51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1345 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1345  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  100 
 
 
336 aa  688    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1127  tagatose 1,6-diphosphate aldolase-like protein  97.62 
 
 
336 aa  671    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1156  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  88.06 
 
 
336 aa  610  9.999999999999999e-175  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1830  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  32.35 
 
 
346 aa  170  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2514  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  32.06 
 
 
346 aa  166  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1238  Tagatose-bisphosphate aldolase  32.34 
 
 
353 aa  164  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1612  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  32.91 
 
 
331 aa  160  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0758  Tagatose-bisphosphate aldolase  32.42 
 
 
334 aa  157  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3347  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  33.56 
 
 
346 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000326066 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2597  tagatose-bisphosphate aldolase  33.62 
 
 
348 aa  155  7e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.480832  normal  0.102092 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3960  Tagatose-bisphosphate aldolase  30.61 
 
 
336 aa  155  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1792  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  30.49 
 
 
325 aa  149  8e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.696246  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2262  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  28.96 
 
 
326 aa  146  6e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2223  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  28.96 
 
 
326 aa  146  6e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0139  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  29.09 
 
 
324 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D03  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  30.03 
 
 
326 aa  137  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000270283  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2111  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  27.96 
 
 
335 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0145  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  30.96 
 
 
331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000016799  normal  0.130551 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1928  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  28.57 
 
 
325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0079  Tagatose-bisphosphate aldolase  28.66 
 
 
327 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0798  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  31.31 
 
 
355 aa  129  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2246  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  27.89 
 
 
299 aa  120  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.101189  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4030  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  30.36 
 
 
289 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1950  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  27.55 
 
 
300 aa  116  5e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.524576  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4138  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  28.04 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.302553  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4351  deoxyribose-phosphate aldolase  28.04 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4105  deoxyribose-phosphate aldolase  28.04 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1948  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  29 
 
 
294 aa  112  9e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.493556  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4232  deoxyribose-phosphate aldolase  27.53 
 
 
292 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4410  deoxyribose-phosphate aldolase  27.53 
 
 
292 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4299  deoxyribose-phosphate aldolase  27.53 
 
 
292 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4345  deoxyribose-phosphate aldolase  27.53 
 
 
292 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1146  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  26.75 
 
 
317 aa  107  4e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0514012  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4254  deoxyribose-phosphate aldolase  27.53 
 
 
292 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3974  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  26.76 
 
 
296 aa  106  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00258196  normal  0.0292839 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1020  Tagatose-bisphosphate aldolase  31.22 
 
 
329 aa  105  8e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.494769 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1043  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  28.52 
 
 
295 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03715  hypothetical protein  29.25 
 
 
292 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4266  deoxyribose-phosphate aldolase  28.85 
 
 
292 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4404  deoxyribose-phosphate aldolase  29.25 
 
 
292 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4105  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  29.25 
 
 
292 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03766  predicted aldolase  29.25 
 
 
292 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2454  Tagatose-bisphosphate aldolase  28.95 
 
 
329 aa  103  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.214558  normal  0.936143 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5328  deoxyribose-phosphate aldolase  28.85 
 
 
292 aa  102  9e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.584894 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5337  aldolase  25.85 
 
 
304 aa  99.4  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.335204  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2312  Fructose-bisphosphate aldolase  25.82 
 
 
264 aa  50.4  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4205  2-amino-3,7-dideoxy-D-threo-hept-6-ulosonate synthase  27.18 
 
 
278 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.958913  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3110  Fructose-bisphosphate aldolase  26.62 
 
 
253 aa  48.5  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1166  Fructose-bisphosphate aldolase  25.41 
 
 
264 aa  46.2  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0721  fructose-bisphosphate aldolase  27.92 
 
 
283 aa  43.1  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.239684  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5231  Protein of unknown function DUF2090  25.81 
 
 
305 aa  43.1  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>