More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0655 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0655  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  100 
 
 
368 aa  754    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0689  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  100 
 
 
368 aa  754    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0625  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  90.22 
 
 
368 aa  684    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.027617  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_593  histidinol-phosphate aminotransferase  95.38 
 
 
368 aa  721    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.28275  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1052  aminotransferase class I and II  41.51 
 
 
383 aa  280  2e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0650  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  40.16 
 
 
366 aa  225  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000240372  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0633  aminotransferase class I and II  38.42 
 
 
354 aa  222  7e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.982907  normal  0.468003 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0576  aminotransferase, class I and II  37.64 
 
 
357 aa  220  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0487  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  40.06 
 
 
399 aa  210  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1104  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  34.78 
 
 
375 aa  203  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2087  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  34.97 
 
 
498 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.787862  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1260  aminotransferase class I and II  37.24 
 
 
365 aa  197  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2151  aminotransferase class I and II  35.82 
 
 
349 aa  189  9e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.518477  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0374  histidinol-phosphate aminotransferase  32.44 
 
 
371 aa  187  2e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0686765  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1287  aminotransferase class I and II  35.69 
 
 
356 aa  186  5e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0948768  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0043  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  37.57 
 
 
357 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  35.75 
 
 
386 aa  184  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  35.39 
 
 
369 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1456  histidinol-phosphate aminotransferase  32.17 
 
 
371 aa  182  6e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.591481  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0463  histidinol-phosphate aminotransferase  31.9 
 
 
371 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.070497  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0940  aminotransferase, class I and II  32.52 
 
 
334 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.240572  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3603  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  34.41 
 
 
370 aa  182  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0250  histidinol-phosphate aminotransferase  32.56 
 
 
371 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.941413  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0745  aminotransferase  34.2 
 
 
331 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23290  histidinol-phosphate aminotransferase  34.44 
 
 
369 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.113747 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3537  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  34.12 
 
 
379 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  35.76 
 
 
351 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1020  aminotransferase class I and II  35.92 
 
 
364 aa  177  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0869  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.52 
 
 
358 aa  177  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3453  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  32.03 
 
 
496 aa  177  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.131993 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 
371 aa  176  5e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0531  histidinol-phosphate aminotransferase  31.42 
 
 
371 aa  176  7e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.237574  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0496  histidinol-phosphate aminotransferase  34.78 
 
 
374 aa  175  9e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.128785  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  33.71 
 
 
364 aa  175  9e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1447  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.75 
 
 
332 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2089  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  33.42 
 
 
498 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2208  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.47 
 
 
356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1312  histidinol-phosphate aminotransferase  35.73 
 
 
374 aa  173  3.9999999999999995e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000790606 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  31.68 
 
 
362 aa  171  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1684  histidinol-phosphate aminotransferase  32.33 
 
 
369 aa  171  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0420  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.52 
 
 
356 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  30.49 
 
 
358 aa  171  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2989  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  35.04 
 
 
361 aa  169  5e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.223207  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1406  aminotransferase, class I and II  33.05 
 
 
332 aa  170  5e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000645732  normal  0.305169 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  30.9 
 
 
372 aa  169  7e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3038  histidinol-phosphate aminotransferase  33.53 
 
 
365 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3089  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.14 
 
 
366 aa  167  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00022777  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  35.97 
 
 
355 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1466  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.8 
 
 
362 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  32.88 
 
 
369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  33.71 
 
 
374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 
374 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1295  threonine-phosphate decarboxylase  31.07 
 
 
354 aa  164  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.806359  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0952  histidinol-phosphate aminotransferase  32.31 
 
 
384 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.221365  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1623  aminotransferase family protein  31.94 
 
 
358 aa  163  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0121339  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1114  threonine-phosphate decarboxylase  31.64 
 
 
354 aa  163  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.677622  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15840  histidinol-phosphate aminotransferase  32.78 
 
 
370 aa  162  6e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  33.23 
 
 
348 aa  162  6e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3006  histidinol-phosphate aminotransferase  30.89 
 
 
368 aa  162  7e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  31.58 
 
 
370 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0717  histidinol-phosphate aminotransferase  33.15 
 
 
374 aa  162  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  31.96 
 
 
374 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0943  aminotransferase class I and II  31.37 
 
 
363 aa  161  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.4987  normal  0.594638 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  32.62 
 
 
373 aa  161  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1365  aminotransferase family protein  31.94 
 
 
358 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.078136  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  32.54 
 
 
367 aa  160  4e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  31.84 
 
 
863 aa  159  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1737  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.23 
 
 
362 aa  159  8e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0451969 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3273  histidinol-phosphate aminotransferase  35.47 
 
 
377 aa  158  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187192 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0471  histidinol-phosphate aminotransferase  28.45 
 
 
364 aa  158  1e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  32.46 
 
 
358 aa  158  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  35.37 
 
 
362 aa  157  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0329  histidinol-phosphate aminotransferase  33.55 
 
 
364 aa  156  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.870649  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  31.73 
 
 
864 aa  157  4e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1020  histidinol-phosphate aminotransferase  33.06 
 
 
365 aa  156  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.874382  unclonable  0.0000000000413694 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0898  histidinol-phosphate aminotransferase  33.06 
 
 
365 aa  156  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.907335  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 
351 aa  156  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  31.78 
 
 
370 aa  156  7e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  31.78 
 
 
370 aa  155  8e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  31.78 
 
 
370 aa  155  8e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  32.37 
 
 
369 aa  155  8e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  31.78 
 
 
370 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  33.64 
 
 
364 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  31.78 
 
 
370 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0118  aminotransferase, class I and II  30.54 
 
 
363 aa  155  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.385241  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  32.52 
 
 
357 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2405  histidinol-phosphate aminotransferase  30.28 
 
 
389 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5729  histidinol-phosphate aminotransferase  31.63 
 
 
369 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  31.77 
 
 
370 aa  154  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2379  histidinol phosphate aminotransferase  33.33 
 
 
362 aa  154  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.279952 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1594  histidinol-phosphate aminotransferase  32.11 
 
 
365 aa  154  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121928 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2116  histidinol-phosphate aminotransferase  31.39 
 
 
388 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  unclonable  0.00000966557 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  31.58 
 
 
374 aa  154  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  32.67 
 
 
383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  31.51 
 
 
370 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2574  histidinol-phosphate aminotransferase  31.49 
 
 
376 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.62978  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0304  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.93 
 
 
361 aa  153  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  31.74 
 
 
371 aa  153  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1811  histidinol-phosphate aminotransferase  28.95 
 
 
375 aa  152  5.9999999999999996e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1116  histidinol-phosphate aminotransferase  32.19 
 
 
370 aa  153  5.9999999999999996e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.177687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>