More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1005 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1005  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 112 aa  232  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.146198  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0892  ArsR family transcriptional regulator  79.28 
 
 		 112 aa  187  5.999999999999999e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_876  transcriptional regulator, ArsR family  78.38 
 
 		 112 aa  183  6e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  46.43 
 
 		 113 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  37.61 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  39.64 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0821  ArsR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 115 aa  74.3  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0671  transcriptional regulator, ArsR family  50.72 
 
 		 112 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4201  ArsR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 94 aa  72.8  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314782  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14690  regulatory protein ArsR  48.48 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.27611e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  44.87 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1602  regulatory protein ArsR  34.26 
 
 		 115 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.10653  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0160  arsenical resistence operon repressor ArsR  34.26 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.571922  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2876  ArsR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.557946  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  34.82 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0302  arsenical resistence operon repressor ArsR  34.26 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2350  transcriptional regulator, ArsR family  34.82 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.917554  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  45.83 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  44.87 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1931  transcriptional regulator, ArsR family  37 
 
 		 123 aa  70.1  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2504  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  46.97 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 317 aa  69.3  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1965  ArsR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  48.75 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  37.08 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  48.75 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2563  transcriptional regulator, ArsR family  45.71 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000881945  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  48.75 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  48.75 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  45.71 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0755  transcriptional regulator, ArsR family  40.22 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.554367  normal  0.0268545 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1301  transcriptional regulator, ArsR family  47.62 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0459  transcriptional regulator, ArsR family  36.28 
 
 		 131 aa  67  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.83445  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  53.03 
 
 		 115 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  53.85 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  40.21 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1731  arsenical resistance operon repressor  36 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0861085  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0532  arsenical resistence operon repressor  46.25 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  49.21 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0574  ArsR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.191131 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2209  ArsR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000625729  normal  0.041755 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  45.24 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  46.97 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  35.96 
 
 		 94 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  46.97 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0559  regulatory protein, ArsR  34.71 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0567484  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0581  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0011  regulatory protein, ArsR  42.25 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  44.78 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  41.79 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  44.93 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1189  transcriptional regulator, ArsR family  43.24 
 
 		 103 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3781  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00283923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3499  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0532  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 114 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0567  transcriptional regulator, ArsR family  31.82 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.702064 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 348 aa  63.5  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0666  transcriptional regulator, ArsR family  35.79 
 
 		 105 aa  63.5  0.0000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  38.27 
 
 		 306 aa  63.5  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  45.71 
 
 		 105 aa  63.5  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0684  transcriptional regulator, ArsR family  46.48 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1407  regulatory protein, ArsR  39.51 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0808  transcriptional regulator, ArsR family  39.53 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.203378 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0532  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 114 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35130  arsenic resistance transcriptional regulator  48.61 
 
 		 116 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.362165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1154  transcriptional regulator, ArsR family  36.73 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.303698  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  37.36 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1220  regulatory protein, ArsR  40.4 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0013  regulatory protein, ArsR  42.25 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3359  ArsR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0576  transcriptional regulator, ArsR family  34 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00300248  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  46.27 
 
 		 120 aa  62  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  44.29 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 328 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  44.12 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>