More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1240 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1240  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  100 
 
 
209 aa  431  1e-120  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  1.81585e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1025  peptidylprolyl isomerase  92.82 
 
 
209 aa  404  1e-112  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  3.66369e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1053  peptidylprolyl isomerase  91.87 
 
 
208 aa  377  1e-104  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  4.44097e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0957  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  55.13 
 
 
244 aa  166  3e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1136  Peptidylprolyl isomerase  52.41 
 
 
161 aa  160  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0175391 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0108  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  43.93 
 
 
193 aa  145  5e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3544  peptidylprolyl isomerase  54.61 
 
 
163 aa  140  1e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0928419  normal  0.154699 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3653  Peptidylprolyl isomerase  46.45 
 
 
247 aa  139  2e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  1.57501e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2216  peptidylprolyl isomerase  47.43 
 
 
254 aa  138  5e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  5.98862e-05 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2219  peptidylprolyl isomerase  44.51 
 
 
254 aa  137  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4201  peptidylprolyl isomerase  52.94 
 
 
171 aa  134  1e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.231436  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3720  peptidylprolyl isomerase  49.69 
 
 
163 aa  133  2e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.392854  normal  0.0282412 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01490  cyclophilin-like peptidyl prolyl cis-trans isomerase, putative  55.15 
 
 
174 aa  132  5e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0070  peptidylprolyl isomerase  49.67 
 
 
194 aa  129  4e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14434  predicted protein  43.11 
 
 
533 aa  128  5e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191518  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0551  peptidylprolyl isomerase  48.18 
 
 
164 aa  127  1e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2561  peptidylprolyl isomerase  47.33 
 
 
176 aa  126  2e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02546  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  50.39 
 
 
164 aa  126  2e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3599  peptidylprolyl isomerase  49.69 
 
 
237 aa  125  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2912  Peptidylprolyl isomerase  45.16 
 
 
172 aa  125  4e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.530558  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1854  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  46.15 
 
 
376 aa  125  6e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0518  Peptidylprolyl isomerase  44.52 
 
 
172 aa  124  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1946  hypothetical protein  46.26 
 
 
188 aa  123  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0486  peptidylprolyl isomerase  46.72 
 
 
164 aa  122  3e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1668  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  38.8 
 
 
201 aa  122  5e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00512404  normal  0.631105 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2833  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  50.33 
 
 
182 aa  122  6e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.388946  normal  0.370982 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1534  peptidylprolyl isomerase  42.11 
 
 
197 aa  121  6e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.861621  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1388  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  37.5 
 
 
245 aa  121  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0789  Peptidylprolyl isomerase  49.63 
 
 
163 aa  121  7e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.191731  normal  0.0671641 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0124  peptidylprolyl isomerase  44.38 
 
 
175 aa  121  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.671624  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1936  hypothetical protein  44.3 
 
 
188 aa  120  1e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43430  predicted protein  51.88 
 
 
184 aa  120  2e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00586531  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2820  peptidylprolyl isomerase  47.02 
 
 
206 aa  120  2e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.400749  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10708  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  41.98 
 
 
378 aa  119  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.11224  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4444  peptidylprolyl isomerase  44.03 
 
 
175 aa  118  8e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  0.482225 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1004  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  39.77 
 
 
195 aa  117  1e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00627317  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07190  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  47.3 
 
 
310 aa  116  2e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301434  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5243  Peptidylprolyl isomerase  43.51 
 
 
174 aa  117  2e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0323546  hitchhiker  0.0050054 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00380  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01750)  42.14 
 
 
629 aa  117  2e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0017  peptidylprolyl isomerase  42.22 
 
 
187 aa  116  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.516433 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0969  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  51.22 
 
 
196 aa  116  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0632  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  38.83 
 
 
250 aa  116  3e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2056  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  40.61 
 
 
279 aa  115  4e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660351  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6492  Peptidylprolyl isomerase  40 
 
 
287 aa  115  4e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3601  Peptidylprolyl isomerase  40.57 
 
 
241 aa  115  4e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.840173  hitchhiker  0.00334322 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3069  peptidylprolyl isomerase  39.2 
 
 
174 aa  115  7e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00667109  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40159  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  47.73 
 
 
629 aa  115  7e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.152782  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18195  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  42.5 
 
 
160 aa  114  9e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.896835  normal  0.71444 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38525  predicted protein  52.31 
 
 
665 aa  114  1e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0817  peptidylprolyl isomerase  42.22 
 
 
181 aa  114  1e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104667  normal  0.714543 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0059  peptidylprolyl isomerase  44.59 
 
 
176 aa  114  1e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.958253  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0746  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  45.81 
 
 
239 aa  113  2e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000529478  hitchhiker  0.00499844 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39722  predicted protein  46.1 
 
 
571 aa  113  2e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.184646 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01790  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative  42.58 
 
 
657 aa  113  3e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1165  peptidylprolyl isomerase  44.09 
 
 
156 aa  112  4e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1982  Peptidylprolyl isomerase  45.8 
 
 
155 aa  112  6e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.336344 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1981  Peptidylprolyl isomerase  43.07 
 
 
222 aa  111  7e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.34689 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1485  peptidylprolyl isomerase  46.67 
 
 
141 aa  111  8e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0773  peptidylprolyl isomerase  43.67 
 
 
228 aa  110  1e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141872  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1482  peptidylprolyl isomerase  40.12 
 
 
376 aa  110  1e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0105  Peptidylprolyl isomerase  47.06 
 
 
172 aa  110  1e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14660  predicted protein  42.86 
 
 
178 aa  110  2e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.014674  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0109  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  38.71 
 
 
282 aa  110  2e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2449  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  43.2 
 
 
173 aa  109  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2438  peptidylprolyl isomerase  46.59 
 
 
250 aa  109  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0165579 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23203  predicted protein  40 
 
 
187 aa  109  4e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.366446  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1651  peptidylprolyl isomerase  35.47 
 
 
223 aa  108  7e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.321717  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0676  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  46.56 
 
 
468 aa  108  7e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00095762  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1100  Peptidylprolyl isomerase  42.58 
 
 
147 aa  108  8e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377046  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0504  peptidylprolyl isomerase  42.95 
 
 
181 aa  107  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00200  conserved hypothetical protein  43.57 
 
 
573 aa  106  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0125915  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2367  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  40.24 
 
 
372 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153158  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1444  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  44.44 
 
 
310 aa  106  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1255  peptidylprolyl isomerase  41.83 
 
 
174 aa  106  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  7.66856e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2997  Peptidylprolyl isomerase  42.96 
 
 
169 aa  106  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  5.54367e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6860  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  39.88 
 
 
171 aa  105  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0510943 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00680  conserved hypothetical protein  42.57 
 
 
155 aa  105  5e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.310644  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2580  peptidylprolyl isomerase  41.83 
 
 
266 aa  105  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2891  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  42.07 
 
 
170 aa  105  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1530  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  39.04 
 
 
267 aa  105  7e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00140377  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0068  peptidylprolyl isomerase  35.68 
 
 
203 aa  105  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  1.60965e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2570  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  41.36 
 
 
170 aa  104  7e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0949  Peptidylprolyl isomerase  48.87 
 
 
197 aa  104  8e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.436598  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1329  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  34.65 
 
 
219 aa  104  8e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.575689  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2207  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  33.99 
 
 
230 aa  104  9e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.554867  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0461  peptidylprolyl isomerase  43.17 
 
 
201 aa  104  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00270126 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0012  peptidylprolyl isomerase  43.35 
 
 
180 aa  104  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00710  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  48.33 
 
 
176 aa  103  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1396  peptidylprolyl isomerase  45.74 
 
 
141 aa  104  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0045  peptidylprolyl isomerase  50 
 
 
154 aa  104  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0601501  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2295  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  33.99 
 
 
230 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.211892  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2344  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  45.74 
 
 
139 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0460  peptidylprolyl isomerase  44.38 
 
 
157 aa  103  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.670535  hitchhiker  0.00463405 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1711  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  40.12 
 
 
195 aa  103  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.756281  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0057  Peptidylprolyl isomerase  46.1 
 
 
176 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5201  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  50 
 
 
145 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.12899  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2433  peptidylprolyl isomerase  45.67 
 
 
174 aa  103  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00223401  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0105  Peptidylprolyl isomerase  37.78 
 
 
178 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268329  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3267  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  35.62 
 
 
223 aa  102  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0139319  normal  0.02936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6104  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family-like protein  35.5 
 
 
289 aa  102  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.50707 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>