More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1056 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1056  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  552  1e-156  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  90.24 
 
 
287 aa  484  1e-136  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_924  transport protein  89.55 
 
 
287 aa  484  1e-136  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0491784  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  52.1 
 
 
291 aa  290  2e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2450  drug/metabolite exporter family protein  44.96 
 
 
303 aa  247  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2468  hypothetical protein  46.77 
 
 
303 aa  247  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0312814  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2739  permease, drug/metabolite transporter superfamily  44.24 
 
 
303 aa  244  1e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  4.6973e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2694  transporter, EamA family  44.87 
 
 
304 aa  239  3e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.680724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2672  eama family protein  44.87 
 
 
304 aa  238  7e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.43207  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2489  EamA family protein  44.87 
 
 
304 aa  238  7e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.432631  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2686  transporter, EamA family  45.25 
 
 
304 aa  238  7e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.88959e-05 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2420  drug/metabolite exporter family protein  44.87 
 
 
304 aa  238  8e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.220238  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2616  transporter, EamA family  45.25 
 
 
304 aa  236  4e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  2.55461e-07 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0112  hypothetical protein  51.44 
 
 
298 aa  231  7e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2709  EamA family protein  45.04 
 
 
304 aa  217  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00270641  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.73 
 
 
294 aa  184  1e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.23 
 
 
301 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5985  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.86 
 
 
301 aa  175  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1368  hypothetical protein  36.92 
 
 
306 aa  169  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.496352  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6627  hypothetical protein  39.93 
 
 
299 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5782  hypothetical protein  39.93 
 
 
299 aa  165  7e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6147  hypothetical protein  39.93 
 
 
299 aa  165  7e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0094  hypothetical protein  33.94 
 
 
290 aa  163  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0098  hypothetical protein  33.94 
 
 
290 aa  163  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7691  hypothetical protein  40.29 
 
 
299 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.327195 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5288  hypothetical protein  36.56 
 
 
314 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0346  hypothetical protein  35.89 
 
 
302 aa  155  5e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  35.71 
 
 
319 aa  153  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6058  hypothetical protein  38.85 
 
 
298 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5832  hypothetical protein  39.21 
 
 
298 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.684234 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1193  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.44 
 
 
295 aa  143  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.503688 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4047  hypothetical protein  34.42 
 
 
312 aa  142  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4101  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.53 
 
 
309 aa  140  2e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518904  normal  0.0241309 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2202  membrane protein  32.38 
 
 
296 aa  128  1e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337301  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0391  hypothetical protein  34.44 
 
 
331 aa  126  4e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  31.93 
 
 
299 aa  121  1e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0612  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.04 
 
 
340 aa  119  6e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00182068 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15760  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  32.07 
 
 
327 aa  116  4e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.941518  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.31 
 
 
335 aa  115  8e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  31.49 
 
 
305 aa  113  4e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0207  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 
356 aa  105  7e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.855752  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  26.94 
 
 
312 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.45 
 
 
292 aa  99  9e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  28.08 
 
 
305 aa  94.4  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  30.72 
 
 
315 aa  94  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.14 
 
 
287 aa  93.2  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  3.80606e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2821  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.88 
 
 
342 aa  91.7  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.499218  normal  0.67078 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.56 
 
 
283 aa  90.9  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.21 
 
 
325 aa  89.7  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  28.67 
 
 
300 aa  89.7  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0216  hypothetical protein  27.21 
 
 
296 aa  89.4  7e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.685922  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  30.54 
 
 
311 aa  86.7  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.54 
 
 
286 aa  85.5  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  30.1 
 
 
341 aa  85.5  1e-15  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.31 
 
 
292 aa  83.6  3e-15  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  28.32 
 
 
304 aa  84  3e-15  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  27.76 
 
 
308 aa  83.2  5e-15  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  26.95 
 
 
296 aa  82.8  6e-15  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  29.25 
 
 
288 aa  82  9e-15  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  26.55 
 
 
296 aa  81.6  1e-14  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5105  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.63 
 
 
349 aa  81.6  1e-14  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal  0.400388 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  27.87 
 
 
289 aa  82  1e-14  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.41 
 
 
305 aa  81.6  1e-14  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  30.94 
 
 
286 aa  81.6  1e-14  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0251  hypothetical protein  23.88 
 
 
305 aa  80.9  2e-14  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  28.84 
 
 
297 aa  81.3  2e-14  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  26.67 
 
 
303 aa  80.1  4e-14  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  25.87 
 
 
303 aa  79.7  6e-14  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  9.31242e-05 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6176  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.76 
 
 
315 aa  79.3  7e-14  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.090411 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  28.25 
 
 
296 aa  79  9e-14  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  26.32 
 
 
303 aa  78.6  1e-13  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  25.69 
 
 
303 aa  78.6  1e-13  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  31.03 
 
 
325 aa  78.6  1e-13  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1521  hypothetical protein  26.82 
 
 
266 aa  77.8  2e-13  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.851073  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.96 
 
 
312 aa  78.2  2e-13  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4521  EamA family protein  25 
 
 
301 aa  77  3e-13  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  27.68 
 
 
296 aa  77  3e-13  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4890  transporter, EamA family  25 
 
 
301 aa  77  3e-13  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  26.67 
 
 
294 aa  77  4e-13  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.06 
 
 
302 aa  76.6  4e-13  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2409  hypothetical protein  30.11 
 
 
288 aa  76.6  4e-13  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.517139  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4505  EamA family protein  25 
 
 
301 aa  76.6  4e-13  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1615  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.12 
 
 
291 aa  76.3  6e-13  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4664  EamA family protein  25 
 
 
301 aa  75.9  7e-13  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5024  eama family protein  25 
 
 
301 aa  75.9  7e-13  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.333831  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  26.67 
 
 
303 aa  75.9  8e-13  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.91 
 
 
324 aa  75.9  8e-13  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  26.67 
 
 
303 aa  75.9  8e-13  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  26.48 
 
 
329 aa  75.1  1e-12  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.81 
 
 
301 aa  75.1  1e-12  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  8.02295e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.97 
 
 
300 aa  74.3  2e-12  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.226388  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  25.8 
 
 
303 aa  74.3  2e-12  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.32 
 
 
286 aa  73.9  3e-12  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1849  hypothetical protein  28.45 
 
 
319 aa  73.9  3e-12  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  25.8 
 
 
303 aa  73.9  3e-12  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  25.96 
 
 
303 aa  73.6  3e-12  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.08 
 
 
291 aa  73.6  3e-12  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  28 
 
 
297 aa  73.6  4e-12  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12661  SMR family transporter PecM  28.18 
 
 
317 aa  73.6  4e-12  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000571261 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  25.35 
 
 
303 aa  73.6  4e-12  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>