More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0753 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013552  DhcVS_659  threonyl-tRNA synthetase (thrS)  95.19 
 
 
582 aa  1144  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  3.28118e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  54.74 
 
 
644 aa  647  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0681  threonyl-tRNA synthetase  95.7 
 
 
582 aa  1148  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  3.23411e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0753  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 
582 aa  1211  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.105849  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0121  threonyl-tRNA synthetase  54.2 
 
 
596 aa  641  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  55.23 
 
 
643 aa  654  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  53.3 
 
 
636 aa  631  1e-179  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  53.58 
 
 
645 aa  629  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  2.55721e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  53.38 
 
 
643 aa  629  1e-179  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0226  threonyl-tRNA synthetase  51.1 
 
 
614 aa  627  1e-178  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  52.24 
 
 
644 aa  626  1e-178  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  9.9925e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  52.81 
 
 
644 aa  625  1e-178  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  53.93 
 
 
644 aa  624  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  53.93 
 
 
644 aa  624  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  52.17 
 
 
645 aa  622  1e-177  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  7.4774e-09  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  52.46 
 
 
638 aa  623  1e-177  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  52.37 
 
 
638 aa  621  1e-177  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  50.68 
 
 
636 aa  621  1e-176  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 
648 aa  620  1e-176  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  52.74 
 
 
644 aa  617  1e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  52.2 
 
 
636 aa  615  1e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  51.33 
 
 
659 aa  615  1e-175  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0984  threonyl-tRNA synthetase  51.87 
 
 
644 aa  615  1e-175  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.234013 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  52.76 
 
 
644 aa  613  1e-174  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  51.85 
 
 
635 aa  610  1e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  7.17334e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  53.09 
 
 
638 aa  608  1e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.02997e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  53.19 
 
 
640 aa  611  1e-173  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  51.68 
 
 
636 aa  609  1e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  53.19 
 
 
640 aa  610  1e-173  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  52.96 
 
 
646 aa  605  1e-172  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0566  threonyl-tRNA synthetase  50.45 
 
 
583 aa  605  1e-172  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  51.23 
 
 
635 aa  602  1e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.78172e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 
639 aa  602  1e-171  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.79764e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  50.79 
 
 
649 aa  601  1e-170  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0744  threonyl-tRNA synthetase  50.18 
 
 
581 aa  600  1e-170  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0359075  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33493  predicted protein  51.71 
 
 
684 aa  601  1e-170  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0723  threonyl-tRNA synthetase  53.3 
 
 
631 aa  601  1e-170  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  4.76694e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  51.15 
 
 
633 aa  595  1e-169  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  9.91077e-08  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  51.76 
 
 
634 aa  596  1e-169  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  51.57 
 
 
637 aa  596  1e-169  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  1.37846e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  50.88 
 
 
635 aa  593  1e-168  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2095  threonyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 
684 aa  595  1e-168  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00031634  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2850  threonyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 
604 aa  590  1e-167  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185982  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 
635 aa  587  1e-166  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0516  threonyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 
637 aa  586  1e-166  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1907  threonyl-tRNA synthetase  49.64 
 
 
637 aa  585  1e-166  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  1.67344e-05 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1034  threonyl-tRNA synthetase  51.1 
 
 
611 aa  584  1e-165  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0490  threonyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 
647 aa  583  1e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00808985  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 
634 aa  581  1e-164  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.36416e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0935  threonyl-tRNA synthetase  50.18 
 
 
611 aa  577  1e-163  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0867221  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  50.27 
 
 
635 aa  572  1e-162  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  3.83369e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1300  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  51.09 
 
 
639 aa  573  1e-162  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1507  threonyl-tRNA synthetase  48.23 
 
 
649 aa  569  1e-161  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.266157  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1740  threonyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 
645 aa  570  1e-161  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0523763  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  49.82 
 
 
636 aa  568  1e-161  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1774  threonyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 
645 aa  570  1e-161  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  49.13 
 
 
638 aa  567  1e-160  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0797  threonyl-tRNA synthetase  48.62 
 
 
652 aa  567  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_46103  predicted protein  50.71 
 
 
564 aa  563  1e-159  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.036188 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0835  threonyl-tRNA synthetase  50.63 
 
 
640 aa  559  1e-158  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3269  threonyl-tRNA synthetase  48.32 
 
 
657 aa  560  1e-158  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2661  threonyl-tRNA synthetase  49.64 
 
 
644 aa  560  1e-158  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  3.86283e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0081  threonyl-tRNA synthetase  50 
 
 
605 aa  561  1e-158  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  7.16431e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2108  threonyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 
659 aa  560  1e-158  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249058  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1246  threonyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 
645 aa  560  1e-158  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  47.2 
 
 
646 aa  560  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0613  threonyl-tRNA synthetase  48.44 
 
 
648 aa  556  1e-157  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0841  threonine--tRNA ligase  46.23 
 
 
676 aa  555  1e-157  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2078  threonyl-tRNA synthetase  47.79 
 
 
657 aa  558  1e-157  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2230  threonyl-tRNA synthetase  47.73 
 
 
666 aa  556  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883238  hitchhiker  8.34751e-06 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  47.38 
 
 
662 aa  553  1e-156  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1824  threonyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 
636 aa  552  1e-156  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  3.92835e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1764  threonyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 
658 aa  552  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.279145  hitchhiker  0.00103927 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0028  threonyl-tRNA synthetase  48.4 
 
 
603 aa  554  1e-156  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0349  threonyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 
595 aa  551  1e-155  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129605  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1664  threonyl-tRNA synthetase  48.46 
 
 
640 aa  550  1e-155  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000605435  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3147  threonyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 
701 aa  550  1e-155  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2175  threonyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 
648 aa  550  1e-155  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2483  threonyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 
637 aa  548  1e-154  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0764303  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0711  threonyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 
647 aa  546  1e-154  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3262  threonyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 
643 aa  545  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  2.753e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2823  threonyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 
643 aa  547  1e-154  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.77582e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0448  threonyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 
677 aa  547  1e-154  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.145335  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6132  threonyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 
659 aa  548  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158599  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0110  threonyl-tRNA synthetase  48.03 
 
 
595 aa  545  1e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2089  threonyl-tRNA synthetase  46.97 
 
 
682 aa  544  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 
640 aa  543  1e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0199  threonyl-tRNA synthetase  48.05 
 
 
602 aa  539  1e-152  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0608  threonyl-tRNA synthetase  49.36 
 
 
634 aa  540  1e-152  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.769524  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0172  threonyl-tRNA synthetase  46.98 
 
 
659 aa  541  1e-152  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 
639 aa  540  1e-152  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 
639 aa  538  1e-152  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0552  threonyl-tRNA synthetase  47.82 
 
 
645 aa  536  1e-151  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.71694e-05  unclonable  1.90469e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 
639 aa  536  1e-151  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1192  threonyl-tRNA synthetase  47.32 
 
 
652 aa  537  1e-151  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2511  threonyl-tRNA synthetase  48.03 
 
 
594 aa  536  1e-151  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0678043  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1906  threonyl-tRNA synthetase  46.56 
 
 
641 aa  538  1e-151  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14910  threonyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 
692 aa  536  1e-151  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1732  threonyl-tRNA synthetase  45.04 
 
 
630 aa  535  1e-151  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4701  threonyl-tRNA synthetase  48 
 
 
645 aa  536  1e-151  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  5.66692e-08  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>