More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1365 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 484 aa  1007    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  93.39 
 
 		 484 aa  924    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  93.39 
 
 		 487 aa  941    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 492 aa  486  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  48.05 
 
 		 490 aa  466  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 		 479 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 		 490 aa  441  9.999999999999999e-123  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  47.07 
 
 		 494 aa  440  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  45.82 
 
 		 495 aa  437  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 		 506 aa  432  1e-120  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 		 504 aa  433  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  46.96 
 
 		 507 aa  429  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  45.68 
 
 		 501 aa  426  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  45.03 
 
 		 477 aa  424  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  45.62 
 
 		 496 aa  423  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 491 aa  424  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 480 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  46.94 
 
 		 506 aa  416  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 463 aa  414  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2273  glutamyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 503 aa  414  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0757  glutamyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 495 aa  414  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.22567  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 		 500 aa  410  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 		 495 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 466 aa  403  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 467 aa  402  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 		 465 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 482 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 467 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4662  glutamyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 489 aa  398  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274625  normal  0.229729 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 		 488 aa  398  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 485 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 		 464 aa  395  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 		 468 aa  397  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 467 aa  393  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 		 464 aa  393  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 504 aa  392  1e-108  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 		 498 aa  390  1e-107  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 		 473 aa  389  1e-107  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 		 480 aa  392  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 		 470 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 		 469 aa  391  1e-107  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  43.82 
 
 		 468 aa  387  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 504 aa  387  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 488 aa  383  1e-105  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1176  glutamyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 462 aa  382  1e-105  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 		 471 aa  384  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3858  glutamyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 484 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 		 485 aa  379  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 466 aa  382  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 466 aa  382  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 466 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2139  glutamyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 489 aa  381  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0359  glutamyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 502 aa  380  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1516  glutamyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 		 476 aa  380  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0944  glutamyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 		 464 aa  380  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 493 aa  381  1e-104  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0777  glutamyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 467 aa  379  1e-104  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.980364  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 		 490 aa  380  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1783  glutamyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 		 503 aa  375  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0500613 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 471 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2552  glutamyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 471 aa  372  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000112104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 486 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2733  glutamyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 493 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.565798 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0922  glutamyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 464 aa  372  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000416745  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0264  glutamyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 		 469 aa  372  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.530461  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1878  glutamyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 514 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 466 aa  373  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1721  glutamyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 		 504 aa  373  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.730284  normal  0.139822 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 535 aa  374  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1994  glutamyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 494 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 		 471 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2779  glutamyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 471 aa  372  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172763  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 		 471 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0464  glutamyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 502 aa  373  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23560  glutamyl-tRNA synthetase  40.58 
 
 		 494 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943145 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2880  glutamyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 493 aa  375  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.882448 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0211  glutamyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 		 492 aa  373  1e-102  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0427  glutamyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 502 aa  372  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0696  glutamyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 463 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.69774  normal  0.269454 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2533  glutamyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 467 aa  373  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000148885  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 472 aa  374  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02306  glutamyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 471 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1259  glutamyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 471 aa  369  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000107097  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02267  hypothetical protein  40.42 
 
 		 471 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000211719  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2537  glutamyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 471 aa  369  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.81823e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3632  glutamyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 471 aa  370  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000908657  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2166  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 493 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120776  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1886  glutamyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 470 aa  370  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 470 aa  369  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1977  glutamyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 		 493 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2689  glutamyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 471 aa  369  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000585345  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1806  glutamyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 		 509 aa  369  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 465 aa  372  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 469 aa  369  1e-101  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 471 aa  369  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000464093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1989  glutamyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 		 503 aa  369  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.16917  normal  0.165816 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1540  glutamyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 493 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1272  glutamyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 		 471 aa  368  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000352174  hitchhiker  0.00569831 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2649  glutamyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 471 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000633167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2802  glutamyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 		 469 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000260001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>