57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0916 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0916  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  633  1e-180  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.470991  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_787  hypothetical protein  86.75 
 
 
302 aa  565  1e-160  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0800  hypothetical protein  85.43 
 
 
302 aa  560  1e-158  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0525  hypothetical protein  35.34 
 
 
276 aa  166  4e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.902286  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0501  hypothetical protein  35.34 
 
 
276 aa  166  5e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.686369  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_466  hypothetical protein  34.94 
 
 
276 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.841701  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1398  hypothetical protein  31.43 
 
 
261 aa  101  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139952  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1007  protein of unknown function DUF75  27.24 
 
 
250 aa  90.5  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2882  protein of unknown function DUF75  27.09 
 
 
251 aa  90.5  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.728218 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1565  3-isopropylmalate dehydratase  28.93 
 
 
256 aa  89  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2792  protein of unknown function DUF75  26.94 
 
 
250 aa  83.2  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.147305  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1150  protein of unknown function DUF75  25.1 
 
 
251 aa  74.3  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.13291  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1077  hypothetical protein  22.29 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.370003  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5826  protein of unknown function DUF75  22.44 
 
 
297 aa  68.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22756  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1950  hypothetical protein  25 
 
 
252 aa  66.2  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.622804 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1797  hypothetical protein  22.69 
 
 
250 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0226  hypothetical protein  25.1 
 
 
255 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0859  hypothetical protein  21.85 
 
 
250 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.776803  hitchhiker  0.00442614 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1058  hypothetical protein  22.27 
 
 
250 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2052  hypothetical protein  23.79 
 
 
248 aa  61.2  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1126  hypothetical protein  24.37 
 
 
251 aa  60.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0921  hypothetical protein  21.99 
 
 
251 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22220  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  22.75 
 
 
290 aa  60.5  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.737687 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0414  hypothetical protein  26.75 
 
 
255 aa  60.5  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.270771  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2444  protein of unknown function DUF75  24.41 
 
 
288 aa  57.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0888  protein of unknown function DUF75  23.78 
 
 
311 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5919  hypothetical protein  22.6 
 
 
284 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239178  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0868  protein of unknown function DUF75  27.05 
 
 
258 aa  57.4  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0959  protein of unknown function DUF75  26.67 
 
 
256 aa  56.6  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.405373  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1855  hypothetical protein  22.11 
 
 
284 aa  55.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.982924 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0725  hypothetical protein  25.33 
 
 
226 aa  54.7  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2210  protein of unknown function DUF75  22.71 
 
 
298 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2290  protein of unknown function DUF75  22.56 
 
 
286 aa  52.4  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00121228  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3162  hypothetical protein  22.87 
 
 
296 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2504  protein of unknown function DUF75  27.13 
 
 
255 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1480  protein of unknown function DUF75  21.21 
 
 
283 aa  50.4  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3150  hypothetical protein  22.87 
 
 
296 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0142521  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3212  hypothetical protein  22.87 
 
 
296 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.550185  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3475  hypothetical protein  22.71 
 
 
296 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1826  hypothetical protein  21.72 
 
 
281 aa  48.5  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0638514  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2169  hypothetical protein  24.23 
 
 
301 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0362139  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2630  hypothetical protein  22.19 
 
 
282 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3052  hypothetical protein  21.98 
 
 
292 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1741  hypothetical protein  22.22 
 
 
235 aa  47  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0721  hypothetical protein  23.25 
 
 
235 aa  46.2  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.538394  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1912  protein of unknown function DUF75  21.22 
 
 
301 aa  46.6  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000183665 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2670  protein of unknown function DUF75  21.24 
 
 
286 aa  46.2  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361609  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0357  hypothetical protein  20.83 
 
 
247 aa  45.8  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1297  hypothetical protein  25.48 
 
 
252 aa  45.4  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.607867 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1196  protein of unknown function DUF75  19.44 
 
 
296 aa  45.4  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00179103  normal  0.0638399 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0799  hypothetical protein  25 
 
 
268 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.515819  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0007  hypothetical protein  22.22 
 
 
236 aa  45.4  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121063  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1927  hypothetical protein  22.68 
 
 
242 aa  45.4  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.655814  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2785  protein of unknown function DUF75  19.8 
 
 
286 aa  43.5  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000787132  hitchhiker  0.0000705422 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0198  hypothetical protein  22.56 
 
 
257 aa  43.9  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2009  protein of unknown function DUF75  22.41 
 
 
285 aa  42.7  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.547664  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0692  protein of unknown function DUF75  22.88 
 
 
249 aa  42.7  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.343449 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>