More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0461 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  100 
 
 
358 aa  738    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  93.58 
 
 
358 aa  696    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  97.77 
 
 
358 aa  724    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1567  prephenate dehydratase  47.76 
 
 
271 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1635  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.11 
 
 
360 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  39.15 
 
 
356 aa  250  2e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0432  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.55 
 
 
360 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2997  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.55 
 
 
360 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2885  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.55 
 
 
360 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0198  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.55 
 
 
360 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2948  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.55 
 
 
360 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2575  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.55 
 
 
360 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0950  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.55 
 
 
360 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  37.18 
 
 
356 aa  246  3e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  35.93 
 
 
387 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0977  prephenate dehydratase / chorismate mutase  38.55 
 
 
360 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.23904  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  38.44 
 
 
359 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  38.44 
 
 
359 aa  243  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  39.04 
 
 
355 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  36.21 
 
 
382 aa  243  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  37.99 
 
 
360 aa  243  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  35.96 
 
 
373 aa  242  6e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  38.27 
 
 
366 aa  242  9e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3006  chorismate mutase  38.27 
 
 
360 aa  241  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224868  normal  0.0525817 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  37.32 
 
 
359 aa  239  6.999999999999999e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.29 
 
 
362 aa  236  4e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  36.47 
 
 
371 aa  235  8e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0009  chorismate mutase  34.28 
 
 
385 aa  234  1.0000000000000001e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  38.66 
 
 
361 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  36.18 
 
 
371 aa  232  6e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1313  chorismate mutase  36.47 
 
 
359 aa  232  6e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.21838e-16 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  34.17 
 
 
358 aa  232  9e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2261  chorismate mutase  38.55 
 
 
360 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.561054  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  36.54 
 
 
365 aa  230  3e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4156  prephenate dehydratase / chorismate mutase  37.08 
 
 
360 aa  230  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  37.22 
 
 
355 aa  230  3e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  36.59 
 
 
360 aa  227  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.53 
 
 
371 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  36.77 
 
 
358 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1232  prephenate dehydratase  37.54 
 
 
363 aa  225  9e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.964016 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  37.6 
 
 
368 aa  224  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  36.24 
 
 
359 aa  225  1e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  36.16 
 
 
381 aa  225  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  36.87 
 
 
360 aa  224  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  33.98 
 
 
365 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1538  chorismate mutase  36.87 
 
 
362 aa  224  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2091  Chorismate mutase  45.9 
 
 
280 aa  224  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.746584  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  33.7 
 
 
365 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  38.94 
 
 
359 aa  222  6e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.77 
 
 
358 aa  222  8e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1686  chorismate mutase / prephenate dehydratase  38.14 
 
 
355 aa  222  8e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  34.17 
 
 
364 aa  222  8e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0961  chorismate mutase  35.59 
 
 
374 aa  221  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  37.25 
 
 
402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1002  chorismate mutase  37.08 
 
 
360 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1043  chorismate mutase  37.08 
 
 
360 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  36.03 
 
 
371 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.7 
 
 
364 aa  219  5e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  36.41 
 
 
374 aa  218  1e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1193  chorismate mutase  34.73 
 
 
366 aa  218  1e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1293  Prephenate dehydratase  45.79 
 
 
293 aa  218  1e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.821795  normal  0.378721 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  33.43 
 
 
364 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  32.59 
 
 
365 aa  218  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0877  Prephenate dehydratase  42.18 
 
 
288 aa  218  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4721  chorismate mutase  35.54 
 
 
366 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.997566 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  33.89 
 
 
364 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  36.13 
 
 
374 aa  216  4e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0919  chorismate mutase  37.57 
 
 
360 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0585516  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0923  chorismate mutase  37.57 
 
 
360 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.432858 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0897  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.71 
 
 
358 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1019  chorismate mutase  37.71 
 
 
358 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.789998  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1589  transcription termination factor NusA  35.21 
 
 
359 aa  216  7e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  33.61 
 
 
364 aa  216  7e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  35.85 
 
 
360 aa  215  8e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  33.61 
 
 
364 aa  215  8e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  33.33 
 
 
367 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  33.33 
 
 
364 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  41.61 
 
 
274 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0568  chorismate mutase  37.71 
 
 
362 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  37.43 
 
 
367 aa  212  5.999999999999999e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0495  Prephenate dehydratase  41.79 
 
 
279 aa  212  1e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_3267  predicted protein  38.69 
 
 
304 aa  212  1e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1881  prephenate dehydratase  42.6 
 
 
298 aa  211  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.858484 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1394  chorismate mutase  34.82 
 
 
371 aa  210  3e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138573  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1666  P-protein  34.93 
 
 
359 aa  210  3e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2466  chorismate mutase / prephenate dehydratase  34.82 
 
 
371 aa  210  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0656  Prephenate dehydratase  42.03 
 
 
276 aa  209  4e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.416459  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  39.72 
 
 
311 aa  209  4e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2913  chorismate mutase  34.5 
 
 
648 aa  209  5e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2828  prephenate dehydratase / chorismate mutase  33.78 
 
 
667 aa  209  6e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2910  prephenate dehydratase / chorismate mutase  34.39 
 
 
667 aa  209  6e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3007  chorismate mutase / prephenate dehydratase  34.39 
 
 
667 aa  209  6e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1299  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.57 
 
 
359 aa  208  9e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0216  chorismate mutase  34.18 
 
 
355 aa  208  1e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0235  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.32 
 
 
391 aa  208  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1250  chorismate mutase  32.42 
 
 
382 aa  208  1e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149804  normal  0.0219371 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2539  chorismate mutase  35.38 
 
 
399 aa  207  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.409768  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1367  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.51 
 
 
671 aa  207  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1023  chorismate mutase  33.05 
 
 
365 aa  207  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3282  chorismate mutase  34.44 
 
 
366 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0668525  normal  0.62913 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>