777517  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0057  transaldolase  56.48 
 
 
218 aa  230  1e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1489  putative translaldolase  54.84 
 
 
217 aa  230  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0705  putative translaldolase  48.61 
 
 
214 aa  229  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.931259  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0683  putative translaldolase  49.53 
 
 
215 aa  229  2e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2486  putative transaldolase  49.07 
 
 
214 aa  229  3e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0294  putative translaldolase  48.61 
 
 
214 aa  228  5e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0497  putative translaldolase  47.69 
 
 
214 aa  226  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0815  putative translaldolase  50.93 
 
 
217 aa  225  4e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1070  putative translaldolase  49.07 
 
 
215 aa  224  6e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.144646  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2230  putative translaldolase  48.43 
 
 
223 aa  224  9e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0911781  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0373  putative translaldolase  47.69 
 
 
214 aa  224  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.841126  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1846  putative translaldolase  50.9 
 
 
222 aa  224  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3103  putative translaldolase  50.9 
 
 
222 aa  223  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3027  transaldolase  48.84 
 
 
221 aa  223  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.32955  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1479  transaldolase  52.78 
 
 
217 aa  223  2e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1102  putative translaldolase  52.61 
 
 
246 aa  223  2e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.150753  hitchhiker  0.00417913 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2476  putative translaldolase  50.22 
 
 
223 aa  222  3e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2479  putative translaldolase  49.78 
 
 
222 aa  222  3e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.426562  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0248  putative translaldolase  53 
 
 
215 aa  222  4e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2037  transaldolase  52.53 
 
 
219 aa  221  4.9999999999999996e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000238451  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3411  putative translaldolase  50.9 
 
 
222 aa  221  7e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3409  putative translaldolase  50.9 
 
 
222 aa  221  7e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3179  putative translaldolase  50.9 
 
 
222 aa  221  7e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.319562  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3080  putative translaldolase  50.9 
 
 
222 aa  221  7e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3399  putative translaldolase  50.9 
 
 
222 aa  221  7e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3430  putative translaldolase  50.9 
 
 
222 aa  221  7e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3386  putative translaldolase  50.9 
 
 
222 aa  221  7e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.433866  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3163  putative translaldolase  51.61 
 
 
222 aa  221  9e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0859  transaldolase  47.39 
 
 
218 aa  220  9.999999999999999e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.260947  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1350  transaldolase  49.53 
 
 
217 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0395427  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1454  transaldolase  53.24 
 
 
214 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00117574  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0485  transaldolase  45.37 
 
 
214 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2529  putative translaldolase  47.71 
 
 
218 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2875  putative translaldolase  49.33 
 
 
222 aa  218  6e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2174  putative transaldolase  56.94 
 
 
215 aa  217  1e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0499  putative translaldolase  47 
 
 
217 aa  217  1e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000254528  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0624  putative translaldolase  46.3 
 
 
214 aa  217  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.04318e-35 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0106  putative translaldolase  49.77 
 
 
217 aa  217  1e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1617  putative translaldolase  46.51 
 
 
215 aa  216  2e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.68497  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0230  putative translaldolase  47.03 
 
 
220 aa  216  2.9999999999999998e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0610  putative translaldolase  45.83 
 
 
214 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2698  putative translaldolase  47.53 
 
 
226 aa  215  5e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5045  putative translaldolase  46.98 
 
 
218 aa  215  5e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1459  putative transaldolase  51.64 
 
 
218 aa  214  7e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.907401  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4567  putative translaldolase  47.49 
 
 
218 aa  214  8e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0244923  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0348  transaldolase  46.76 
 
 
219 aa  213  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39583  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0301  putative transaldolase  47.22 
 
 
222 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.103898 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>