More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0708 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0708  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 598 aa  1237    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000309343  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_612  aspartyl-tRNA synthetase  96.15 
 
 		 598 aa  1190    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000641857  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  57.07 
 
 		 588 aa  689    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  55.11 
 
 		 589 aa  700    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0643  aspartyl-tRNA synthetase  94.82 
 
 		 598 aa  1178    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100017  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3786  aspartyl-tRNA synthetase  54.1 
 
 		 589 aa  682    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000017207  normal  0.0478066 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0950  aspartyl-tRNA synthetase  54.77 
 
 		 603 aa  682    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  50.67 
 
 		 608 aa  634  1e-180  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000116393  hitchhiker  0.0000000131011 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  52.1 
 
 		 601 aa  629  1e-179  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  52.45 
 
 		 600 aa  630  1e-179  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  50.5 
 
 		 600 aa  627  1e-178  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1411  aspartyl-tRNA synthetase  50.25 
 
 		 594 aa  627  1e-178  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00209555  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  50.67 
 
 		 593 aa  625  1e-178  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2037  aspartyl-tRNA synthetase  51.75 
 
 		 600 aa  626  1e-178  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.439536  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  50.5 
 
 		 597 aa  624  1e-177  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  50.93 
 
 		 592 aa  624  1e-177  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 		 586 aa  624  1e-177  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 613 aa  615  1e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 		 598 aa  618  1e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 		 596 aa  613  9.999999999999999e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 		 594 aa  612  9.999999999999999e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1946  aspartyl-tRNA synthetase  49 
 
 		 593 aa  614  9.999999999999999e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.734363  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  49.33 
 
 		 594 aa  609  1e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 		 594 aa  609  1e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 593 aa  610  1e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 		 585 aa  611  1e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 594 aa  608  9.999999999999999e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 		 592 aa  608  9.999999999999999e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 		 593 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1351  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 600 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.21332  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 		 597 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 590 aa  598  1e-170  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 		 588 aa  594  1e-168  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000219088  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 		 588 aa  594  1e-168  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000235097  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 		 594 aa  594  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 		 590 aa  589  1e-167  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 		 602 aa  590  1e-167  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 		 589 aa  590  1e-167  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1192  aspartyl-tRNA synthetase  48.91 
 
 		 588 aa  586  1e-166  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00103365  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 		 591 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 		 591 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 		 591 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 		 591 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3302  aspartyl-tRNA synthetase  48.24 
 
 		 589 aa  582  1.0000000000000001e-165  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 		 591 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 		 591 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 		 591 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 		 591 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 595 aa  582  1.0000000000000001e-165  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 		 591 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 		 627 aa  580  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 614 aa  581  1e-164  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2188  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 597 aa  578  1e-164  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1899  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 597 aa  578  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  48.38 
 
 		 591 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  47.32 
 
 		 597 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0247  aspartyl-tRNA synthetase  49.17 
 
 		 614 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0302  aspartyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 		 595 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0234684  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 		 598 aa  574  1.0000000000000001e-162  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  46.99 
 
 		 599 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0603  aspartyl-tRNA synthetase  47.82 
 
 		 588 aa  569  1e-161  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0600  aspartyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 		 592 aa  571  1e-161  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 		 599 aa  565  1e-160  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 		 599 aa  567  1e-160  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 		 598 aa  566  1e-160  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0961  aspartyl-tRNA synthetase  48.25 
 
 		 597 aa  567  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0436213  normal  0.406742 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 		 594 aa  565  1e-160  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2354  aspartyl-tRNA synthetase  47.91 
 
 		 595 aa  566  1e-160  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0056  aspartyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 596 aa  562  1.0000000000000001e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.524796  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0057  aspartyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 596 aa  562  1.0000000000000001e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000241419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 		 592 aa  563  1.0000000000000001e-159  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01940  aspartyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 		 582 aa  558  1e-158  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.425315  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  46.76 
 
 		 619 aa  560  1e-158  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0014  aspartyl-tRNA synthetase  47.74 
 
 		 602 aa  559  1e-158  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1313  aspartyl-tRNA synthetase  48.41 
 
 		 599 aa  558  1e-158  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0968  aspartyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 		 592 aa  560  1e-158  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.506019  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 610 aa  559  1e-158  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5000  aspartyl-tRNA synthetase  47.41 
 
 		 618 aa  558  1e-157  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  47.65 
 
 		 617 aa  555  1e-157  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0787  aspartyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 		 605 aa  555  1e-157  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.574625  normal  0.685476 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0475  aspartyl-tRNA synthetase  48.71 
 
 		 596 aa  554  1e-156  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000626629  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1396  aspartyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 		 597 aa  551  1e-156  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000259545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04440  aspartyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 		 592 aa  554  1e-156  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.462018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3043  aspartyl-tRNA synthetase  48.25 
 
 		 595 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 		 592 aa  548  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 		 606 aa  551  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0866  aspartyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 		 601 aa  551  1e-155  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.770528  normal  0.0740151 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1948  aspartyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 		 583 aa  549  1e-155  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4122  aspartyl-tRNA synthetase  47.04 
 
 		 601 aa  550  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154751  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0341  aspartyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 		 623 aa  546  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0356  aspartyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 		 623 aa  547  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0439  aspartyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 602 aa  547  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142464  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4411  aspartyl-tRNA synthetase  47.15 
 
 		 591 aa  546  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00200172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2595  aspartyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 		 609 aa  546  1e-154  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.325867 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0420  aspartyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 608 aa  546  1e-154  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1847  aspartyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 		 626 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0378  aspartyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 		 602 aa  546  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.074249 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1484  aspartyl-tRNA synthetase  46.61 
 
 		 587 aa  548  1e-154  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.04576e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2475  aspartyl-tRNA synthetase  47.09 
 
 		 595 aa  548  1e-154  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1822  aspartyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 		 598 aa  548  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>