160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1087 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  73.49 
 
 
414 aa  654  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  74 
 
 
440 aa  680  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  100 
 
 
444 aa  928  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  73.25 
 
 
414 aa  652  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  80.62 
 
 
420 aa  721  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  64.22 
 
 
421 aa  587  1e-167  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2199  HK97 family portal protein , putative  78.97 
 
 
225 aa  363  3e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1313  phage portal protein, HK97 family  37.72 
 
 
425 aa  298  1e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1697  phage portal protein, HK97 family  37.72 
 
 
425 aa  298  1e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2273  phage portal protein, HK97 family  37.72 
 
 
425 aa  298  1e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  44.13 
 
 
524 aa  293  4e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1996  phage portal protein, HK97 family  39.22 
 
 
473 aa  285  8e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  40.32 
 
 
416 aa  285  2e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1682  phage phi-105 ORF25-like protein  39.28 
 
 
407 aa  280  3e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.844077 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1286  HK97 family phage portal protein  39.51 
 
 
384 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4463  phage portal protein, HK97 family  37.62 
 
 
434 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  6.79414e-05 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  37.7 
 
 
413 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  2.75865e-11 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  37.94 
 
 
413 aa  270  3e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  1.36411e-08 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3879  HK97 family phage portal protein  40.26 
 
 
423 aa  269  7e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49861  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  37.7 
 
 
413 aa  269  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5152  HK97 family phage portal protein  37.66 
 
 
412 aa  269  8e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1721  HK97 family phage portal protein  38.63 
 
 
419 aa  267  3e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  36.71 
 
 
444 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1602  phage portal protein, HK97 family  35.68 
 
 
434 aa  256  6e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  36.46 
 
 
431 aa  256  8e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  6.49364e-05 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1657  phage portal protein, HK97 family  38.67 
 
 
408 aa  254  2e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0869  HK97 family phage portal protein  38.5 
 
 
409 aa  253  6e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1617  HK97 family phage portal protein  37.63 
 
 
426 aa  247  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.709388  normal  0.287703 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2622  phage portal protein, HK97 family  33.91 
 
 
417 aa  243  5e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.830928  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1670  Phage portal protein, HK97  37.11 
 
 
407 aa  242  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2600  HK97 family phage portal protein  33.64 
 
 
408 aa  239  8e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3396  HK97 family phage portal protein  35.92 
 
 
445 aa  236  5e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0697474  hitchhiker  6.93474e-09 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1544  Phage portal protein, HK97  35 
 
 
424 aa  236  5e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1469  HK97 family portal protein  34.52 
 
 
390 aa  233  8e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1751  HK97 family phage portal protein  36.65 
 
 
420 aa  230  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2965  prophage LambdaSo, HK97 family portal protein  34.62 
 
 
432 aa  226  5e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0862  phage portal protein, HK97 family  33.61 
 
 
389 aa  224  2e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  5.55494e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2595  HK97 family phage portal protein  35.16 
 
 
436 aa  224  3e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3972  HK97 family phage portal protein  35.62 
 
 
411 aa  221  2e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2594  phage portal protein, HK97 family  33.65 
 
 
434 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.601506  normal  0.257209 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1624  Phage portal protein, HK97  33.95 
 
 
428 aa  213  5e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0210145  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7331  phage portal protein, HK97 family  34.69 
 
 
428 aa  209  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0014  phage portal protein, HK97 family  34.38 
 
 
409 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1632  HK97 family phage portal protein  33.84 
 
 
429 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543468  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1336  HK97 family phage portal protein  33.11 
 
 
417 aa  207  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.352989  normal 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4251  phage portal protein, HK97 family  32.99 
 
 
544 aa  206  5e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1586  HK97 family phage portal protein  32.98 
 
 
415 aa  206  6e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00170734  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5463  hypothetical protein  33.05 
 
 
412 aa  204  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2472  phage portal protein, HK97 family  33.42 
 
 
542 aa  201  2e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2360  head HK97 family portal protein  33.06 
 
 
397 aa  198  2e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3316  HK97 family phage portal protein  32.99 
 
 
416 aa  197  4e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1898  HK97 family phage portal protein  33.24 
 
 
416 aa  196  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3975  phage portal protein, HK97 family  32.53 
 
 
398 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2069  HK97 family phage portal protein  32.74 
 
 
416 aa  194  4e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0647  Phage portal protein, HK97  33.43 
 
 
434 aa  190  4e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.239357  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2492  Phage portal protein, HK97  32.47 
 
 
395 aa  188  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  32.61 
 
 
404 aa  187  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0858  phage lambdaBa02, DNA replication protein  32.75 
 
 
408 aa  184  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2027  phage portal protein  31.78 
 
 
406 aa  181  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1968  hypothetical protein  31.76 
 
 
435 aa  181  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3945  HK97 family phage portal protein  31.06 
 
 
404 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00231416  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4979  hypothetical protein  27.27 
 
 
436 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5358  hypothetical protein  27.27 
 
 
436 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1717  Phage portal protein, HK97  29.4 
 
 
406 aa  176  9e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0339  Phage portal protein, HK97  29.12 
 
 
407 aa  174  2e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0482575  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0274  HK97 family phage portal protein  30.9 
 
 
392 aa  173  6e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0463  phage portal protein  32.07 
 
 
411 aa  167  4e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.390433 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4004  phage portal protein, HK97 family  30.54 
 
 
413 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1356  HK97 family phage portal protein  30.34 
 
 
393 aa  163  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6184  portal protein  32.46 
 
 
414 aa  162  8e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0360  HK97 family phage portal protein  29.73 
 
 
445 aa  162  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0989  HK97 family phage portal protein  29.66 
 
 
445 aa  161  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0644  HK97 family phage portal protein  29.84 
 
 
401 aa  159  9e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1045  head portal protein  31.49 
 
 
460 aa  158  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.326172  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0625  phage portal protein, HK97 family  29.92 
 
 
413 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1457  phage portal protein, HK97 family  28.74 
 
 
417 aa  156  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3865  HK97 family phage portal protein  31.3 
 
 
429 aa  156  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00272242 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1628  Phage portal protein, HK97  30.9 
 
 
392 aa  155  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.220321  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1485  Phage portal protein, HK97  31.23 
 
 
399 aa  152  8e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.334021 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0555  phage portal protein, HK97 family  29.21 
 
 
448 aa  152  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0158159  hitchhiker  0.0015106 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2502  phage portal protein, HK97 family  28.81 
 
 
420 aa  149  7e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.160981  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1303  phage portal protein, HK97 family  29.47 
 
 
437 aa  149  1e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4113  HK97 family phage portal protein  28.03 
 
 
455 aa  147  4e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5506  phage portal protein, HK97 family  28.12 
 
 
408 aa  146  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.709326  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3314  phage portal protein, HK97 family  28.74 
 
 
433 aa  146  7e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.6128e-12 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2236  HK97 family phage portal protein  27.49 
 
 
447 aa  137  6e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.759812  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0243  HK97 family phage portal protein  27 
 
 
441 aa  136  6e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2891  putative phage portal protein, HK97 family  27.39 
 
 
833 aa  134  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  6.39413e-05 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2245  putative phage portal protein, HK97 family  27.39 
 
 
859 aa  134  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  1.40812e-05 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1540  putative phage portal protein, HK97 family  27.39 
 
 
833 aa  134  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.533039 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4284  phage portal protein, HK97 family  27.76 
 
 
454 aa  129  8e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2611  phage portal protein, HK97 family  27.76 
 
 
454 aa  129  8e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5065  phage portal protein, HK97 family  26.99 
 
 
455 aa  129  1e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2997  putative head portal protein  28.61 
 
 
408 aa  128  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.429219  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2688  phage portal protein, HK97 family  26.13 
 
 
464 aa  127  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.912505  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4078  phage portal protein, HK97 family  26.54 
 
 
457 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333282  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2238  phage portal protein, HK97 family  27.87 
 
 
389 aa  121  2e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0330088  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1772  HK97 family phage portal protein  27.91 
 
 
451 aa  118  2e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.468859  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1648  hypothetical protein  25.27 
 
 
422 aa  118  2e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.117092  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3489  Phage portal protein, HK97  30.07 
 
 
391 aa  116  7e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>