More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0991 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0991  50S ribosomal protein L10  100 
 
 
176 aa  350  5.9999999999999994e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000204805  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_863  ribosomal protein L10  96.02 
 
 
176 aa  338  2e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130926  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0882  50S ribosomal protein L10  91.48 
 
 
176 aa  310  9e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.629984  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  46.01 
 
 
172 aa  143  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  41.38 
 
 
176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  44.37 
 
 
166 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  44.37 
 
 
166 aa  132  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  40.72 
 
 
178 aa  132  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  44.37 
 
 
166 aa  132  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  44.37 
 
 
166 aa  132  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  44.37 
 
 
166 aa  132  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  44.37 
 
 
166 aa  132  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  44.37 
 
 
166 aa  132  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  44.37 
 
 
166 aa  132  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  44.37 
 
 
166 aa  132  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  43.71 
 
 
166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  41.52 
 
 
175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  44.16 
 
 
166 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  44.12 
 
 
176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  42.59 
 
 
174 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  42.21 
 
 
166 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  40 
 
 
177 aa  124  7e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  42.28 
 
 
166 aa  122  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  37.93 
 
 
176 aa  120  7e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0313  50S ribosomal protein L10  38.36 
 
 
166 aa  119  3e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000558823  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  40.83 
 
 
179 aa  118  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  39.77 
 
 
174 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  40.13 
 
 
170 aa  118  4.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  39.43 
 
 
183 aa  117  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  38.01 
 
 
172 aa  117  7e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  39.88 
 
 
173 aa  116  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  39.77 
 
 
174 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  37.43 
 
 
181 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  41.46 
 
 
174 aa  115  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  41.61 
 
 
166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  41.56 
 
 
171 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  43.71 
 
 
168 aa  112  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  43.71 
 
 
168 aa  112  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1474  50S ribosomal protein L10  36.99 
 
 
181 aa  111  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000103472  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  40.65 
 
 
174 aa  111  5e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  36.47 
 
 
174 aa  110  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  39.64 
 
 
172 aa  110  9e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  40.27 
 
 
166 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  40.27 
 
 
166 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  41.46 
 
 
174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  40 
 
 
164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  43.33 
 
 
168 aa  108  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1302  50S ribosomal protein L10  37.91 
 
 
166 aa  108  5e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000076628  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  38.18 
 
 
175 aa  107  6e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  37.06 
 
 
173 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  37.06 
 
 
173 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  35.98 
 
 
178 aa  107  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  39.74 
 
 
174 aa  107  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0567  50S ribosomal protein L10  37.25 
 
 
167 aa  107  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00969269  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0317  50S ribosomal protein L10  42.38 
 
 
165 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00438278  normal  0.203557 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2769  50S ribosomal protein L10  42.38 
 
 
165 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  40.4 
 
 
174 aa  105  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  39.88 
 
 
174 aa  106  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0338  50S ribosomal protein L10  42.38 
 
 
165 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550948  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  34.32 
 
 
179 aa  105  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  34.32 
 
 
179 aa  105  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  38.46 
 
 
176 aa  105  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  42 
 
 
173 aa  105  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0314  ribosomal protein L10  39.07 
 
 
175 aa  104  5e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000329441  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  36.94 
 
 
166 aa  104  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  36.94 
 
 
166 aa  104  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0504  50S ribosomal protein L10  34.12 
 
 
180 aa  103  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000340487  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0310  50S ribosomal protein L10  43.56 
 
 
165 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0746923  normal  0.0249908 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0140  50S ribosomal protein L10  36.02 
 
 
174 aa  103  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  38.41 
 
 
174 aa  103  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  41.06 
 
 
165 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1417  50S ribosomal protein L10  36.5 
 
 
197 aa  102  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013127  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4327  50S ribosomal protein L10  40.13 
 
 
181 aa  102  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  39.87 
 
 
184 aa  102  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3437  50S ribosomal protein L10  41.06 
 
 
165 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153429  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0044  50S ribosomal protein L10  40.38 
 
 
215 aa  101  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000127438  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1590  50S ribosomal protein L10  34.71 
 
 
174 aa  101  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2361  50S ribosomal protein L10  34.71 
 
 
174 aa  101  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0040  50S ribosomal protein L10  40.38 
 
 
179 aa  100  7e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0245031  hitchhiker  0.0000000000023806 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0325  50S ribosomal protein L10  36.81 
 
 
174 aa  100  8e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00522529  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1864  50S ribosomal protein L10  36.81 
 
 
174 aa  100  8e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0922754  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2273  50S ribosomal protein L10  34.71 
 
 
174 aa  100  8e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  35 
 
 
176 aa  100  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4318  50S ribosomal protein L10  33.89 
 
 
187 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.561909  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1325  ribosomal protein L10  35.71 
 
 
256 aa  99  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3935  50S ribosomal protein L10  38.76 
 
 
181 aa  99  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193843  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1784  50S ribosomal protein L10  36.36 
 
 
181 aa  99  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0271  50S ribosomal protein L10  36.17 
 
 
178 aa  99.4  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00121092  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0396  50S ribosomal protein L10  44.29 
 
 
173 aa  98.2  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252363  hitchhiker  0.00709296 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  40 
 
 
173 aa  98.6  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1453  50S ribosomal protein L10  38.65 
 
 
173 aa  97.8  7e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0239  50S ribosomal protein L10  42.86 
 
 
165 aa  97.8  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0229066 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  38.41 
 
 
174 aa  97.4  8e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0317  50S ribosomal protein L10  37.65 
 
 
173 aa  97.4  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.146286  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2643  50S ribosomal protein L10  42.86 
 
 
165 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3788  50S ribosomal protein L10  42.86 
 
 
165 aa  97.1  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3756  50S ribosomal protein L10  42.86 
 
 
184 aa  97.1  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0407684  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0488  50S ribosomal protein L10  37.65 
 
 
173 aa  97.4  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.169718  hitchhiker  0.00000169108 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0571  50S ribosomal protein L10  36.09 
 
 
187 aa  97.1  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3818  50S ribosomal protein L10  42.86 
 
 
184 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>