More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0480 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0480  30S ribosomal protein S3  100 
 
 		 278 aa  558  1e-158  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0457  30S ribosomal protein S3  93.53 
 
 		 278 aa  501  1e-141  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991742  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_423  ribosomal protein S3  97.84 
 
 		 278 aa  491  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652723  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1518  ribosomal protein S3  60.65 
 
 		 220 aa  272  5.000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337721  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  59.15 
 
 		 226 aa  266  2.9999999999999995e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4020  ribosomal protein S3  58.04 
 
 		 260 aa  265  7e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.251089  hitchhiker  0.00000649383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1179  ribosomal protein S3  53.57 
 
 		 262 aa  263  2e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484191  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  57.41 
 
 		 218 aa  261  6e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  55.61 
 
 		 214 aa  261  6.999999999999999e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0292  30S ribosomal protein S3  57.75 
 
 		 220 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100891  normal  0.0448261 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0764  ribosomal protein S3  54.13 
 
 		 222 aa  258  6e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000320467  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3018  ribosomal protein S3  57.62 
 
 		 241 aa  258  7e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0195481  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  55.87 
 
 		 221 aa  257  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  57.62 
 
 		 218 aa  256  2e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  55.09 
 
 		 218 aa  256  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0064  30S ribosomal protein S3  58.22 
 
 		 217 aa  255  6e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00697995  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1901  30S ribosomal protein S3  58.22 
 
 		 217 aa  255  6e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.563087  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2909  SSU ribosomal protein S3P  53.52 
 
 		 226 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  56.6 
 
 		 219 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1477  30S ribosomal protein S3  53.21 
 
 		 221 aa  252  4.0000000000000004e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000764619  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0873  30S ribosomal protein S3  54.13 
 
 		 221 aa  251  8.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000095133  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  57.62 
 
 		 219 aa  250  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0110  30S ribosomal protein S3  53.24 
 
 		 219 aa  251  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000133483  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1739  ribosomal protein S3  55.3 
 
 		 222 aa  248  8e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032444  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0297  30S ribosomal protein S3  54.21 
 
 		 222 aa  248  8e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.5955900000000001e-28 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4921  ribosomal protein S3  55.26 
 
 		 230 aa  248  9e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0969238  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0111  30S ribosomal protein S3  53.24 
 
 		 219 aa  247  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000062196  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5189  30S ribosomal protein S3  52.78 
 
 		 219 aa  246  4e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000094199  unclonable  1.62141e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0116  30S ribosomal protein S3  52.78 
 
 		 219 aa  246  4e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0128  30S ribosomal protein S3  52.78 
 
 		 219 aa  246  4e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.11451e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0116  30S ribosomal protein S3  52.78 
 
 		 219 aa  246  4e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000111227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0112  30S ribosomal protein S3  52.78 
 
 		 219 aa  246  4e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.8436400000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0110  30S ribosomal protein S3  52.78 
 
 		 219 aa  246  4e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0116  30S ribosomal protein S3  52.78 
 
 		 219 aa  246  4e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000165133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0147  30S ribosomal protein S3  52.78 
 
 		 219 aa  246  4e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000084584  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0137  30S ribosomal protein S3  52.78 
 
 		 219 aa  246  4e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0200  SSU ribosomal protein S3P  53.33 
 
 		 229 aa  245  6.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0421793  normal  0.0820646 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2396  30S ribosomal protein S3  55.66 
 
 		 217 aa  244  9e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0132783  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3999  ribosomal protein S3  52.73 
 
 		 223 aa  244  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.217214  normal  0.669985 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1825  30S ribosomal protein S3  52.31 
 
 		 217 aa  242  3.9999999999999997e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.652235  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2312  30S ribosomal protein S3  53.11 
 
 		 217 aa  242  6e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000168649  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2271  30S ribosomal protein S3  53.11 
 
 		 217 aa  242  6e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000428524  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1939  ribosomal protein S3  52.73 
 
 		 224 aa  241  7.999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2024  ribosomal protein S3  52.73 
 
 		 224 aa  241  7.999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145772  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1940  SSU ribosomal protein S3P  52.73 
 
 		 224 aa  241  9e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2168  30S ribosomal protein S3  52.49 
 
 		 233 aa  241  1e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000068862  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3909  30S ribosomal protein S3  52.97 
 
 		 232 aa  239  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000178804  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0590  30S ribosomal protein S3  52.97 
 
 		 232 aa  239  4e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336971  normal  0.465615 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0289  30S ribosomal protein S3  52.97 
 
 		 232 aa  239  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000655466  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1436  30S ribosomal protein S3  50.21 
 
 		 243 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0795815  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3816  30S ribosomal protein S3  52.29 
 
 		 233 aa  239  5e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000890302  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0721  ribosomal protein S3  52 
 
 		 226 aa  239  5e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3995  30S ribosomal protein S3  52.29 
 
 		 233 aa  239  5e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4538  30S ribosomal protein S3  52.97 
 
 		 232 aa  238  5.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472984  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0285  30S ribosomal protein S3  49.55 
 
 		 236 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000103964  hitchhiker  0.0000018675 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2318  30S ribosomal protein S3  50.23 
 
 		 223 aa  238  9e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000695636  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6043  30S ribosomal protein S3  55.29 
 
 		 325 aa  238  9e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2708  30S ribosomal protein S3  49.77 
 
 		 222 aa  238  9e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2393  30S ribosomal protein S3  49.77 
 
 		 222 aa  238  9e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03165  30S ribosomal protein S3  51.83 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00374176  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0399  ribosomal protein S3  51.83 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000257024  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3609  30S ribosomal protein S3  51.83 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000291269  normal  0.0112128 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4637  30S ribosomal protein S3  51.83 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00278022  normal  0.0942567 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1338  30S ribosomal protein S3  49.79 
 
 		 243 aa  237  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0464681  normal  0.115598 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0399  30S ribosomal protein S3  51.83 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000141068  hitchhiker  0.0000729403 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3630  30S ribosomal protein S3  51.83 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0724577  normal  0.691725 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3745  30S ribosomal protein S3  51.83 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000025032  hitchhiker  0.00113301 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3699  30S ribosomal protein S3  51.83 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153229  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3508  30S ribosomal protein S3  51.83 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538349  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3797  30S ribosomal protein S3  51.83 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000046077  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3703  30S ribosomal protein S3  51.83 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00180602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03116  hypothetical protein  51.83 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00261004  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3630  30S ribosomal protein S3  51.83 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000937087  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0987  ribosomal protein S3  51.34 
 
 		 245 aa  238  1e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.499926  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3801  30S ribosomal protein S3  51.83 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0443981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3738  30S ribosomal protein S3  51.83 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.338082  normal  0.0279522 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0065  30S ribosomal protein S3  53.37 
 
 		 235 aa  236  2e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0358705  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1568  ribosomal protein S3  50 
 
 		 238 aa  237  2e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000461215  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1178  ribosomal protein S3  52.97 
 
 		 223 aa  236  3e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000314343  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0588  30S ribosomal protein S3  54.81 
 
 		 315 aa  236  3e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0329  30S ribosomal protein S3  51.83 
 
 		 233 aa  236  3e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000157005  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0334  ribosomal protein S3  53.85 
 
 		 233 aa  236  3e-61  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.385043  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0411  30S ribosomal protein S3  51.83 
 
 		 233 aa  236  3e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0239377  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2327  30S ribosomal protein S3  54.71 
 
 		 227 aa  236  3e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000359117  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0686  30S ribosomal protein S3  51.67 
 
 		 210 aa  236  3e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.15256  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0464  30S ribosomal protein S3  54.33 
 
 		 226 aa  236  4e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3429  ribosomal protein S3  53.21 
 
 		 268 aa  236  4e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1917  ribosomal protein S3  52.07 
 
 		 224 aa  235  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652876 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4270  ribosomal protein S3  52.4 
 
 		 226 aa  235  5.0000000000000005e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000216647  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06310  30S ribosomal protein S3  50.92 
 
 		 228 aa  235  7e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91278  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3903  30S ribosomal protein S3  50.92 
 
 		 228 aa  235  7e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0436883  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0568  30S ribosomal protein S3  54.11 
 
 		 278 aa  234  9e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0843  30S ribosomal protein S3  51.61 
 
 		 228 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0495  30S ribosomal protein S3  53.85 
 
 		 242 aa  233  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000115275  hitchhiker  0.00400345 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0773  30S ribosomal protein S3  49.52 
 
 		 286 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000686898  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08910  30S ribosomal protein S3  51.61 
 
 		 228 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0180544 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0632  ribosomal protein S3  50.92 
 
 		 228 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00163492  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5073  30S ribosomal protein S3  50.92 
 
 		 228 aa  233  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216562  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0493  30S ribosomal protein S3  50.92 
 
 		 228 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464846  normal  0.111354 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0490  30S ribosomal protein S3  53.85 
 
 		 242 aa  233  3e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000127993  normal  0.0282319 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>