More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0437 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0437  uracil-DNA glycosylase, putative  100 
 
 
189 aa  389  1e-107  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0292507  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0414  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  92.43 
 
 
206 aa  350  8e-96  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0748398  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_379  uracil DNA glycosylase superfamily, DNA polymerase bacteriophage-type  91.89 
 
 
206 aa  349  1e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0795  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  66.86 
 
 
219 aa  235  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4076  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  57.65 
 
 
212 aa  211  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.134405  normal  0.334505 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0873  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  59.78 
 
 
186 aa  206  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2449  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  55.15 
 
 
210 aa  203  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1393  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  54.55 
 
 
210 aa  191  8e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0119  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  55.09 
 
 
191 aa  174  5e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4414  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.47 
 
 
220 aa  171  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2893  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.71 
 
 
254 aa  171  6.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.260893  normal  0.720547 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2071  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.56 
 
 
211 aa  170  1e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0091  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.69 
 
 
216 aa  166  2e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0798  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.88 
 
 
217 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1056  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.15 
 
 
196 aa  162  3e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1500  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.67 
 
 
255 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.43423  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1649  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.48 
 
 
209 aa  158  4e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00048269 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0157  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.48 
 
 
200 aa  156  2e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0205394  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2784  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50 
 
 
211 aa  155  5.0000000000000005e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0335572 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2009  phage SpO1 DNA polymerase-related protein  46.34 
 
 
224 aa  152  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0331799  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0147  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.12 
 
 
202 aa  149  3e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2187  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.67 
 
 
205 aa  148  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.2 
 
 
186 aa  148  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000159527  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01520  uracil-DNA glycosylase, family 4  46.75 
 
 
195 aa  147  7e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0226409 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0426  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.2 
 
 
193 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000629945  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0411  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.2 
 
 
193 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000323475  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2276  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.69 
 
 
243 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2161  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.95 
 
 
191 aa  146  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.336529  hitchhiker  0.000279236 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0443  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.65 
 
 
281 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3405  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.2 
 
 
300 aa  144  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2925  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.83 
 
 
259 aa  143  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07710  uracil-DNA glycosylase, family 4  46.91 
 
 
213 aa  143  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2334  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.42 
 
 
219 aa  142  3e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2152  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.86 
 
 
241 aa  142  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1494  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.59 
 
 
295 aa  141  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.363091  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1589  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.59 
 
 
205 aa  141  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.316918  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0082  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.17 
 
 
264 aa  141  7e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.37 
 
 
249 aa  140  9e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.133247  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1204  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.63 
 
 
210 aa  140  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0469279  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2062  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.28 
 
 
342 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.735685 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5352  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.28 
 
 
336 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2370  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.26 
 
 
245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.114234  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6034  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.28 
 
 
346 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0371104  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2043  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.28 
 
 
346 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0466  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.79 
 
 
264 aa  139  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113584  hitchhiker  0.00887798 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1944  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.28 
 
 
345 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2075  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.28 
 
 
367 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1085  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.56 
 
 
217 aa  138  3.9999999999999997e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.863324  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2076  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.63 
 
 
194 aa  138  4.999999999999999e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1234  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.28 
 
 
358 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532559  normal  0.188562 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1363  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.22 
 
 
341 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2491  DNA polymerase domain-containing protein  44.44 
 
 
264 aa  137  1e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1369  putative DNA polymerase-related protein, bacteriophage-type  48.99 
 
 
292 aa  137  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.424674  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0314  hypothetical protein  44.17 
 
 
200 aa  136  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1940  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.37 
 
 
205 aa  136  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000409376 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1912  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.58 
 
 
199 aa  137  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1870  Uracil-DNA glycosylase-like protein  45 
 
 
233 aa  137  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00147256  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1580  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  41.34 
 
 
220 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0245048  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0718  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.38 
 
 
193 aa  136  2e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.809619 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0333  hypothetical protein  44.12 
 
 
200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1937  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.57 
 
 
285 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.090684  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2607  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  41.34 
 
 
468 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1308  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.66 
 
 
264 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0132537  normal  0.393253 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2543  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.44 
 
 
235 aa  135  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0670794  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2463  uracil-DNA glycosylase  47.14 
 
 
455 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1355  uracil-DNA glycosylase  41.34 
 
 
455 aa  135  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00548958  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0438  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.86 
 
 
189 aa  135  4e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2519  uracil-DNA glycosylase  41.34 
 
 
455 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3230  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  41.34 
 
 
455 aa  135  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2082  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  41.34 
 
 
455 aa  135  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.268517  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2003  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  41.86 
 
 
433 aa  135  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5015  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.77 
 
 
380 aa  135  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.641312  normal  0.046521 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1397  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.59 
 
 
317 aa  135  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.60425 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0290  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.16 
 
 
207 aa  134  9e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.2 
 
 
264 aa  133  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0689  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.6 
 
 
294 aa  133  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.614175  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1838  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.71 
 
 
185 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1242  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.97 
 
 
264 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.738609 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0270  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.23 
 
 
249 aa  133  1.9999999999999998e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2305  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.97 
 
 
192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0147899 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.9 
 
 
209 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1126  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.21 
 
 
235 aa  132  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1948  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.12 
 
 
190 aa  132  3e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.735506  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11480  Uracil-DNA glycosylase  44 
 
 
210 aa  131  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353711  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1656  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.86 
 
 
401 aa  131  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00964982 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2605  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.29 
 
 
203 aa  131  5e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2502  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.88 
 
 
308 aa  131  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.934489  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2882  uracil-DNA glycosylase family 4 protein  39.88 
 
 
308 aa  131  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2481  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.86 
 
 
414 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  hitchhiker  0.000867118 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1479  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.31 
 
 
184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.242328  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0200  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.95 
 
 
305 aa  129  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0839  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.04 
 
 
297 aa  129  2.0000000000000002e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0413074 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2671  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.72 
 
 
253 aa  129  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.663672 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1723  putative phage DNA polymerase  45.52 
 
 
213 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2255  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.95 
 
 
304 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1487  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40 
 
 
245 aa  128  5.0000000000000004e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3061  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.95 
 
 
255 aa  128  6e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.247484  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0808  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.11 
 
 
209 aa  127  7.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2121  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.4 
 
 
271 aa  127  8.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2028  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.48 
 
 
290 aa  127  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>