More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1045 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1045  single-strand binding protein  100 
 
 		 135 aa  282  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000383918  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_916  single-stranded DNA-binding protein  97.78 
 
 		 135 aa  278  2e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000232202  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0928  single-strand binding protein  94.81 
 
 		 135 aa  271  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000199282  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  56.88 
 
 		 166 aa  137  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  60 
 
 		 151 aa  133  8e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1527  single-strand binding protein  48.03 
 
 		 152 aa  130  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52347  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4110  single-strand binding protein  50 
 
 		 192 aa  128  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000157926  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  54.81 
 
 		 186 aa  126  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  45.9 
 
 		 160 aa  123  8.000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2703  single-strand binding protein  50.86 
 
 		 175 aa  123  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2388  single-strand binding protein  47.01 
 
 		 138 aa  122  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0027  single-strand binding protein  52.38 
 
 		 175 aa  120  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal  0.0441795 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0828  single-strand binding protein  51.43 
 
 		 176 aa  119  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00178667  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  44.44 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  43.8 
 
 		 166 aa  118  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  52.83 
 
 		 172 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1545  single-strand binding protein  48.15 
 
 		 166 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00898888  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  43.75 
 
 		 143 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  47.32 
 
 		 161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  45.61 
 
 		 188 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  46.23 
 
 		 157 aa  114  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  44 
 
 		 167 aa  114  6e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  46.03 
 
 		 174 aa  113  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  42.28 
 
 		 149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  44.64 
 
 		 180 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  44 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  47.66 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0351  single-stranded DNA-binding protein  49.54 
 
 		 169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0967385  normal  0.582722 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  50.93 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  47.66 
 
 		 146 aa  111  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  41.1 
 
 		 146 aa  111  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0044  single-strand binding protein  44.37 
 
 		 137 aa  111  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.139232  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1595  single-strand binding protein  47.62 
 
 		 184 aa  111  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5424  single-strand binding protein  43.8 
 
 		 130 aa  110  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  48.62 
 
 		 173 aa  110  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  39.86 
 
 		 148 aa  110  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  50.48 
 
 		 165 aa  110  6e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1019  single-strand binding protein  47.17 
 
 		 176 aa  110  6e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0415033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  47.62 
 
 		 163 aa  110  9e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  45.08 
 
 		 130 aa  110  9e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3093  single-stranded DNA-binding protein  46.3 
 
 		 199 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0781  single-stranded DNA-binding protein  46.3 
 
 		 185 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  46.3 
 
 		 184 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  46.73 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  42.54 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0061  single-stranded DNA-binding protein  46.3 
 
 		 196 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  36.2 
 
 		 164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  46.3 
 
 		 192 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2957  single-stranded DNA-binding protein  46.3 
 
 		 192 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602343  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  46.3 
 
 		 179 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  48.15 
 
 		 183 aa  109  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  41.79 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0779  single-strand binding protein  41.96 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  41.79 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  41.8 
 
 		 188 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  42.15 
 
 		 157 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  41.35 
 
 		 190 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3720  single-strand binding protein  41.67 
 
 		 143 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  45.37 
 
 		 182 aa  107  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  45.37 
 
 		 186 aa  107  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  40.48 
 
 		 222 aa  107  5e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0130  single-strand binding protein  45.05 
 
 		 142 aa  107  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  42.99 
 
 		 167 aa  107  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  46.3 
 
 		 184 aa  106  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0025  single-strand binding protein  48.57 
 
 		 185 aa  107  8.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.326087  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2695  single-stranded DNA-binding protein  44.44 
 
 		 186 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2837  single-stranded DNA-binding protein  44.44 
 
 		 187 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2788  single-stranded DNA-binding protein  44.44 
 
 		 183 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.481192 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  45.37 
 
 		 181 aa  106  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6107  single-stranded DNA-binding protein  44.44 
 
 		 184 aa  106  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2163  single-stranded DNA-binding protein  44.44 
 
 		 184 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  49.57 
 
 		 151 aa  105  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0304  single-stranded DNA-binding protein  47.22 
 
 		 185 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  0.895882 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2777  single-stranded DNA-binding protein  44.44 
 
 		 184 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  47.46 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  45.28 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4106  single-stranded DNA-binding protein  44.44 
 
 		 177 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0277  single-stranded DNA-binding protein  47.22 
 
 		 185 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  45.37 
 
 		 181 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2576  single-strand binding protein  48.57 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0611  single-stranded DNA-binding protein  44.44 
 
 		 179 aa  105  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0353597 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0422  single-stranded DNA-binding protein  47.22 
 
 		 178 aa  105  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  42.86 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5215  single-stranded DNA-binding protein  45.37 
 
 		 177 aa  103  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  45.71 
 
 		 155 aa  103  9e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1550  single-stranded DNA-binding protein  45.37 
 
 		 177 aa  103  9e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0341  single-stranded DNA-binding protein  42.59 
 
 		 172 aa  102  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  42.02 
 
 		 159 aa  102  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  42.02 
 
 		 159 aa  102  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3685  single-stranded DNA binding protein  39.84 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  48.65 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  39.25 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  39.25 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  35.21 
 
 		 161 aa  101  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  44.34 
 
 		 154 aa  101  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  44.55 
 
 		 164 aa  101  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  47.62 
 
 		 142 aa  101  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4448  single-strand binding protein  43.18 
 
 		 171 aa  101  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0398944  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  44.34 
 
 		 156 aa  100  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3819  single-strand binding protein  45.04 
 
 		 175 aa  100  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.131469  normal  0.852259 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>