More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1360 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1360  general secretion family protein  100 
 
 		 114 aa  228  3e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000388019  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1172  hypothetical protein  54.7 
 
 		 118 aa  120  5e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123806  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1142  general secretion  56.78 
 
 		 121 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000033549  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0134  hypothetical protein  57.81 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0236  hypothetical protein  57.81 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_142  general secretion pathway protein H  54.69 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1104  prepilin-type cleavage/methylation  34.55 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.945124  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3248  hypothetical protein  45.59 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2240  hypothetical protein  46.48 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.100669 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  32.35 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  40.66 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1024  hypothetical protein  31.4 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  33.05 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  43.48 
 
 		 146 aa  57  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2095  hypothetical protein  41.54 
 
 		 139 aa  57  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  52.17 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  39.06 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1321  general secretion pathway protein G  38.78 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  34.19 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  39.71 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  34.19 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.31 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  38.95 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  46.03 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  43.28 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  45 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0102  general secretion pathway protein G  37.36 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.573705  normal  0.0126574 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  32.14 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  44.07 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  44.07 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  44.07 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  44.07 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  44.07 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  44.07 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  46.3 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  43.06 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1042  hypothetical protein  40.51 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  33.63 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2303  general secretion pathway protein G  44.44 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0925  general secretion pathway protein G  40.86 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0172546  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2091  general secretion pathway protein G  40.68 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0177627  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0006  general secretion pathway protein G  37.7 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0815216 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1116  general secretion pathway protein G  38.14 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  45.9 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  33.01 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  40.68 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  40.68 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1280  general secretion pathway protein G  31.52 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2153  competence protein  39.71 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0605499  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0314  general secretion pathway protein  61.54 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  38.33 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  40.28 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  37 
 
 		 186 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  40.68 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  45 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  45 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  37 
 
 		 186 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  48.08 
 
 		 187 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  35.21 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  41.67 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1301  general secretion pathway protein G  38.38 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010915 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001889  general secretion pathway protein G  39.76 
 
 		 147 aa  52  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3616  general secretion pathway protein G  37.7 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  42.62 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  39.74 
 
 		 163 aa  51.6  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  37.7 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  37.33 
 
 		 148 aa  51.6  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  31.93 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  40.68 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  42.42 
 
 		 140 aa  51.2  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  42.42 
 
 		 140 aa  51.2  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  53.06 
 
 		 179 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  37.8 
 
 		 176 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  38.67 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  37.8 
 
 		 176 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0897  tfp pilus assembly protein, major pilin  34.15 
 
 		 118 aa  51.2  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.768254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  40.68 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  38.46 
 
 		 174 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  35.48 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16150  General secretion pathway protein G  36.84 
 
 		 145 aa  50.4  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4731  general secretion pathway protein G  36.07 
 
 		 144 aa  50.4  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0599807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4355  general secretion pathway protein G  36.07 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0764  general secretion pathway protein G  43.33 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.546085  normal  0.0744092 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2096  pilin domain protein  39.66 
 
 		 70 aa  50.4  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000511675  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1886  general secretion pathway protein G  44.44 
 
 		 150 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.354233  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2666  general secretion pathway protein G  44.44 
 
 		 150 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2781  general secretion pathway protein G  44.44 
 
 		 150 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0012  general secretion pathway protein G  44.44 
 
 		 150 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127302  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0224  general secretion pathway protein G  44.44 
 
 		 150 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  39.06 
 
 		 152 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3514  general secretion pathway protein G  44.44 
 
 		 150 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.957184  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0011  general secretion pathway protein G  44.44 
 
 		 150 aa  50.4  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0012  general secretion pathway protein G  44.44 
 
 		 150 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0172  general secretion pathway protein G  37.7 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  36.27 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  40.35 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4158  general secretion pathway protein G  35.96 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000753103 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3577  ATPase  36.36 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.44565 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  57.14 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4177  general secretion pathway protein G  39.06 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.250819  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>