More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0859 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0859  GTP-binding protein LepA  100 
 
 		 605 aa  1234    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00045747  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1266  GTP-binding protein LepA  53.39 
 
 		 600 aa  671    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00508967  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0777  GTP-binding protein LepA  96.03 
 
 		 605 aa  1167    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000166546  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0223  GTP-binding protein LepA  50.58 
 
 		 612 aa  637    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.939463  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1893  GTP-binding protein LepA  53.26 
 
 		 601 aa  649    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000413124  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1152  GTP-binding protein LepA  53.68 
 
 		 607 aa  664    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.667226  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2315  GTP-binding protein LepA  55.54 
 
 		 604 aa  684    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108379  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2673  GTP-binding protein LepA  53.26 
 
 		 634 aa  640    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.674383  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4400  GTP-binding protein LepA  55.81 
 
 		 607 aa  702    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.751687  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1174  GTP-binding protein LepA  51.9 
 
 		 598 aa  647    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0906  GTP-binding protein LepA  55.81 
 
 		 610 aa  688    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.310817  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1039  GTP-binding protein LepA  53.09 
 
 		 602 aa  649    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1341  GTP-binding protein LepA  52.25 
 
 		 602 aa  642    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348176  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1243  GTP-binding protein LepA  51.59 
 
 		 596 aa  637    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000510522  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4218  GTP-binding protein LepA  55.65 
 
 		 607 aa  702    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00198782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4056  GTP-binding protein LepA  55.81 
 
 		 607 aa  702    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000612977  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1240  GTP-binding protein LepA  52.17 
 
 		 606 aa  638    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4066  GTP-binding protein LepA  55.81 
 
 		 607 aa  702    Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0084757  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1326  GTP-binding protein LepA  58.21 
 
 		 603 aa  692    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.450194  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1837  GTP-binding protein LepA  51.93 
 
 		 610 aa  639    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1834  GTP-binding protein LepA  51.76 
 
 		 610 aa  638    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1278  GTP-binding protein LepA  51.51 
 
 		 601 aa  636    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0142175  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0829  GTP-binding protein LepA  54.09 
 
 		 614 aa  654    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1754  GTP-binding protein LepA  53.16 
 
 		 603 aa  648    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.570485  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0855  GTP-binding protein LepA  53.42 
 
 		 596 aa  655    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0509078  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2089  GTP-binding protein LepA  51.49 
 
 		 599 aa  636    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0343  GTP-binding protein LepA  51.83 
 
 		 603 aa  644    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.697436  normal  0.31273 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0440  GTP-binding protein LepA  54.18 
 
 		 603 aa  670    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.239909  normal  0.261131 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04811  GTP-binding protein LepA  54.05 
 
 		 602 aa  669    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.469061  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2461  GTP-binding protein LepA  52.24 
 
 		 606 aa  651    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1157  GTP-binding protein LepA  51.25 
 
 		 596 aa  635    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.119218  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4170  GTP-binding protein LepA  55.48 
 
 		 607 aa  699    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000794546  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1618  GTP-binding protein LepA  54.38 
 
 		 599 aa  673    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000183904  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2197  GTP-binding protein LepA  53.15 
 
 		 601 aa  664    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.332949 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1471  GTP-binding protein LepA  56.15 
 
 		 605 aa  689    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1582  GTP-binding protein LepA  54.49 
 
 		 602 aa  653    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.314683  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0490  GTP-binding protein LepA  53.92 
 
 		 605 aa  664    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0799  GTP-binding protein LepA  54.49 
 
 		 606 aa  656    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.274116  normal  0.0311101 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1766  GTP-binding protein LepA  52.4 
 
 		 629 aa  657    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000017953  normal  0.0160194 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2817  GTP-binding protein LepA  52.49 
 
 		 601 aa  648    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4544  GTP-binding protein LepA  55.81 
 
 		 607 aa  702    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3190  GTP-binding protein LepA  57.31 
 
 		 600 aa  706    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000178316  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0416  GTP-binding protein LepA  54.65 
 
 		 602 aa  665    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.879299  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0479  GTP-binding protein LepA  56.95 
 
 		 604 aa  701    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1751  GTP-binding protein LepA  52.01 
 
 		 597 aa  645    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.951642  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2261  GTP-binding protein LepA  51.83 
 
 		 607 aa  644    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0581  GTP-binding protein LepA  56.88 
 
 		 602 aa  711    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.810707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20941  GTP-binding protein LepA  54.49 
 
 		 604 aa  654    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.812482 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1614  GTP-binding protein LepA  52.66 
 
 		 601 aa  657    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2061  GTP-binding protein LepA  56.02 
 
 		 602 aa  673    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04741  GTP-binding protein LepA  53.32 
 
 		 603 aa  648    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3431  GTP-binding protein LepA  51.67 
 
 		 599 aa  644    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04711  GTP-binding protein LepA  54.38 
 
 		 602 aa  665    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.772575  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1199  GTP-binding protein LepA  51.59 
 
 		 596 aa  637    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000113159  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0708  GTP-binding protein LepA  54.08 
 
 		 611 aa  651    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0389521  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1241  GTP-binding protein LepA  51.25 
 
 		 596 aa  637    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000201097  hitchhiker  0.000000417727 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0764  GTP-binding protein LepA  51.67 
 
 		 602 aa  636    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0592169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0221  GTP-binding protein LepA  52.68 
 
 		 601 aa  641    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.894507  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1276  GTP-binding protein LepA  51.59 
 
 		 596 aa  637    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000630436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3046  GTP-binding protein LepA  55.98 
 
 		 608 aa  702    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000105213  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1677  GTP-binding protein LepA  54.01 
 
 		 607 aa  666    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.112249  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0438  GTP-binding protein LepA  52 
 
 		 610 aa  642    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.587658  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1332  GTP-binding protein LepA  59.37 
 
 		 601 aa  731    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.214925  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0244  GTP-binding protein LepA  53.15 
 
 		 601 aa  650    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.471518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04401  GTP-binding protein LepA  54.38 
 
 		 602 aa  663    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.900462  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0678  GTP-binding protein LepA  50.42 
 
 		 599 aa  639    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0691872 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1162  GTP-binding protein LepA  51.91 
 
 		 601 aa  642    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0264661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0979  GTP-binding protein LepA  53.09 
 
 		 602 aa  649    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.315503  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0758  GTP-binding protein LepA  51.75 
 
 		 596 aa  642    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0424593  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1516  GTP-binding protein LepA  55.79 
 
 		 600 aa  664    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4075  GTP-binding protein LepA  52.92 
 
 		 605 aa  652    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1717  GTP-binding protein LepA  51.5 
 
 		 596 aa  645    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000391378  normal  0.794394 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2295  GTP-binding protein LepA  55.93 
 
 		 600 aa  662    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2010  GTP-binding protein LepA  55.76 
 
 		 600 aa  660    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2425  GTP-binding protein LepA  55.57 
 
 		 601 aa  669    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21881 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0767  GTP-binding protein LepA  53.76 
 
 		 596 aa  654    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1454  GTP-binding protein LepA  53.59 
 
 		 596 aa  658    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0893898  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1344  GTP-binding protein LepA  53.51 
 
 		 627 aa  669    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.269651  normal  0.813727 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0786  GTP-binding protein LepA  52.58 
 
 		 598 aa  637    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1583  GTP-binding protein LepA  55.89 
 
 		 599 aa  674    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0013667  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0148  GTP-binding protein LepA  52.16 
 
 		 608 aa  644    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2083  GTP-binding protein LepA  57.69 
 
 		 603 aa  685    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.31565  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2503  GTP-binding protein LepA  52.75 
 
 		 599 aa  669    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000011667  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1210  GTP-binding protein LepA  57.02 
 
 		 607 aa  692    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1049  GTP-binding protein LepA  51.9 
 
 		 598 aa  647    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2501  GTP-binding protein LepA  56.38 
 
 		 601 aa  713    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000290099  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1191  GTP-binding protein LepA  52.74 
 
 		 620 aa  644    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.859695  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0932  GTP-binding protein LepA  56.81 
 
 		 610 aa  692    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0636523  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3444  GTP-binding protein LepA  54.68 
 
 		 603 aa  675    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7374  GTP-binding protein LepA  52.17 
 
 		 617 aa  649    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.35747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0905  GTP-binding protein LepA  52.98 
 
 		 598 aa  661    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.446358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1619  GTP-binding protein LepA  58.51 
 
 		 604 aa  721    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.702768 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0778  GTP-binding protein LepA  54.87 
 
 		 606 aa  648    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0607569  normal  0.011752 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1473  GTP-binding protein LepA  51.75 
 
 		 596 aa  635    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2331  GTP-binding protein LepA  53.88 
 
 		 598 aa  667    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000282409  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1859  GTP-binding protein LepA  55.59 
 
 		 605 aa  688    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.365032  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1146  GTP-binding protein LepA  51.25 
 
 		 596 aa  644    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000362085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2106  GTP-binding protein LepA  53.26 
 
 		 633 aa  645    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1642  GTP-binding protein LepA  54.01 
 
 		 607 aa  666    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.807233  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04181  GTP-binding protein LepA  54.49 
 
 		 602 aa  665    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.570977  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>