More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0499 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0499  30S ribosomal protein S13  100 
 
 
129 aa  259  1e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000323492  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0476  30S ribosomal protein S13  97.67 
 
 
129 aa  252  1.0000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000389275  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_441  ribosomal protein S13  97.67 
 
 
129 aa  252  1.0000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000306085  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  69.49 
 
 
122 aa  172  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  66.1 
 
 
123 aa  162  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  64.17 
 
 
122 aa  161  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2594  30S ribosomal protein S13  60.83 
 
 
126 aa  159  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0246557  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  60.98 
 
 
123 aa  159  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  63.33 
 
 
122 aa  157  5e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0740  ribosomal protein S13  60.48 
 
 
124 aa  157  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  60.16 
 
 
123 aa  156  9e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  62.71 
 
 
123 aa  155  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  62.5 
 
 
124 aa  155  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  59.17 
 
 
122 aa  155  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0331  30S ribosomal protein S13  60 
 
 
122 aa  154  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352213  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  60 
 
 
122 aa  154  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1930  30S ribosomal protein S13  60 
 
 
122 aa  154  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4776  ribosomal protein S13  59.17 
 
 
122 aa  154  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000216682 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1370  ribosomal protein S13  58.33 
 
 
122 aa  154  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0625987  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  60.83 
 
 
125 aa  153  8e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2882  30S ribosomal protein S13  60.83 
 
 
126 aa  153  9e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.617187  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1211  30S ribosomal protein S13  57.5 
 
 
122 aa  152  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.304522  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1978  30S ribosomal protein S13  57.5 
 
 
122 aa  153  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.234  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3304  30S ribosomal protein S13  57.5 
 
 
122 aa  152  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001925 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2666  30S ribosomal protein S13  58.33 
 
 
122 aa  152  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1174  30S ribosomal protein S13  57.5 
 
 
122 aa  152  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.119406  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  58.33 
 
 
121 aa  152  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.953183 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  57.5 
 
 
122 aa  152  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  56.67 
 
 
122 aa  152  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1924  30S ribosomal protein S13  57.5 
 
 
125 aa  152  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38502  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  59.35 
 
 
123 aa  151  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  55.28 
 
 
124 aa  151  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  60.16 
 
 
123 aa  151  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  59.69 
 
 
126 aa  150  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0136  30S ribosomal protein S13  61.86 
 
 
121 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000207382  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1656  30S ribosomal protein S13  57.5 
 
 
122 aa  150  5.9999999999999996e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.819734  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  57.5 
 
 
122 aa  150  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  59.35 
 
 
123 aa  150  8e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1636  30S ribosomal protein S13  58.33 
 
 
122 aa  149  8.999999999999999e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0556196  normal  0.0187712 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2142  30S ribosomal protein S13  57.5 
 
 
122 aa  149  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  59.69 
 
 
127 aa  149  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5048  30S ribosomal protein S13  57.5 
 
 
122 aa  149  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0590197  normal  0.99624 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  58.33 
 
 
122 aa  149  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2179  30S ribosomal protein S13  57.5 
 
 
122 aa  149  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.980549  normal  0.303897 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2457  30S ribosomal protein S13  57.5 
 
 
122 aa  149  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  62.6 
 
 
122 aa  149  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  62.71 
 
 
124 aa  149  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3426  30S ribosomal protein S13  56.67 
 
 
122 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.968346  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2989  30S ribosomal protein S13  57.5 
 
 
122 aa  148  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.183417 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2988  30S ribosomal protein S13  57.5 
 
 
125 aa  147  4e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.24286  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  54.17 
 
 
122 aa  147  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0720  30S ribosomal protein S13  55 
 
 
122 aa  147  5e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.401773  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2758  ribosomal protein S13  56.67 
 
 
122 aa  147  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.221978 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0277  30S ribosomal protein S13  57.5 
 
 
122 aa  147  5e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.630615 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  57.5 
 
 
122 aa  147  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0135  30S ribosomal protein S13  60.17 
 
 
121 aa  147  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000332211  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0166  30S ribosomal protein S13  60.17 
 
 
121 aa  147  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000872047  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0129  30S ribosomal protein S13  60.17 
 
 
121 aa  147  6e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000082296  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0135  30S ribosomal protein S13  59.32 
 
 
121 aa  146  9e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000270668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0130  30S ribosomal protein S13  59.32 
 
 
121 aa  146  9e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  5.1035300000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0128  30S ribosomal protein S13  59.32 
 
 
121 aa  146  9e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000380498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0148  30S ribosomal protein S13  59.32 
 
 
121 aa  146  9e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03785e-60 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0135  30S ribosomal protein S13  59.32 
 
 
121 aa  146  9e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000525555  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0156  30S ribosomal protein S13  59.32 
 
 
121 aa  146  9e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000111603  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1865  30S ribosomal protein S13  55.83 
 
 
122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1354  30S ribosomal protein S13  55.83 
 
 
122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0146999  normal  0.399807 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1386  30S ribosomal protein S13  55.83 
 
 
122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0423  ribosomal protein S13  59.68 
 
 
125 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0132  30S ribosomal protein S13  61.02 
 
 
121 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1773  30S ribosomal protein S13  56.67 
 
 
122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.540759  normal  0.275864 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0869  30S ribosomal protein S13  55.83 
 
 
122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000182214  hitchhiker  0.00600411 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2036  30S ribosomal protein S13  57.5 
 
 
122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.818597  normal  0.51135 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5170  30S ribosomal protein S13  58.47 
 
 
121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000106186  unclonable  6.58795e-26 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0173  30S ribosomal protein S13  60.17 
 
 
126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.190252 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1567  30S ribosomal protein S13  55 
 
 
122 aa  145  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0795251  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3644  30S ribosomal protein S13  56.67 
 
 
122 aa  144  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.17106  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0338  ribosomal protein S13  58.33 
 
 
121 aa  145  3e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2317  30S ribosomal protein S13  55.83 
 
 
122 aa  144  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal  0.403503 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1328  30S ribosomal protein S13  55 
 
 
122 aa  144  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.74324 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0130  30S ribosomal protein S13  57.63 
 
 
121 aa  144  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000556039  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2042  30S ribosomal protein S13  57.39 
 
 
128 aa  143  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3162  30S ribosomal protein S13  55.83 
 
 
122 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548712  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1008  30S ribosomal protein S13  55 
 
 
122 aa  143  8.000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.836667  normal  0.0493097 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0266  30S ribosomal protein S13  57.39 
 
 
116 aa  143  8.000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001720  SSU ribosomal protein S13p (S18e)  54.7 
 
 
118 aa  143  9e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000208001  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1170  30S ribosomal protein S13  55.47 
 
 
124 aa  143  9e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.716485  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3970  ribosomal protein S13  58.33 
 
 
121 aa  143  9e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1452  30S ribosomal protein S13  55 
 
 
122 aa  143  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0642708  normal  0.430095 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1957  30S ribosomal protein S13  57.39 
 
 
128 aa  142  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2194  30S ribosomal protein S13  55.83 
 
 
122 aa  143  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.122574  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1935  30S ribosomal protein S13  57.39 
 
 
127 aa  143  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.610956 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1922  30S ribosomal protein S13  57.39 
 
 
128 aa  142  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2152  30S ribosomal protein S13  54.7 
 
 
118 aa  142  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000893121  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2512  30S ribosomal protein S13  56.67 
 
 
122 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2529  30S ribosomal protein S13  55.83 
 
 
122 aa  142  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.186837  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1113  30S ribosomal protein S13  55.17 
 
 
123 aa  141  3e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000830783  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5763  30S ribosomal protein S13  55.83 
 
 
125 aa  141  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0615  30S ribosomal protein S13  55.83 
 
 
122 aa  141  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16920  SSU ribosomal protein S13P  55 
 
 
122 aa  141  3e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1251  30S ribosomal protein S13  55.38 
 
 
127 aa  140  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00631403  normal  0.17118 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>