More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0565 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0565  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  100 
 
 
140 aa  271  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0014162  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0539  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  92.86 
 
 
140 aa  256  8e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000746068  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_504  ATP synthase F1, epsilon subunit  97.14 
 
 
140 aa  240  5e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115824  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0062  ATP synthase F1, epsilon subunit  55.3 
 
 
140 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3149  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  51.88 
 
 
132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4073  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  52.24 
 
 
136 aa  128  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000149608  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2581  ATP synthase F1, epsilon subunit  49.62 
 
 
134 aa  123  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2189  ATP synthase F1, epsilon subunit  49.26 
 
 
134 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0984  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  49.61 
 
 
134 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111243  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3130  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.01 
 
 
138 aa  114  6e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2832  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  55.88 
 
 
134 aa  114  6e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3405  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.7 
 
 
138 aa  111  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0950  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.27 
 
 
138 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.594443  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0084  ATP synthase F1, epsilon subunit  49.22 
 
 
139 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.78895  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0511  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  49.25 
 
 
139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.808616 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2196  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  53.92 
 
 
134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2211  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  49.5 
 
 
138 aa  108  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1264  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  49.25 
 
 
139 aa  107  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3367  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  50 
 
 
142 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2868  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.48 
 
 
140 aa  105  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5154  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.94 
 
 
133 aa  102  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000334813  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5395  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.94 
 
 
133 aa  102  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.03867e-36 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5525  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.94 
 
 
133 aa  102  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000524846  hitchhiker  0.00000000227919 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5546  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.94 
 
 
133 aa  102  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000710132  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3735  ATP synthase F1, epsilon subunit  43.61 
 
 
139 aa  102  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3955  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.68 
 
 
142 aa  102  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0052877  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2429  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.45 
 
 
141 aa  102  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0464757  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0114  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.51 
 
 
138 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.693828  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2743  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.88 
 
 
141 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17790  ATP synthase F1, epsilon subunit  44.34 
 
 
134 aa  102  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4164  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.24 
 
 
133 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000197005  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5429  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.18 
 
 
133 aa  101  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.886017  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5102  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.18 
 
 
133 aa  101  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4986  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.18 
 
 
133 aa  101  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.761733  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5004  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.18 
 
 
133 aa  101  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000172013  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5481  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.18 
 
 
133 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5425  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.18 
 
 
133 aa  101  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0122155  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3414  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.42 
 
 
133 aa  100  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0984  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.18 
 
 
139 aa  99.8  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0109346  normal  0.392067 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3169  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.51 
 
 
138 aa  99.4  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00353797  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3824  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.18 
 
 
133 aa  99.8  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3202  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.46 
 
 
141 aa  99.8  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.447549  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2806  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.46 
 
 
141 aa  99.8  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.668633 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2136  ATP synthase F1, epsilon subunit  47.17 
 
 
137 aa  99  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0027  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.79 
 
 
138 aa  98.6  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3994  ATP synthase F1, epsilon subunit  41.35 
 
 
140 aa  99  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.305683  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4115  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.11 
 
 
141 aa  98.2  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.968865  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3949  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.48 
 
 
138 aa  98.2  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1508  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40 
 
 
138 aa  98.6  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4034  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.48 
 
 
138 aa  97.8  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000113371 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3304  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.91 
 
 
141 aa  97.1  8e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3510  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.34 
 
 
140 aa  97.1  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4264  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.7 
 
 
138 aa  97.1  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4175  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.11 
 
 
140 aa  96.7  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.295254  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4227  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.11 
 
 
140 aa  96.7  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4201  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.11 
 
 
140 aa  96.7  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.110385  normal  0.374799 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0607  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.26 
 
 
138 aa  96.7  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.444989  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2381  ATP synthase F1, epsilon subunit  40.6 
 
 
137 aa  96.7  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4258  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.11 
 
 
139 aa  96.3  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4548  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.11 
 
 
139 aa  95.9  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4195  ATP synthase F1, epsilon subunit  42.11 
 
 
140 aa  95.9  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4461  ATP synthase F1, epsilon subunit  40.74 
 
 
139 aa  95.9  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000884862 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0273  ATP synthase F1, epsilon subunit  38.52 
 
 
134 aa  95.9  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.16135  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4331  hypothetical protein  39.42 
 
 
142 aa  95.1  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.132194  normal  0.706309 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.01 
 
 
141 aa  95.5  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2023  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.41 
 
 
138 aa  95.1  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4133  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.35 
 
 
139 aa  95.1  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.490759  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3289  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.29 
 
 
141 aa  94.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2948  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.29 
 
 
141 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.29 
 
 
141 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.722454 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0098  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.29 
 
 
141 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.712946  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0123  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.29 
 
 
141 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.29 
 
 
141 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03615  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.35 
 
 
139 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.901981  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4236  ATP synthase F1, epsilon subunit  41.35 
 
 
139 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03559  hypothetical protein  41.35 
 
 
139 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.772502  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4263  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.35 
 
 
139 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.634105  normal  0.317947 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4099  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.35 
 
 
139 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.420004 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4246  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.35 
 
 
139 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.014203  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2529  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.91 
 
 
140 aa  94.4  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3947  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.35 
 
 
139 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5167  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.35 
 
 
139 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0939649 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4483  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  49.5 
 
 
132 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3073  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  43.38 
 
 
140 aa  94  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4347  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  49.5 
 
 
132 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4502  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  49.5 
 
 
132 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2796  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.23 
 
 
140 aa  93.6  7e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4790  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.69 
 
 
132 aa  93.2  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0216  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.18 
 
 
141 aa  93.6  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4074  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.35 
 
 
137 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69427  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4089  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.35 
 
 
139 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3016  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.29 
 
 
141 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4041  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.29 
 
 
141 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3967  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.29 
 
 
141 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0311  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.86 
 
 
139 aa  92.8  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.31293  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2377  ATP synthase F1, epsilon subunit  52.75 
 
 
134 aa  93.2  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163402 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4195  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.35 
 
 
137 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2756  ATP synthase F1, epsilon subunit  40.71 
 
 
148 aa  92.8  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1586  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.29 
 
 
141 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3354  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.29 
 
 
141 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>