More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1374 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1374  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 160 aa  321  2e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000912047  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1155  lipoprotein signal peptidase II  89.38 
 
 		 160 aa  295  2e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0136608  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1185  lipoprotein signal peptidase  83.02 
 
 		 160 aa  275  1e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021108  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  42.95 
 
 		 168 aa  91.3  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2475  lipoprotein signal peptidase  40.4 
 
 		 158 aa  88.6  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0868  signal peptidase II  38.35 
 
 		 150 aa  87.8  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  35.06 
 
 		 189 aa  85.5  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0928  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 148 aa  85.5  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 154 aa  84.3  6e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  33.97 
 
 		 158 aa  84.3  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 154 aa  84.3  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  37.95 
 
 		 161 aa  84  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  39.86 
 
 		 164 aa  84  9e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  41.13 
 
 		 167 aa  83.6  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  39.31 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  41.61 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  34.97 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  36.55 
 
 		 181 aa  81.3  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2328  lipoprotein signal peptidase  39.01 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  33.14 
 
 		 359 aa  80.9  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  33.14 
 
 		 359 aa  80.9  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1234  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  35.21 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2356  lipoprotein signal peptidase  35.86 
 
 		 173 aa  80.5  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0383384 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0142  lipoprotein signal peptidase  36.48 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0139  lipoprotein signal peptidase  36.48 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000441491 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  37.4 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  31.58 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  37.78 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  39.72 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  36.42 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  36.49 
 
 		 170 aa  78.6  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4973  lipoprotein signal peptidase  37.84 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  34.46 
 
 		 182 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  34.33 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  39.39 
 
 		 161 aa  77.4  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  39.61 
 
 		 169 aa  77.4  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0889  lipoprotein signal peptidase  36.13 
 
 		 170 aa  77  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2327  lipoprotein signal peptidase  36.13 
 
 		 170 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1323  lipoprotein signal peptidase  35.53 
 
 		 152 aa  77  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  35.67 
 
 		 357 aa  77  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  39.13 
 
 		 164 aa  77  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  37.23 
 
 		 172 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0472  lipoprotein signal peptidase  36.13 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  37.23 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  39.71 
 
 		 144 aa  77  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  38.35 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1105  lipoprotein signal peptidase  36.13 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2904  lipoprotein signal peptidase  36.13 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353036  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1606  lipoprotein signal peptidase  36.13 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2910  lipoprotein signal peptidase  36.13 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0390  lipoprotein signal peptidase  36.13 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0884  lipoprotein signal peptidase  36.13 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.978547 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1081  lipoprotein signal peptidase  33.99 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  38.21 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0013  lipoprotein signal peptidase  34.62 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  32.92 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  32.89 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  38.1 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  36.88 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  37.04 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  31.48 
 
 		 171 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  31.48 
 
 		 171 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  36.05 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1119  lipoprotein signal peptidase  35.06 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1404  lipoprotein signal peptidase  36.49 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  31.48 
 
 		 171 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  33.12 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  36.11 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  35.37 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  36.96 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2288  lipoprotein signal peptidase  38.73 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3473  lipoprotein signal peptidase  37.59 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911066  normal  0.126226 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0013  lipoprotein signal peptidase  31.58 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  30.67 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0013  lipoprotein signal peptidase  31.58 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  38.69 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  35.67 
 
 		 178 aa  74.3  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  30.86 
 
 		 171 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 171 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  36.17 
 
 		 178 aa  74.3  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  33.13 
 
 		 170 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  33.13 
 
 		 170 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  33.13 
 
 		 170 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1117  lipoprotein signal peptidase  39.68 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.149841  normal  0.0706096 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  37.33 
 
 		 169 aa  73.9  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0222  lipoprotein signal peptidase  37.01 
 
 		 170 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  34.51 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0196  lipoprotein signal peptidase  37.01 
 
 		 170 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0255  lipoprotein signal peptidase  41.35 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385605  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  36.17 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  36.17 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3783  lipoprotein signal peptidase  35.33 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.800649  normal  0.222823 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  35.77 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  38.97 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  38.13 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  38.97 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2996  lipoprotein signal peptidase  37.23 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>