More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0538 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0538  ATP-binding protein  100 
 
 		 426 aa  888    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.436507  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0514  IstB ATP binding domain-containing protein  92.02 
 
 		 469 aa  824    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_479  DNA replication protein  94.6 
 
 		 470 aa  828    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2340  IstB domain protein ATP-binding protein  47.9 
 
 		 241 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0243849  decreased coverage  0.0019144 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0089  IstB ATP binding domain-containing protein  46.71 
 
 		 266 aa  156  8e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3988  IstB ATP binding domain-containing protein  48.08 
 
 		 263 aa  151  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332304 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1147  IstB ATP binding domain-containing protein  48.08 
 
 		 263 aa  152  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000971836  decreased coverage  0.00111999 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1816  IstB domain protein ATP-binding protein  39.9 
 
 		 280 aa  147  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0524  IstB ATP binding domain-containing protein  40.23 
 
 		 236 aa  129  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0355335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4023  hypothetical protein  36.42 
 
 		 263 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0425  hypothetical protein  35.84 
 
 		 267 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3827  hypothetical protein  35.84 
 
 		 267 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.745457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0439  hypothetical protein  35.84 
 
 		 267 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00568017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4120  hypothetical protein  35.84 
 
 		 267 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1289  AAA ATPase  40.69 
 
 		 247 aa  109  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.36867 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0041  hypothetical protein  38.16 
 
 		 241 aa  107  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1702  IstB domain protein ATP-binding protein  35.62 
 
 		 245 aa  107  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1404  IstB ATP binding domain-containing protein  31.96 
 
 		 267 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2785  IstB domain protein ATP-binding protein  39.66 
 
 		 275 aa  97.4  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2013  AAA ATPase  37.89 
 
 		 283 aa  94.7  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0083652  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0893  IstB ATP binding domain-containing protein  37.59 
 
 		 241 aa  94  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2486  hypothetical protein  32.42 
 
 		 261 aa  86.3  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3956  IstB ATP binding domain-containing protein  30.43 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4898  DNA replication protein DnaC  28.57 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.953972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4957  DNA replication protein DnaC  28.57 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.178341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4951  DNA replication protein DnaC  28.57 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4864  DNA replication protein DnaC  28.57 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4797  DNA replication protein DnaC  28.57 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.849133 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1254  DNA replication protein DnaC  37.96 
 
 		 242 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.014499  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04238  DNA biosynthesis protein  29.88 
 
 		 245 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000679952  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3636  AAA ATPase  29.88 
 
 		 245 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000285217  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3694  DNA replication protein DnaC  29.88 
 
 		 245 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000380442  hitchhiker  0.00426992 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5874  DNA replication protein DnaC  29.88 
 
 		 245 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000300612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4901  DNA replication protein DnaC  29.88 
 
 		 245 aa  82  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000247783  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04204  hypothetical protein  29.88 
 
 		 245 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000534515  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4593  DNA replication protein DnaC  29.88 
 
 		 245 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000805827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4954  DNA replication protein DnaC  29.88 
 
 		 245 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163404  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02920  hypothetical protein  37.88 
 
 		 188 aa  81.6  0.00000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000406909  hitchhiker  2.4308e-42 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4906  DNA replication protein DnaC  29.88 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000177661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1184  IstB-like ATP-binding protein  30.81 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.580215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4220  IstB domain protein ATP-binding protein  33.33 
 
 		 261 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18880  phage DNA replication protein (predicted replicative helicase loader)  34.11 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.614946  normal  0.0813321 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2347  DNA replication protein DnaC  29.33 
 
 		 327 aa  77  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.104478  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1802  hypothetical protein  30 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0516  DNA replication protein DnaC  29.69 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00591707 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0638  IstB ATP binding domain-containing protein  28.97 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.965458  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1803  DNA replication protein-like protein  29.63 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.810263  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5818  ATPase  29.14 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1434  DNA replication protein DnaC, putative  30.77 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1319  IstB ATP binding domain-containing protein  29.23 
 
 		 257 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23130  AAA ATPase  25.64 
 
 		 348 aa  68.6  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2283  putative replication protein  31.88 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552648  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1054  putative replication protein  33.09 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.547763  hitchhiker  0.000000820302 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1084  putative replication protein  33.09 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.372508  hitchhiker  0.0000157316 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4452  IstB domain protein ATP-binding protein  30 
 
 		 230 aa  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0998  IstB ATP binding domain-containing protein  35.24 
 
 		 251 aa  65.9  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0503  hypothetical protein  27.11 
 
 		 280 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000358381  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0806  AAA ATPase  28.23 
 
 		 343 aa  65.5  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2981  IstB ATP binding domain-containing protein  35.24 
 
 		 251 aa  65.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0623611  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4129  IstB ATP binding domain-containing protein  27.89 
 
 		 264 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0411  IstB ATP binding domain-containing protein  34.29 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0597  IstB ATP binding domain-containing protein  34.29 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1853  IstB ATP binding domain-containing protein  34.29 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.262764  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2255  IstB ATP binding domain-containing protein  34.29 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152335  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2397  IstB ATP binding domain-containing protein  34.29 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0127781  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3179  IstB ATP binding domain-containing protein  34.29 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4709  primosomal protein DnaI  32.43 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4474  primosomal protein DnaI  32.43 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4309  primosomal protein DnaI  32.43 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0309734  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4320  primosomal protein DnaI  32.43 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4822  primosomal protein DnaI  32.43 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4688  primosomal protein DnaI  32.43 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000410016  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0550  primosomal protein DnaI  32.43 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000173374  unclonable  3.70822e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4693  primosomal protein DnaI  32.43 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.23235e-61 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4228  IstB ATP binding domain-containing protein  34.29 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0192  IstB ATP binding domain-containing protein  34.29 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1629  IstB ATP binding domain-containing protein  34.29 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4703  primosomal protein DnaI  32.43 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000143247  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2606  DNA replication protein-like protein  28.22 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000882358 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0060  DNA replication protein, DNAC-like  33.01 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4409  primosomal protein DnaI  32.43 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0232524  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1555  IstB ATP binding domain-containing protein  30.19 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2054  IstB ATP binding domain-containing protein  30.19 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3415  IstB ATP binding domain-containing protein  30.19 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.237509  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1499  IstB domain protein ATP-binding protein  26.75 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0674056  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1552  IstB domain protein ATP-binding protein  30.15 
 
 		 234 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000031305 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1247  primosomal protein DnaI  24.63 
 
 		 306 aa  63.2  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.126779  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3449  AAA family ATPase  32.14 
 
 		 276 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.539616  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3454  AAA ATPase  32.14 
 
 		 276 aa  62.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2663  primosomal protein DnaI  30.91 
 
 		 312 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.150188  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2467  hypothetical protein  29.25 
 
 		 278 aa  62.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3438  IstB ATP binding domain-containing protein  29.51 
 
 		 268 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228593  unclonable  9.96626e-17 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0613  IstB ATP binding domain-containing protein  29.22 
 
 		 254 aa  62.4  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.328728  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2418  DNA replication protein DnaC  38.64 
 
 		 347 aa  62  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.132459  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0885  phage DnaC-like protein  28.46 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1242  replicative DNA helicase loader DnaI  29.77 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118645  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0868  DNA replication protein-like protein  28.46 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.752635  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1848  IstB domain protein ATP-binding protein  29.5 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1595  IstB domain protein ATP-binding protein  28.47 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0526328  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1549  IstB domain protein ATP-binding protein  28.47 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>