15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0913 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0913  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  300  5.000000000000001e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000596117  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_784  rubrerythrin-like protein  83.44 
 
 		 151 aa  261  3e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0797  rubrerythrin  80.79 
 
 		 173 aa  247  5e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2114  Rubrerythrin  30.32 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0416  rubrerythrin  26.21 
 
 		 185 aa  60.8  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0765  rubrerythrin  29.94 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000572509  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1323  rubrerythrin  29.14 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116816  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3293  hypothetical protein  30.5 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0508681  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3150  rubrerythrin  28.48 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1536  rubrerythrin  27.1 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146194  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3242  rubrerythrin  27.4 
 
 		 163 aa  47.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  hitchhiker  0.000706309 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1807  rubrerythrin  32 
 
 		 151 aa  47  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0804  Rubrerythrin  26.39 
 
 		 157 aa  42.4  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1052  Rubrerythrin  25.87 
 
 		 150 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.376741  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0458  Rubrerythrin  33.96 
 
 		 170 aa  41.6  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>