209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1314 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1314  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
345 aa  728    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1095  radical SAM domain protein  90.14 
 
 
345 aa  665    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1123  radical SAM domain-containing protein  88.7 
 
 
345 aa  665    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2404  radical SAM family Fe-S protein  49.25 
 
 
353 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0308  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  47.62 
 
 
342 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000547663  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1052  radical SAM family protein  48.17 
 
 
335 aa  298  7e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2551  pyruvate formate-lyase activating enzyme-like protein  44.12 
 
 
354 aa  294  1e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592966  normal  0.73651 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0779  radical SAM domain-containing protein  42.81 
 
 
336 aa  291  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2243  Radical SAM domain protein  44.78 
 
 
337 aa  289  4e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1455  Radical SAM domain protein  43.77 
 
 
333 aa  289  5.0000000000000004e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1963  Radical SAM domain protein  44.38 
 
 
334 aa  288  1e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0105086  decreased coverage  0.00565461 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1728  hypothetical protein  43.5 
 
 
336 aa  287  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.241184  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0759  radical SAM domain-containing protein  43.32 
 
 
336 aa  286  2.9999999999999996e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2294  radical SAM family protein  43.41 
 
 
332 aa  286  5e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0041  radical SAM domain-containing protein  45.26 
 
 
362 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.821324  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1034  radical SAM domain-containing protein  44.91 
 
 
337 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2456  Radical SAM domain protein  41.92 
 
 
337 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1761  Radical SAM domain protein  41.82 
 
 
337 aa  280  3e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0383887 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2854  radical SAM domain-containing protein  41.21 
 
 
337 aa  279  6e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0731  Radical SAM domain protein  39.88 
 
 
342 aa  279  7e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00683582  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0325  Radical SAM domain protein  42.35 
 
 
333 aa  276  3e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1524  radical SAM domain-containing protein  43.13 
 
 
337 aa  276  3e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0044  Radical SAM domain protein  40.38 
 
 
343 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1006  radical SAM family protein  42.22 
 
 
336 aa  273  3e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1066  radical SAM domain-containing protein  41.25 
 
 
333 aa  267  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.925022  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0761  Radical SAM domain protein  41.32 
 
 
340 aa  267  2e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00535967  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0539  radical SAM domain-containing protein  39.35 
 
 
376 aa  266  2.9999999999999995e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00688869  normal  0.395603 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0348  radical SAM domain-containing protein  39.77 
 
 
336 aa  265  8.999999999999999e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.224287  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1055  radical SAM domain-containing protein  41.62 
 
 
335 aa  265  1e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.146783  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0354  radical SAM domain-containing protein  40.9 
 
 
337 aa  263  3e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.898506 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1150  DNA mismatch repair protein  40.18 
 
 
338 aa  263  3e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.926871 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1563  radical SAM domain-containing protein  40.06 
 
 
336 aa  263  3e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.356418 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1063  radical SAM domain-containing protein  39.77 
 
 
336 aa  261  1e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.665632  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1698  radical SAM domain-containing protein  39.94 
 
 
337 aa  259  3e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0922  radical SAM domain-containing protein  39.82 
 
 
333 aa  258  1e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1625  radical SAM domain-containing protein  39.71 
 
 
363 aa  258  1e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1240  radical SAM domain-containing protein  40.3 
 
 
331 aa  258  1e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1215  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 
331 aa  257  2e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0904  Radical SAM domain protein  38.18 
 
 
395 aa  257  2e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0776722 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0103  Radical SAM domain protein  37.65 
 
 
356 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1815  radical SAM domain-containing protein  40.59 
 
 
364 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0464  Radical SAM domain protein  38.72 
 
 
348 aa  252  6e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.521225  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1648  radical SAM domain-containing protein  39.41 
 
 
363 aa  252  7e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0217  radical SAM domain-containing protein  38.28 
 
 
356 aa  251  1e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  39.94 
 
 
344 aa  250  3e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0093  Radical SAM domain protein  37.35 
 
 
356 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0629  Radical SAM domain protein  41.91 
 
 
343 aa  250  3e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000217214  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0540  radical SAM domain-containing protein  40.81 
 
 
326 aa  249  5e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0542  radical SAM domain-containing protein  39.41 
 
 
384 aa  249  6e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0194035 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4120  radical SAM domain-containing protein  37.05 
 
 
372 aa  248  8e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  0.424935 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0086  radical SAM family protein  37.43 
 
 
356 aa  248  8e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.508004  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1325  radical SAM domain-containing protein  38.51 
 
 
365 aa  245  6e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.322233  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1460  radical SAM domain-containing protein  37.28 
 
 
332 aa  244  1.9999999999999999e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1670  radical SAM domain-containing protein  37.18 
 
 
362 aa  243  3e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0537367  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1999  radical SAM domain-containing protein  38.81 
 
 
351 aa  242  7.999999999999999e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.156539  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1995  radical SAM domain-containing protein  39.56 
 
 
405 aa  241  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0219  Radical SAM domain protein  38.89 
 
 
337 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0211251  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0270  radical SAM domain-containing protein  41.41 
 
 
286 aa  238  8e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2293  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  38.6 
 
 
336 aa  237  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.388191  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1167  radical SAM family protein  43.2 
 
 
294 aa  237  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000619352  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2948  radical SAM family Fe-S protein  36.16 
 
 
347 aa  236  6e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1841  Radical SAM domain protein  41.39 
 
 
340 aa  235  7e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1849  radical SAM family protein  37.58 
 
 
329 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1017  Radical SAM domain protein  38.17 
 
 
335 aa  233  3e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.677632  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2431  radical SAM domain-containing protein  36.23 
 
 
396 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1497  radical SAM domain-containing protein  38.25 
 
 
365 aa  229  4e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.398952  normal  0.0425103 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2217  Radical SAM domain protein  36.98 
 
 
374 aa  229  5e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1712  Radical SAM domain protein  37.69 
 
 
351 aa  229  6e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02500  Radical SAM domain protein  35.9 
 
 
329 aa  229  6e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000194797  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01540  Radical SAM domain protein  35.9 
 
 
329 aa  229  6e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382646  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0338  radical SAM domain-containing protein  38.39 
 
 
348 aa  229  7e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0396  radical SAM family protein  37.5 
 
 
358 aa  228  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0200  Radical SAM domain protein  39.19 
 
 
386 aa  226  4e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0088  radical SAM domain-containing protein  35.88 
 
 
357 aa  226  6e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.400989  normal  0.227798 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0360  Radical SAM domain protein  40.68 
 
 
282 aa  225  7e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0777899  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1670  radical SAM domain-containing protein  36.23 
 
 
339 aa  225  8e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387663  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0449  radical SAM family protein  36.14 
 
 
370 aa  225  8e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355453  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2865  radical SAM domain-containing protein  34.22 
 
 
331 aa  225  8e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0388  Radical SAM domain protein  36.53 
 
 
339 aa  225  1e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00103201  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1969  radical SAM family protein  34.81 
 
 
370 aa  224  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.327469 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2213  radical SAM domain-containing protein  37.12 
 
 
367 aa  223  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0100129 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2430  radical SAM domain-containing protein  37.66 
 
 
365 aa  222  7e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0451112 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5878  Radical SAM domain protein  37.46 
 
 
362 aa  221  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0206709  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0898  radical SAM domain-containing protein  34.91 
 
 
369 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2681  Radical SAM domain protein  37.31 
 
 
314 aa  219  5e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480916  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6076  radical SAM family protein  39.19 
 
 
363 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0073  pyruvate formate lyase-activating enzyme, putative  35.65 
 
 
365 aa  216  4e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2555  Radical SAM domain protein  33.24 
 
 
366 aa  216  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466932  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1005  radical SAM domain-containing protein  35.33 
 
 
370 aa  216  5e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3524  pyruvate-formate lyase-activating enzyme-like protein  34.73 
 
 
330 aa  215  8e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1585  hypothetical protein  36 
 
 
364 aa  215  8e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2136  Radical SAM domain protein  35.35 
 
 
356 aa  215  9e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.219183  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0574  radical SAM domain protein  35.99 
 
 
361 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0728  Radical SAM domain protein  35.99 
 
 
361 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000489129 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0932  radical SAM domain-containing protein  35.98 
 
 
362 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2539  Radical SAM domain protein  35.54 
 
 
360 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2684  Radical SAM domain protein  34.95 
 
 
367 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307935  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3292  Radical SAM domain protein  34.81 
 
 
366 aa  210  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1694  Radical SAM domain protein  38.13 
 
 
280 aa  209  6e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.953973 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1178  hypothetical protein  33.13 
 
 
358 aa  209  8e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>