More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0661 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0661  thioredoxin  100 
 
 
107 aa  221  3e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  100 
 
 
107 aa  221  3e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  98.13 
 
 
107 aa  218  2e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  1.30429e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  95.33 
 
 
107 aa  213  6e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  7.62931e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  60.78 
 
 
107 aa  144  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  63.37 
 
 
148 aa  143  7e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  58.25 
 
 
109 aa  141  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  58.82 
 
 
107 aa  140  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  58.82 
 
 
107 aa  140  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  62.38 
 
 
107 aa  139  2e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  62.38 
 
 
107 aa  139  2e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  59.41 
 
 
107 aa  138  2e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  58.42 
 
 
123 aa  138  3e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  60.4 
 
 
115 aa  137  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  56.31 
 
 
107 aa  137  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  58.1 
 
 
105 aa  136  8e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  60.4 
 
 
107 aa  136  9e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  59.22 
 
 
150 aa  135  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  59.41 
 
 
107 aa  134  3e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  60.4 
 
 
107 aa  135  3e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  59.41 
 
 
107 aa  134  3e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  59.41 
 
 
107 aa  134  3e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  59.41 
 
 
107 aa  134  3e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  53.33 
 
 
105 aa  134  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  54.81 
 
 
107 aa  134  6e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  58.42 
 
 
124 aa  133  7e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  52.94 
 
 
107 aa  133  9e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  9.46631e-06  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  56.44 
 
 
107 aa  132  1e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  57 
 
 
109 aa  132  2e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  54.81 
 
 
125 aa  132  2e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  55.45 
 
 
107 aa  131  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  54.29 
 
 
105 aa  130  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  2.01022e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  57 
 
 
109 aa  130  6e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  54.29 
 
 
110 aa  129  9e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  57 
 
 
109 aa  129  2e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  54.55 
 
 
106 aa  128  2e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  54.55 
 
 
106 aa  129  2e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.83291e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  51.92 
 
 
110 aa  127  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  55 
 
 
109 aa  127  5e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  54 
 
 
109 aa  127  6e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  7.55865e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  52.88 
 
 
109 aa  126  8e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  56.12 
 
 
114 aa  126  1e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  51.46 
 
 
107 aa  125  1e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  53.85 
 
 
109 aa  126  1e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  55.24 
 
 
105 aa  126  1e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  51.92 
 
 
108 aa  125  1e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  52.38 
 
 
110 aa  126  1e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  55 
 
 
108 aa  126  1e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  52.43 
 
 
107 aa  125  2e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  50.48 
 
 
110 aa  125  2e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  1.31883e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  55.79 
 
 
107 aa  124  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  50.98 
 
 
107 aa  124  4e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  5.34537e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  48.54 
 
 
107 aa  124  4e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  53.92 
 
 
107 aa  124  5e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  52.88 
 
 
108 aa  124  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  49.52 
 
 
133 aa  124  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  50.48 
 
 
110 aa  124  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  51.49 
 
 
108 aa  123  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  47.66 
 
 
107 aa  123  7e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  4.45063e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5983  thioredoxin  51.49 
 
 
108 aa  123  8e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  50.94 
 
 
110 aa  123  8e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  50.96 
 
 
108 aa  123  8e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  51.49 
 
 
108 aa  123  9e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  54.46 
 
 
108 aa  123  9e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  52 
 
 
110 aa  123  9e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4688  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  123  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376387  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  52.48 
 
 
108 aa  122  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  54.46 
 
 
106 aa  123  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  123  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  4.17679e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  53.77 
 
 
103 aa  122  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  56.84 
 
 
108 aa  122  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  52.48 
 
 
110 aa  122  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47420  Thioredoxin 1, trx1  48.04 
 
 
108 aa  122  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  52.43 
 
 
106 aa  122  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  49.04 
 
 
108 aa  122  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  45.71 
 
 
109 aa  122  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  4.29326e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  48.08 
 
 
107 aa  122  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  121  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  50.96 
 
 
108 aa  121  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0243  thioredoxin  55 
 
 
109 aa  121  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122972  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  55.1 
 
 
108 aa  121  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  50.48 
 
 
223 aa  121  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  121  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  121  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5038  thioredoxin  48.57 
 
 
109 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5243  thioredoxin  50 
 
 
109 aa  121  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3369  thioredoxin  50.94 
 
 
106 aa  120  4e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  50.52 
 
 
106 aa  121  4e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0646  thioredoxin  44.76 
 
 
111 aa  120  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  54.46 
 
 
107 aa  120  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0028  thioredoxin  55.56 
 
 
106 aa  120  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2247  thioredoxin  50 
 
 
113 aa  120  5e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.203984  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  49.04 
 
 
109 aa  120  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2157  thioredoxin  50.96 
 
 
113 aa  120  6e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.336694  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  50.96 
 
 
108 aa  120  6e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  52.48 
 
 
108 aa  120  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  52.48 
 
 
108 aa  120  6e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  8.66569e-05 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03717  thioredoxin  50 
 
 
113 aa  120  6e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  52.48 
 
 
108 aa  120  6e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  52.48 
 
 
108 aa  120  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>