More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0953 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  100 
 
 
828 aa  1675    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  43.99 
 
 
818 aa  667    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  43.08 
 
 
794 aa  677    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  46.72 
 
 
821 aa  715    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  47.19 
 
 
805 aa  723    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1686  heavy metal translocating P-type ATPase  43.27 
 
 
811 aa  642    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  42.77 
 
 
826 aa  653    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  46.67 
 
 
831 aa  653    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  47.07 
 
 
806 aa  702    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  46 
 
 
798 aa  699    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  46.94 
 
 
805 aa  703    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  46.82 
 
 
805 aa  699    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  47.07 
 
 
805 aa  706    Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  46 
 
 
798 aa  699    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3106  copper-translocating P-type ATPase  45.13 
 
 
742 aa  636    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.138352  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  46.06 
 
 
803 aa  692    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  45.92 
 
 
797 aa  732    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  44.75 
 
 
837 aa  701    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  43.74 
 
 
954 aa  654    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  43.92 
 
 
976 aa  640    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  44.95 
 
 
753 aa  651    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  46.94 
 
 
759 aa  672    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3789  heavy metal translocating P-type ATPase  42.53 
 
 
836 aa  645    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0366996  normal  0.767636 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1596  copper-translocating P-type ATPase  43.92 
 
 
834 aa  649    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  46.82 
 
 
805 aa  701    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  45.65 
 
 
758 aa  655    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.14474  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  42.62 
 
 
885 aa  683    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  45.29 
 
 
752 aa  654    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  43.98 
 
 
835 aa  643    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  46.94 
 
 
805 aa  703    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1110  heavy metal translocating P-type ATPase  40.36 
 
 
938 aa  652    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0214095  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  45.24 
 
 
837 aa  704    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  42.96 
 
 
840 aa  661    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  40.38 
 
 
857 aa  645    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  43.74 
 
 
826 aa  669    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  44.62 
 
 
827 aa  664    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  46.94 
 
 
759 aa  672    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  43.41 
 
 
802 aa  679    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  46.12 
 
 
798 aa  728    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  46.45 
 
 
743 aa  663    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  85.51 
 
 
828 aa  1464    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2388  heavy-metal transporting P-type ATPase  42.53 
 
 
819 aa  640    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168329  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  45.64 
 
 
849 aa  693    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  44.08 
 
 
841 aa  669    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  43.8 
 
 
942 aa  666    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4065  heavy metal translocating P-type ATPase  42.53 
 
 
836 aa  645    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2308  heavy metal translocating P-type ATPase  43.77 
 
 
841 aa  656    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  46.71 
 
 
806 aa  702    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  44.95 
 
 
826 aa  671    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  43.78 
 
 
796 aa  684    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  44.22 
 
 
852 aa  650    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0477  copper-exporting ATPase  46.46 
 
 
742 aa  654    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  44.62 
 
 
797 aa  637    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  47.31 
 
 
839 aa  726    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  44.55 
 
 
838 aa  696    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  44.16 
 
 
836 aa  711    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  45.06 
 
 
833 aa  674    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  46.95 
 
 
806 aa  702    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  44.27 
 
 
894 aa  689    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  47.8 
 
 
797 aa  711    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0133  ATPase, P type cation/copper-transporter  52.79 
 
 
751 aa  738    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  45.64 
 
 
815 aa  707    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  47.46 
 
 
836 aa  772    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  44.13 
 
 
855 aa  659    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  45.58 
 
 
817 aa  734    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  44.11 
 
 
889 aa  690    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  44.35 
 
 
889 aa  688    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1381  copper-translocating P-type ATPase  42.35 
 
 
844 aa  641    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0325  heavy metal translocating P-type ATPase  42.55 
 
 
821 aa  635    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1899  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  44.55 
 
 
799 aa  669    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2021  copper-translocating P-type ATPase  43.27 
 
 
811 aa  642    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  43.41 
 
 
802 aa  679    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  47.07 
 
 
805 aa  706    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  44.19 
 
 
827 aa  699    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  44.47 
 
 
814 aa  694    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_824  cation transport ATPase  85.14 
 
 
828 aa  1462    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5724  heavy metal translocating P-type ATPase  43.4 
 
 
839 aa  647    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.788276 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1690  copper-translocating P-type ATPase  45.79 
 
 
740 aa  644    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  46.5 
 
 
750 aa  667    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  46.38 
 
 
786 aa  675    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  46.43 
 
 
837 aa  658    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  44.47 
 
 
827 aa  664    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  43.35 
 
 
833 aa  650    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  43.13 
 
 
833 aa  650    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  44.85 
 
 
1087 aa  632  1e-180  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  46.02 
 
 
1071 aa  635  1e-180  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00395  Cation transport ATPase  45.03 
 
 
747 aa  630  1e-179  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0212  copper-translocating P-type ATPase  44.49 
 
 
759 aa  629  1e-179  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2539  heavy metal translocating P-type ATPase  43.64 
 
 
838 aa  630  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.687698  normal  0.311305 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1873  heavy metal translocating P-type ATPase  43.27 
 
 
821 aa  629  1e-179  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  45.22 
 
 
758 aa  631  1e-179  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  45.34 
 
 
759 aa  630  1e-179  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04850  heavy metal translocating P-type ATPase  41.29 
 
 
826 aa  628  1e-178  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000573179  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  41.79 
 
 
861 aa  627  1e-178  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  45.78 
 
 
762 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1877  heavy metal translocating P-type ATPase  42.63 
 
 
837 aa  628  1e-178  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000289142  hitchhiker  0.00605245 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3243  heavy metal translocating P-type ATPase  42.21 
 
 
841 aa  626  1e-178  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  45.51 
 
 
762 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  45.51 
 
 
762 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  45.51 
 
 
762 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>