34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1098 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_0384  virulence-associated protein E  54.03 
 
 		 788 aa  881    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.469306  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2850  virulence-associated E family protein  54.16 
 
 		 788 aa  882    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000089982  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1237  virulence-associated E family protein  54.13 
 
 		 781 aa  880    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000496901  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1098  virulence-associated protein E, putative  100 
 
 		 789 aa  1647    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1196  virulence-associated E family protein  47.74 
 
 		 818 aa  734    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1072  virulence-associated E family protein  40.8 
 
 		 815 aa  602  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1053  virulence-associated E family protein  40.8 
 
 		 815 aa  602  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.957725  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3057  virulence-associated E family protein  36.01 
 
 		 789 aa  498  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00197064  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1413  virulence-associated E family protein  35.43 
 
 		 806 aa  490  1e-137  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3418  DNA primase domain protein  35.31 
 
 		 739 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0205684  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3978  virulence-associated E family protein  36.92 
 
 		 744 aa  192  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00795636  normal  0.108518 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3038  TraC domain-containing protein  33.91 
 
 		 736 aa  171  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4941  hypothetical protein  39.47 
 
 		 736 aa  160  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.670147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1984  virulence-associated E family protein  32.27 
 
 		 509 aa  159  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2155  virulence-associated E  37.6 
 
 		 695 aa  159  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00489763  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1880  virulence-associated E family protein  33 
 
 		 835 aa  159  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00331522  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1612  virulence-associated E family protein  34.68 
 
 		 892 aa  151  6e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631807 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3095  virulence-associated E family protein  31.02 
 
 		 413 aa  146  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1166  virulence-associated E family protein  32.76 
 
 		 896 aa  146  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.67711 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1690  virulence-associated E family protein  33.14 
 
 		 489 aa  144  7e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.879464  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3094  virulence-associated E  34.91 
 
 		 662 aa  120  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000820429  normal  0.712426 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2569  virulence-associated E  32.61 
 
 		 697 aa  118  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00313413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0144  virulence-associated E family protein  27.59 
 
 		 812 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856396 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5640  virulence-associated E family protein  30.63 
 
 		 761 aa  102  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000885028  normal  1 
 
 
 
NC_010465  YPK_1212  virulence-associated E family protein  33.18 
 
 		 725 aa  100  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0427  virulence-associated protein E  24.04 
 
 		 476 aa  100  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1431  P-loop ATPase and inactivated derivatives-like  30.71 
 
 		 400 aa  98.6  4e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.150716  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0903  virulence-associated E family protein  28.57 
 
 		 778 aa  94.4  7e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0404  P-loop ATPase and inactivated derivatives-like protein  28.52 
 
 		 431 aa  90.9  9e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.233969  normal  0.98615 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0933  hypothetical protein  29.05 
 
 		 218 aa  56.2  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2797  P4 family phage/plasmid primase  27.78 
 
 		 782 aa  49.7  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3284  P-loop ATPase and inactivated derivatives-like protein  26.84 
 
 		 748 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.832553  normal  0.553227 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2662  Phage/plasmid primase P4-like protein  27.59 
 
 		 632 aa  48.5  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5333  P-loop ATPase and inactivated derivatives-like protein  25.79 
 
 		 749 aa  45.8  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300834 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>