More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0782 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0782  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  100 
 
 
352 aa  711    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_688  ThiE-associated domain protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase  93.47 
 
 
352 aa  668    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000736904  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0708  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  83.52 
 
 
352 aa  597  1e-169  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.53 
 
 
344 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0601  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.94 
 
 
356 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1057  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.38 
 
 
343 aa  214  1.9999999999999998e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.004946  normal  0.0997928 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2684  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.52 
 
 
343 aa  202  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3432  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.22 
 
 
343 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2521  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.58 
 
 
346 aa  195  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1368  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.13 
 
 
365 aa  194  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.524473  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3314  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.1 
 
 
347 aa  191  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2908  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.91 
 
 
368 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.62 
 
 
343 aa  190  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14591  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.63 
 
 
351 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5047  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.2 
 
 
379 aa  186  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.554063  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14731  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.73 
 
 
351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.161501  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0604  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.38 
 
 
536 aa  183  5.0000000000000004e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2019  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.01 
 
 
352 aa  181  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19391  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.44 
 
 
353 aa  180  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.706748 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14351  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.52 
 
 
353 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.23 
 
 
360 aa  177  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16941  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.85 
 
 
350 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0840  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.18 
 
 
350 aa  170  4e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.373367  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0929  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.81 
 
 
211 aa  169  7e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.013677  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.56 
 
 
211 aa  168  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000752501  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0896  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.52 
 
 
352 aa  168  1e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.833365  normal  0.686436 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3508  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.07 
 
 
223 aa  166  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0511603  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3318  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.41 
 
 
220 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.195577  normal  0.0232291 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2235  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  48.72 
 
 
479 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3166  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.29 
 
 
221 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.040851  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1657  hypothetical protein  44.88 
 
 
210 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000901813 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1989  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.9 
 
 
210 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1005  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.99 
 
 
202 aa  163  5.0000000000000005e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0390  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.21 
 
 
207 aa  162  6e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.312895 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0446  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.71 
 
 
207 aa  161  2e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0641  thiamine-phosphate diphosphorylase  46.56 
 
 
209 aa  161  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0370584  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0116  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41 
 
 
205 aa  160  4e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1502  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.09 
 
 
346 aa  159  5e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.63479  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2471  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.79 
 
 
219 aa  159  5e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1934  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.05 
 
 
212 aa  159  8e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1529  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.71 
 
 
207 aa  159  8e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.691821  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.35 
 
 
206 aa  159  9e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0593  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.93 
 
 
206 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2062  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.27 
 
 
216 aa  155  7e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0114882  normal  0.0947623 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2162  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.22 
 
 
210 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00137501  hitchhiker  0.0000728866 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1543  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.11 
 
 
207 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0451009  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1336  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.67 
 
 
207 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1155  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.05 
 
 
197 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149529  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2520  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.91 
 
 
207 aa  153  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2056  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.32 
 
 
216 aa  153  5e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.343455 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  41.01 
 
 
492 aa  151  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  40.49 
 
 
213 aa  151  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1691  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.86 
 
 
209 aa  150  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0247781  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0816  thiamine monophosphate synthase  45.45 
 
 
217 aa  150  3e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.380112  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1500  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.17 
 
 
207 aa  149  8e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0461  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.18 
 
 
206 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.037147  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1824  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.66 
 
 
222 aa  148  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.106561 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1379  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.57 
 
 
215 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000146383  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17535  predicted protein  43.02 
 
 
478 aa  147  3e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.274913 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  41.63 
 
 
490 aa  146  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1934  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.81 
 
 
206 aa  146  5e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0342  thiamine monophosphate synthase  42.86 
 
 
206 aa  146  6e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2628  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.91 
 
 
234 aa  145  9e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0665  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.8 
 
 
218 aa  145  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3513e-26 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.41 
 
 
223 aa  144  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4827  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.5 
 
 
224 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1532  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.02 
 
 
206 aa  144  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1558  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.36 
 
 
214 aa  143  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.536172  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0376  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.74 
 
 
214 aa  143  5e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.756236  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0261  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.57 
 
 
211 aa  142  6e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.243144  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.5 
 
 
214 aa  141  9.999999999999999e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2788  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.22 
 
 
208 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1240  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.26 
 
 
216 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1712  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.05 
 
 
220 aa  140  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0573115  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1927  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.59 
 
 
236 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0209  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.05 
 
 
211 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06844  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.11 
 
 
204 aa  139  7e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0492  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.46 
 
 
206 aa  139  8.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  44.44 
 
 
497 aa  138  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0652  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.31 
 
 
218 aa  138  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614638  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.31 
 
 
220 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0061  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.12 
 
 
205 aa  136  5e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221396  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000869  thiamin-phosphate pyrophosphorylase  38.74 
 
 
204 aa  136  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1918  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.47 
 
 
212 aa  136  5e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1223  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.25 
 
 
217 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4121  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.67 
 
 
228 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0958  thiamine monophosphate synthase  41.76 
 
 
212 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.578889  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1683  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.44 
 
 
218 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000047745  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0773  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.68 
 
 
216 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  40.91 
 
 
497 aa  133  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0730  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.67 
 
 
216 aa  133  5e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0124065  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1463  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.19 
 
 
211 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0645  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.28 
 
 
216 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1811  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.8 
 
 
221 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.645451  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2999  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.22 
 
 
224 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.718744  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1122  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.51 
 
 
208 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0900  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.92 
 
 
219 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1139  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.96 
 
 
226 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.123471 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1628  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.16 
 
 
205 aa  130  3e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.40521  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1159  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.18 
 
 
212 aa  130  3e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>