More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1219 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  46.11 
 
 		 882 aa  709    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  43.37 
 
 		 823 aa  644    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  45.26 
 
 		 870 aa  757    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 858 aa  1745    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  44.67 
 
 		 871 aa  730    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1626  DNA mismatch repair protein MutS  41.47 
 
 		 857 aa  639    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.25405 
 
 
-
 
NC_002950  PG0095  DNA mismatch repair protein MutS  41.68 
 
 		 891 aa  667    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0480084 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  41.27 
 
 		 872 aa  657    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  40.27 
 
 		 873 aa  669    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  43.51 
 
 		 854 aa  662    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  44.55 
 
 		 872 aa  708    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  41.95 
 
 		 871 aa  639    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  40.97 
 
 		 892 aa  663    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1179  DNA mismatch repair protein MutS  41.47 
 
 		 880 aa  637    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809456 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  44.76 
 
 		 928 aa  759    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  41.09 
 
 		 855 aa  648    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  45.85 
 
 		 865 aa  705    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  41.93 
 
 		 855 aa  665    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  41.26 
 
 		 892 aa  664    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  41.46 
 
 		 890 aa  667    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  40.79 
 
 		 894 aa  664    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  41.28 
 
 		 895 aa  676    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  41.74 
 
 		 878 aa  648    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  41.26 
 
 		 892 aa  664    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  41.81 
 
 		 859 aa  663    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1883  DNA mismatch repair protein MutS  41.64 
 
 		 858 aa  682    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  40.79 
 
 		 892 aa  664    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  44.37 
 
 		 872 aa  722    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  41.77 
 
 		 855 aa  676    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  43.58 
 
 		 900 aa  719    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  43.58 
 
 		 869 aa  721    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1753  DNA mismatch repair protein MutS  41.03 
 
 		 837 aa  645    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581518  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  43.68 
 
 		 854 aa  671    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  44.98 
 
 		 853 aa  711    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  42.92 
 
 		 863 aa  659    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1134  DNA mismatch repair protein MutS  42.25 
 
 		 860 aa  652    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  41 
 
 		 896 aa  640    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  44.15 
 
 		 870 aa  712    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2515  DNA mismatch repair protein MutS  43.05 
 
 		 885 aa  655    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  41.06 
 
 		 881 aa  678    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  43.4 
 
 		 873 aa  667    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3815  DNA mismatch repair protein MutS  44.22 
 
 		 907 aa  659    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.548974 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  45.64 
 
 		 872 aa  730    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  40.63 
 
 		 904 aa  644    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1900  DNA mismatch repair protein MutS  43.31 
 
 		 868 aa  691    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  41.26 
 
 		 892 aa  664    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  44.87 
 
 		 903 aa  674    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  43.73 
 
 		 882 aa  659    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  41.46 
 
 		 875 aa  671    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  44.03 
 
 		 850 aa  679    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  45.21 
 
 		 863 aa  665    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  42.78 
 
 		 872 aa  669    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  44.65 
 
 		 932 aa  720    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  43.97 
 
 		 869 aa  706    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  42.35 
 
 		 892 aa  687    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1466  DNA mismatch repair protein MutS  42.48 
 
 		 872 aa  642    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  42.9 
 
 		 896 aa  749    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  43.02 
 
 		 863 aa  711    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1282  DNA mismatch repair protein MutS  44.53 
 
 		 862 aa  638    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  41.45 
 
 		 887 aa  651    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  41.38 
 
 		 872 aa  691    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3368  DNA mismatch repair protein MutS  43.12 
 
 		 888 aa  657    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.583963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0842  DNA mismatch repair protein MutS  42.34 
 
 		 860 aa  696    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.899937  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  45.38 
 
 		 867 aa  775    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  44.19 
 
 		 903 aa  681    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3768  DNA mismatch repair protein MutS  42.23 
 
 		 968 aa  708    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  45.33 
 
 		 887 aa  776    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  43.3 
 
 		 860 aa  684    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  43.43 
 
 		 897 aa  707    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  44.51 
 
 		 868 aa  732    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  91.84 
 
 		 858 aa  1577    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  41.02 
 
 		 890 aa  670    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  42.79 
 
 		 882 aa  668    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  44.6 
 
 		 870 aa  732    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4152  DNA mismatch repair protein MutS  41.28 
 
 		 857 aa  640    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.121513 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  39.01 
 
 		 881 aa  646    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4050  DNA mismatch repair protein MutS  41.47 
 
 		 857 aa  638    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.593835  hitchhiker  0.000000000609956 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  40.53 
 
 		 890 aa  658    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2734  DNA mismatch repair protein MutS  43.13 
 
 		 888 aa  655    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0147  DNA mismatch repair protein MutS  40.23 
 
 		 856 aa  649    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.692226  normal  0.372979 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  45.13 
 
 		 910 aa  697    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  44.26 
 
 		 910 aa  696    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  44.27 
 
 		 874 aa  707    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  41.67 
 
 		 901 aa  640    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0355  DNA mismatch repair protein MutS  40.66 
 
 		 910 aa  636    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171458 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  45.36 
 
 		 873 aa  750    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2983  DNA mismatch repair protein MutS  43.42 
 
 		 864 aa  703    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  42.01 
 
 		 861 aa  641    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  44.53 
 
 		 859 aa  740    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  41.62 
 
 		 872 aa  661    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  41.38 
 
 		 872 aa  691    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  41.09 
 
 		 855 aa  648    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  43.56 
 
 		 863 aa  721    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  41.07 
 
 		 880 aa  635    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  42.94 
 
 		 855 aa  668    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1519  DNA mismatch repair protein MutS  41.94 
 
 		 854 aa  642    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00861946  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  42.62 
 
 		 871 aa  681    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  43.09 
 
 		 857 aa  683    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  43.05 
 
 		 889 aa  717    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  42.82 
 
 		 868 aa  647    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>