More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1286 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1286  serine protease  100 
 
 
272 aa  544  1e-154  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1069  serine protease, DegP/HtrA family  97.06 
 
 
282 aa  530  1e-150  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000128522  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1097  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  88.89 
 
 
280 aa  489  1e-137  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0123278  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1068  serine protease, DegP/HtrA family  39.76 
 
 
394 aa  145  8.000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000137948  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1285  serine protease  38.4 
 
 
394 aa  144  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000207933  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1096  2-alkenal reductase  37.11 
 
 
394 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000450263  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  43.6 
 
 
459 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  43.02 
 
 
442 aa  127  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3420  DegP2 peptidase  42.93 
 
 
383 aa  120  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2308  2-alkenal reductase  42.93 
 
 
383 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1158  DegP2 peptidase  42.93 
 
 
384 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0614  2-alkenal reductase  42.93 
 
 
383 aa  119  6e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.46298 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3387  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.93 
 
 
384 aa  119  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848439  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1761  2-alkenal reductase  34.85 
 
 
370 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000380843  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  46.41 
 
 
383 aa  115  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  43.29 
 
 
511 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0724  putative protease do  43.71 
 
 
464 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.300996  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1285  periplasmic serine protease Do; heat shock protein HtrA  42.16 
 
 
466 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1284  periplasmic serine protease Do; heat shock protein HtrA  42.16 
 
 
466 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  42.77 
 
 
396 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  38.55 
 
 
459 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  32.51 
 
 
459 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0187  2-alkenal reductase  40.31 
 
 
375 aa  113  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.775579  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  45.33 
 
 
398 aa  112  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  39.31 
 
 
452 aa  112  5e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  45.06 
 
 
485 aa  112  5e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3296  protease Do  42.54 
 
 
450 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128319  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0382  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.18 
 
 
377 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.34875  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24150  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  39.41 
 
 
515 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  42.16 
 
 
455 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0250  heat shock protein  44.38 
 
 
481 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3731  protease DO  44.31 
 
 
476 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.233243  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0220  protease Do  44.38 
 
 
481 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.850727  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  36.48 
 
 
389 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3065  protease Do  40.85 
 
 
491 aa  110  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  42.69 
 
 
455 aa  110  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1192  protease Do  42.07 
 
 
493 aa  110  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0123913  normal  0.0156708 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3776  PDZ/DHR/GLGF  43.71 
 
 
483 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5265  protease Do  43.21 
 
 
498 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  42.11 
 
 
458 aa  110  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0602  protease Do  42.59 
 
 
516 aa  109  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000166487 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46320  serine peptidase  42.6 
 
 
365 aa  109  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.497554  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  44.22 
 
 
403 aa  109  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  39.56 
 
 
453 aa  109  5e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44 
 
 
398 aa  109  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  42.54 
 
 
451 aa  109  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0424  2-alkenal reductase  41.38 
 
 
444 aa  109  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943038  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21640  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  40.94 
 
 
417 aa  108  7.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00345268  normal  0.0571371 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0112  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.47 
 
 
450 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542288  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3640  peptidase S1C, Do  41.36 
 
 
487 aa  108  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316615  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  42.6 
 
 
465 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  34.48 
 
 
476 aa  107  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4771  protease Do  41.46 
 
 
496 aa  107  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.411686  hitchhiker  0.000180606 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4914  serine protease  41.04 
 
 
374 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.43 
 
 
366 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1216  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.34 
 
 
401 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2993  protease Do  44.14 
 
 
476 aa  107  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.700896 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  39.49 
 
 
535 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3271  protease Do  40.85 
 
 
476 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.168434 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  39.89 
 
 
450 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  39.89 
 
 
450 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  41.86 
 
 
472 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2624  protease Do  40.85 
 
 
490 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  33.81 
 
 
476 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.18 
 
 
396 aa  107  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  39.89 
 
 
450 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0403  protease Do  42.68 
 
 
483 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.149111  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  42.68 
 
 
503 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2807  HtrA2 peptidase  37.22 
 
 
308 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  39.89 
 
 
450 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0107  trypsin-like serine protease  39.78 
 
 
425 aa  107  2e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  42.68 
 
 
475 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  41.46 
 
 
505 aa  106  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  43.24 
 
 
453 aa  106  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  33.05 
 
 
476 aa  106  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  42.68 
 
 
478 aa  107  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  40.7 
 
 
385 aa  106  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3243  protease Do  40.24 
 
 
488 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0128556 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2667  exported serine protease  39.23 
 
 
455 aa  106  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0124774  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  46.81 
 
 
494 aa  106  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1739  peptidase S1C, Do  41.98 
 
 
493 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0778272  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3737  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.42 
 
 
399 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  39.46 
 
 
456 aa  106  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1070  2-alkenal reductase  43.18 
 
 
393 aa  106  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016371  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  40.98 
 
 
395 aa  106  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  40.64 
 
 
449 aa  107  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  40.72 
 
 
492 aa  107  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  40.7 
 
 
471 aa  106  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  44.14 
 
 
464 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  39.36 
 
 
451 aa  106  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  43.54 
 
 
404 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6645  HtrA2 peptidase  41.42 
 
 
469 aa  106  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00239269 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03424  protease do  43.12 
 
 
478 aa  106  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  43.54 
 
 
404 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.93 
 
 
381 aa  105  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  46.63 
 
 
464 aa  106  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0919  2-alkenal reductase  38.42 
 
 
377 aa  106  5e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000486689  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6224  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.96 
 
 
283 aa  106  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.837533  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1353  trypsin-like serine protease  43.2 
 
 
673 aa  106  5e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  41.99 
 
 
450 aa  106  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>