More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0473 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0473  30S ribosomal protein S10  100 
 
 
102 aa  204  4e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000156934  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_416  ribosomal protein S10  100 
 
 
102 aa  204  4e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574411  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0450  30S ribosomal protein S10  98.04 
 
 
102 aa  201  2e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000251072  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3025  30S ribosomal protein S10  75.49 
 
 
102 aa  165  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.544765  hitchhiker  0.00279122 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4027  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 
102 aa  164  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000005274 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1186  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 
102 aa  161  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.376062  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0714  ribosomal protein S10  71.57 
 
 
102 aa  155  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0421  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 
102 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238297  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3444  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 
103 aa  143  9e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.000018475  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0224  ribosomal protein S10  66.67 
 
 
102 aa  142  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0278  30S ribosomal protein S10  61.76 
 
 
102 aa  141  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078248  unclonable  0.0000000940306 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3865  30S ribosomal protein S10  61.76 
 
 
103 aa  140  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2951  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 
103 aa  140  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00000133875  hitchhiker  0.000000722255 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3298  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 
103 aa  140  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000231204  hitchhiker  0.000170279 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0404  30S ribosomal protein S10  61.76 
 
 
102 aa  140  7e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000016581  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0390  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 
103 aa  140  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000705562  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0337  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 
103 aa  140  8e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012954  decreased coverage  0.000295628 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0272  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 
103 aa  140  8e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.0000000000156586  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0277  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 
103 aa  140  8e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0000127009  decreased coverage  0.000000000926134 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3020  30S ribosomal protein S10  63.64 
 
 
104 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000044729  hitchhiker  0.00550197 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1525  ribosomal protein S10  65.69 
 
 
102 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.651999  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2461  30S ribosomal protein S10  61.76 
 
 
102 aa  139  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.043315 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1868  30S ribosomal protein S10  65.35 
 
 
107 aa  139  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0207865  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0846  SSU ribosomal protein S10P  63.73 
 
 
103 aa  138  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000264723  decreased coverage  0.00000947215 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3796  30S ribosomal protein S10  61.39 
 
 
104 aa  138  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000453996  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0214  ribosomal protein S10  62.75 
 
 
102 aa  138  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114911  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0766  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 
102 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.300244  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3181  30S ribosomal protein S10  59.8 
 
 
102 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000486821  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3323  30S ribosomal protein S10  59.8 
 
 
102 aa  137  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.434875  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1263  30S ribosomal protein S10  59.8 
 
 
103 aa  137  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0110329  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01160  ribosomal protein S10  63.64 
 
 
103 aa  137  7e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000349687  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1946  30S ribosomal protein S10  61.39 
 
 
101 aa  136  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0227  ribosomal protein S10  60.78 
 
 
102 aa  136  7.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2018  30S ribosomal protein S10  61.39 
 
 
101 aa  136  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1911  30S ribosomal protein S10  61.39 
 
 
101 aa  136  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.253834 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1933  30S ribosomal protein S10  61.39 
 
 
101 aa  136  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4916  30S ribosomal protein S10  60.4 
 
 
104 aa  136  8.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175164  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0202  30S ribosomal protein S10  60.4 
 
 
104 aa  136  8.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253656  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0255  30S ribosomal protein S10  60.4 
 
 
104 aa  136  8.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000004332  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0285  ribosomal protein S10  61.76 
 
 
102 aa  136  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0119984  hitchhiker  0.00531479 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3805  30S ribosomal protein S10  59.8 
 
 
103 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00677019  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0326  30S ribosomal protein S10  59.8 
 
 
103 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00113902  normal  0.0302801 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3339  30S ribosomal protein S10  58.82 
 
 
103 aa  136  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000104246  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2633  30S ribosomal protein S10  59.8 
 
 
103 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000272648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3777  30S ribosomal protein S10  59.8 
 
 
103 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000424797  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0248  30S ribosomal protein S10  59.8 
 
 
103 aa  136  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127153  normal  0.202124 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3446  30S ribosomal protein S10  59.8 
 
 
103 aa  136  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122515  normal  0.0314834 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0193  SSU ribosomal protein S10P  66.34 
 
 
103 aa  136  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000113928  normal  0.060255 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3069  30S ribosomal protein S10  59.8 
 
 
103 aa  136  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000998747  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0313  30S ribosomal protein S10  59.8 
 
 
103 aa  136  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000233009  normal  0.0207604 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2841  30S ribosomal protein S10  59.8 
 
 
103 aa  136  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000513436  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2760  30S ribosomal protein S10  59.8 
 
 
103 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000915461  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3170  30S ribosomal protein S10  59.8 
 
 
103 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000357931  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3645  30S ribosomal protein S10  59.8 
 
 
103 aa  136  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000000475308  hitchhiker  0.0000000000162231 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3477  30S ribosomal protein S10  59.8 
 
 
103 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000483294  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0275  30S ribosomal protein S10  59.8 
 
 
103 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000312385  normal  0.114579 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0266  30S ribosomal protein S10  59.8 
 
 
103 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00303963  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1923  30S ribosomal protein S10  59.8 
 
 
103 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000013045  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3747  30S ribosomal protein S10  59.8 
 
 
103 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016598  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0347  30S ribosomal protein S10  59.8 
 
 
103 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0012099  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1554  30S ribosomal protein S10  59.8 
 
 
103 aa  135  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000633059  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1832  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 
102 aa  135  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000860395  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0476  ribosomal protein S10  61.62 
 
 
108 aa  135  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2278  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 
102 aa  135  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000204136  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3924  30S ribosomal protein S10  61.76 
 
 
102 aa  135  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0980  ribosomal protein S10  60.4 
 
 
106 aa  135  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.604539  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4316  30S ribosomal protein S10  61.76 
 
 
102 aa  135  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318544 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2319  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 
102 aa  135  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000523033  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2620  30S ribosomal protein S10  63.27 
 
 
104 aa  134  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0089827  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1796  SSU ribosomal protein S10P  59.8 
 
 
104 aa  135  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.13057  normal  0.040484 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0468  30S ribosomal protein S10  57.84 
 
 
103 aa  134  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000173961  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0147  ribosomal protein S10  58.82 
 
 
103 aa  134  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000495355  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0052  30S ribosomal protein S10  58.82 
 
 
103 aa  134  5e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000149229  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2858  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 
102 aa  134  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800784  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0961  ribosomal protein S10  59.8 
 
 
102 aa  134  5e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000260411  hitchhiker  0.000000000152054 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10030  SSU ribosomal protein S10P  59.8 
 
 
102 aa  134  5e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000017716  hitchhiker  0.00000000188362 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00444  30S ribosomal protein S10  58.82 
 
 
103 aa  134  5e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0405184  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1184  30S ribosomal protein S10  61.76 
 
 
102 aa  134  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0592971 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0195  30S ribosomal protein S10  61.76 
 
 
102 aa  134  5e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00451174  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0049  30S ribosomal protein S10  58.82 
 
 
103 aa  134  5e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000291739  decreased coverage  2.20907e-25 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4318  30S ribosomal protein S10  56.86 
 
 
103 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000242072  unclonable  0.0000000000477389 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0318  30S ribosomal protein S10  59.8 
 
 
103 aa  134  6.0000000000000005e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.1858999999999998e-21  hitchhiker  0.0000342143 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2689  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 
102 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.283235  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4691  30S ribosomal protein S10  56.86 
 
 
103 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000838307  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0183  30S ribosomal protein S10  56.86 
 
 
103 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140291  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0230  30S ribosomal protein S10  57.84 
 
 
103 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0625  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 
102 aa  133  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000558853  hitchhiker  0.0000000000000328358 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0198  30S ribosomal protein S10  57.84 
 
 
103 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000200655  unclonable  0.0000000000157318 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0193  30S ribosomal protein S10  57.84 
 
 
103 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000424599  decreased coverage  0.00027939 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0157  30S ribosomal protein S10  57.84 
 
 
103 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000255753  decreased coverage  0.0000448668 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0198  30S ribosomal protein S10  57.84 
 
 
103 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000267319  hitchhiker  0.0000000013297 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0305  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 
102 aa  133  7.000000000000001e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170298 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1163  ribosomal protein S10  59.8 
 
 
102 aa  133  8e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000940072  hitchhiker  0.000000509949 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1575  ribosomal protein S10  59.8 
 
 
102 aa  133  8e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000000735097  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0140  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 
102 aa  133  9e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000306915  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0103  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 
102 aa  133  9e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000504345  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0488  30S ribosomal protein S10  56.86 
 
 
103 aa  133  9e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000350893  hitchhiker  0.00967015 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0483  30S ribosomal protein S10  56.86 
 
 
103 aa  133  9e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000105944  normal  0.026966 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1484  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 
102 aa  133  9e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000272811  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0103  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 
102 aa  133  9e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>