More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1341 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1341  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
160 aa  328  2e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1123  transcriptional regulator, AsnC family  95.62 
 
 
160 aa  316  1e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1152  AsnC family transcriptional regulator  95.62 
 
 
160 aa  315  2e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3193  AsnC family transcriptional regulator  54.61 
 
 
159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.680188  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1189  AsnC family transcriptional regulator  51.9 
 
 
167 aa  172  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000169629  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2183  AsnC family transcriptional regulator  53.33 
 
 
162 aa  171  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00948662  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2209  transcriptional regulator, AsnC family  51.57 
 
 
159 aa  171  5.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.928029  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0362  AsnC family transcriptional regulator  50.31 
 
 
159 aa  166  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1206  AsnC family transcriptional regulator  49.01 
 
 
162 aa  157  7e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0186  AsnC family transcriptional regulator  51.32 
 
 
162 aa  156  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000683645  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3464  AsnC family transcriptional regulator  47.4 
 
 
163 aa  154  7e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00420636 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0149  AsnC family transcriptional regulator  52.11 
 
 
160 aa  153  8e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1415  transcriptional regulator, AsnC family  48.32 
 
 
162 aa  152  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.959948  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0047  transcriptional regulator, AsnC family  46.05 
 
 
162 aa  151  4e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00562884  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2100  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 
163 aa  148  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0879  AsnC family transcriptional regulator  46.75 
 
 
159 aa  147  4e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2404  transcriptional regulator, AsnC family  47.97 
 
 
165 aa  147  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000668055  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5046  transcriptional regulator, AsnC family  47.71 
 
 
165 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0706  AsnC family transcriptional regulator  48.3 
 
 
160 aa  145  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0700  AsnC family transcriptional regulator  48.3 
 
 
160 aa  145  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.567855  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5041  AsnC family transcriptional regulator  47.06 
 
 
165 aa  144  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4772  AsnC family transcriptional regulator  47.06 
 
 
168 aa  144  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4612  AsnC family transcriptional regulator  47.06 
 
 
168 aa  144  5e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5134  AsnC family transcriptional regulator  47.06 
 
 
168 aa  144  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5013  transcriptional regulator, AsnC family  47.06 
 
 
165 aa  144  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4724  AsnC family transcriptional regulator  46.41 
 
 
165 aa  143  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4634  AsnC family transcriptional regulator  47.06 
 
 
168 aa  143  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0002  AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 
163 aa  140  9e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5034  transcriptional regulator, AsnC family  45.75 
 
 
165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0638366  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3513  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 
164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2862  transcriptional regulator, AsnC family  45.52 
 
 
166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0200  transcriptional regulator, AsnC family  45.75 
 
 
165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3008  transcriptional regulator, AsnC family  45.1 
 
 
178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2663  transcriptional regulator, AsnC family  45.7 
 
 
164 aa  136  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00226227  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0002  transcriptional regulator, AsnC family  40.26 
 
 
163 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00778678 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0002  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 
163 aa  127  7.000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355793  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2472  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 
163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1770  transcriptional regulator, AsnC family  40.52 
 
 
161 aa  119  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000758756  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2838  AsnC family transcriptional regulator  38.75 
 
 
162 aa  117  7.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258755 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1532  transcriptional regulator, AsnC family  34 
 
 
161 aa  107  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2150  transcriptional regulator, AsnC family  35.53 
 
 
164 aa  105  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.171869 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0002  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
163 aa  102  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1320  transcriptional regulator, AsnC family  32.67 
 
 
162 aa  100  6e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0636599 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2857  transcriptional regulator, AsnC family  34 
 
 
162 aa  100  8e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.301241  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3534  transcriptional regulator, AsnC family  31.54 
 
 
162 aa  100  9e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3528  transcriptional regulator, AsnC family  34.67 
 
 
161 aa  96.7  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0541368  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  30.28 
 
 
154 aa  75.1  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  31.88 
 
 
157 aa  74.3  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  29.71 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  31.39 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  29.71 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  33.08 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2886  AsnC family transcriptional regulator  29.71 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3837  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 
150 aa  67  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.261619  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  29.71 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  29.2 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0738  AsnC family transcriptional regulator  32.14 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_004310  BR1502  leucine-responsive regulatory protein  27.27 
 
 
156 aa  63.2  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  29.71 
 
 
153 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  26.28 
 
 
158 aa  63.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  30.43 
 
 
153 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1452  leucine-responsive regulatory protein  27.27 
 
 
156 aa  63.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  29.41 
 
 
165 aa  62.8  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  28.17 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  29.2 
 
 
160 aa  62.8  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  28.99 
 
 
153 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2516  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 
169 aa  62.8  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1662  AsnC family transcriptional regulator  27.27 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.070464  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2025  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 
157 aa  62  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.742298  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3095  AsnC family transcriptional regulator  27.78 
 
 
174 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679009  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  23.68 
 
 
160 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  23.68 
 
 
160 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  23.68 
 
 
160 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  23.68 
 
 
160 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  23.68 
 
 
160 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  29.63 
 
 
158 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2327  AsnC family transcriptional regulator  27.54 
 
 
151 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0714715  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0837  AsnC family transcriptional regulator  27.54 
 
 
158 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0388954  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  23.68 
 
 
160 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2165  AsnC family transcriptional regulator  27.54 
 
 
151 aa  61.6  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  24.14 
 
 
159 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
156 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
156 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  28.87 
 
 
156 aa  61.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  23.68 
 
 
160 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07108  transcriptional regulator  32 
 
 
161 aa  61.2  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001024  PutR transcriptional activator of PutA and PutP  32 
 
 
158 aa  61.2  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  30.37 
 
 
160 aa  60.8  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1324  AsnC family transcriptional regulator  23.02 
 
 
150 aa  60.8  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.719808  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  28.57 
 
 
156 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  29.2 
 
 
168 aa  60.8  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
156 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  30.14 
 
 
157 aa  60.5  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  30.99 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3954  AsnC family transcriptional regulator  29.2 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3386  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
157 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227667  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  28.26 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2969  AsnC family transcriptional regulator  27.08 
 
 
174 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  27.59 
 
 
161 aa  60.5  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>