266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0460 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0460  prephenate dehydrogenase  100 
 
 
287 aa  594  1e-169  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000113439  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_403  prephenate dehydrogenase  93.03 
 
 
287 aa  556  1e-157  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0437  prephenate dehydrogenase  86.76 
 
 
288 aa  526  1e-148  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000137716  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0760  prephenate dehydrogenase  35.85 
 
 
443 aa  176  3e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.504632  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1158  prephenate dehydrogenase  34.08 
 
 
439 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0061  prephenate dehydrogenase  34.08 
 
 
443 aa  165  8e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.532803  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0924  prephenate dehydrogenase  32.14 
 
 
505 aa  160  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1997  prephenate dehydrogenase  31.82 
 
 
437 aa  157  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0827  prephenate dehydrogenase  30.24 
 
 
439 aa  154  2e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.666183  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1502  prephenate dehydrogenase  31.77 
 
 
288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1024  prephenate dehydrogenase  31.97 
 
 
447 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2608  Prephenate dehydrogenase  28.96 
 
 
283 aa  122  8e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.749464 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1560  prephenate dehydrogenase  30 
 
 
276 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1300  prephenate dehydrogenase  30.12 
 
 
274 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.580426  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1033  prephenate dehydrogenase  33.06 
 
 
274 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.393372  normal  0.590632 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1946  prephenate dehydrogenase  29.46 
 
 
279 aa  103  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.772286  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6599  chorismate mutase  29.72 
 
 
375 aa  102  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0545  prephenate dehydrogenase  26.96 
 
 
283 aa  101  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0599  hypothetical protein  28.74 
 
 
288 aa  100  3e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0114109  normal  0.0489829 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0880  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.41 
 
 
373 aa  93.6  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.404976  normal  0.139237 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1074  chorismate mutase  26.22 
 
 
373 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134673  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02489  fused chorismate mutase T/prephenate dehydrogenase  26.22 
 
 
373 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2752  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.22 
 
 
373 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000708785  normal  0.0483395 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2987  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.22 
 
 
373 aa  89.7  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000572711  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02453  hypothetical protein  26.22 
 
 
373 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3543  prephenate dehydrogenase  30.33 
 
 
254 aa  89.7  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.372854 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3839  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.22 
 
 
373 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00182808  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1083  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.22 
 
 
373 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  hitchhiker  0.000106918 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2757  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.22 
 
 
373 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176639  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.22 
 
 
373 aa  89.7  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0271953  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0998  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.31 
 
 
372 aa  87.8  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2996  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.02 
 
 
373 aa  86.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2813  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.02 
 
 
373 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.02 
 
 
373 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.28721 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0654  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.37 
 
 
377 aa  86.3  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3943  prephenate dehydrogenase  26.8 
 
 
281 aa  86.3  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2882  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.02 
 
 
373 aa  86.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0721758  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0227  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.35 
 
 
375 aa  85.9  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2863  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.02 
 
 
373 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0273979 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3483  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.55 
 
 
373 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.250939 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3356  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.55 
 
 
373 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3219  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.55 
 
 
373 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1132  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.59 
 
 
373 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1648  hypothetical protein  26.41 
 
 
351 aa  84  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0329926 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2854  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.84 
 
 
373 aa  83.2  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663764  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3079  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.48 
 
 
373 aa  83.6  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394407  normal  0.0294046 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1785  prephenate dehydrogenase  28.44 
 
 
250 aa  82.8  0.000000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1068  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  24.48 
 
 
384 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0518794  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3147  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.02 
 
 
373 aa  82  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25 
 
 
379 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00675448  hitchhiker  0.000301963 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  24.38 
 
 
383 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0378227  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3098  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  24.21 
 
 
379 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000040953  normal  0.11712 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1215  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  24.38 
 
 
383 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000459834  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0671  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  24.3 
 
 
374 aa  80.9  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3012  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  23.4 
 
 
379 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0411144  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1173  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  24.21 
 
 
383 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00322769  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1292  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  24.56 
 
 
383 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0548711  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0287  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  23.7 
 
 
375 aa  79.7  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2833  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  23.16 
 
 
379 aa  79  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00724041  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  23.16 
 
 
379 aa  79  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0333151  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00993  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  23.43 
 
 
375 aa  79  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2024  prephenate dehydrogenase  28.44 
 
 
250 aa  79  0.00000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0118  Prephenate dehydrogenase  27.2 
 
 
262 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2269  Prephenate dehydrogenase  25.56 
 
 
371 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00760536 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0799  prephenate dehydrogenase  27.98 
 
 
250 aa  77.8  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.759284  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2473  prephenate dehydrogenase  28.12 
 
 
258 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.413514  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004405  chorismate mutase I/cyclohexadienyl dehydrogenase  22.73 
 
 
375 aa  77  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1274  prephenate dehydrogenase  29.35 
 
 
245 aa  77.4  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.885753  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0890  prephenate dehydrogenase  26.98 
 
 
253 aa  76.6  0.0000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1362  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  22.54 
 
 
379 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0334  Prephenate dehydrogenase  27.96 
 
 
292 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1054  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  23.24 
 
 
384 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.189276  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2749  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  23.13 
 
 
384 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.186478  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1164  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  21.55 
 
 
379 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00398091  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0972  prephenate dehydrogenase  31.46 
 
 
317 aa  74.7  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.161395  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  23.3 
 
 
383 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.449795  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3767  prephenate dehydrogenase  25.73 
 
 
242 aa  71.6  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000142598  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1063  prephenate dehydrogenase  28.25 
 
 
258 aa  72  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  27.37 
 
 
288 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01712  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  23.31 
 
 
384 aa  71.2  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0955  prephenate dehydrogenase  27.68 
 
 
258 aa  70.1  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0894  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  24.25 
 
 
379 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121322  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4379  Prephenate dehydrogenase  28.11 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0691262  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4492  Prephenate dehydrogenase  28.35 
 
 
267 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192992  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1510  prephenate dehydrogenase  26.49 
 
 
373 aa  68.9  0.00000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4010  prephenate dehydrogenase  28.11 
 
 
266 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.246742  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1747  Prephenate dehydrogenase  24.45 
 
 
263 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1453  prephenate dehydrogenase  25.84 
 
 
373 aa  68.2  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.542491  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  22.73 
 
 
706 aa  68.2  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0997  prephenate dehydrogenase  26.64 
 
 
237 aa  67.8  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.119392  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0273  Prephenate dehydrogenase  25.78 
 
 
252 aa  67  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.974204  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2549  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.71 
 
 
308 aa  67  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554787  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3122  prephenate dehydrogenase  26.96 
 
 
300 aa  66.6  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  26.45 
 
 
313 aa  66.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.75 
 
 
313 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1605  prephenate dehydrogenase  23.79 
 
 
374 aa  65.5  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.294712  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4102  cyclohexadienyl dehydrogenase  26.67 
 
 
314 aa  65.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.639306  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  27.81 
 
 
364 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0440  prephenate dehydrogenase  25.12 
 
 
301 aa  65.5  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01188  prephenate dehydrogenase  23.68 
 
 
375 aa  64.7  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>