233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0428 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0428  pantothenate kinase  100 
 
 
258 aa  523  1e-147  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000188548  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_370  transcriptional regulator  92.19 
 
 
263 aa  490  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000881986  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0405  pantothenate kinase  92.19 
 
 
263 aa  483  1e-135  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000747608  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2048  putative Baf family transcriptional acitvator  49.41 
 
 
254 aa  267  1e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.298954  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0544  pantothenate kinase  50 
 
 
262 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0359  putative transcriptional acitvator, Baf family  49.01 
 
 
254 aa  265  4e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1791  Baf family transcriptional activator  50.2 
 
 
269 aa  262  4e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0171  Baf family transcriptional activator  49.61 
 
 
264 aa  261  8.999999999999999e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0246  putative transcriptional acitvator, Baf family  50.4 
 
 
254 aa  260  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.269573  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1934  pantothenate kinase  49.41 
 
 
255 aa  259  4e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.690584  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0136  pantothenate kinase  49.41 
 
 
255 aa  258  8e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000027573  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2588  pantothenate kinase  48.03 
 
 
255 aa  256  3e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705515  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0086  pantothenate kinase  45.45 
 
 
256 aa  254  8e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000411745  normal  0.0255424 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0146  pantothenate kinase  48.81 
 
 
254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0061  pantothenate kinase  48.81 
 
 
262 aa  253  3e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5243  pantothenate kinase  48.41 
 
 
262 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.141011 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0073  pantothenate kinase  48.41 
 
 
262 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0064  pantothenate kinase  48.02 
 
 
262 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0065  pantothenate kinase  48.02 
 
 
262 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0061  pantothenate kinase  48.02 
 
 
262 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0061  pantothenate kinase  48.02 
 
 
262 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0065  pantothenate kinase  48.02 
 
 
262 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0077  pantothenate kinase  48.02 
 
 
262 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.02884  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0074  pantothenate kinase  48.02 
 
 
262 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.335209 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0801  pantothenate kinase  47.22 
 
 
255 aa  251  7e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0061  pantothenate kinase  48.02 
 
 
262 aa  249  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1986  pantothenate kinase  45.45 
 
 
255 aa  248  7e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.384312 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0109  Baf family transcriptional regulator  47.43 
 
 
255 aa  248  7e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00933818  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1318  pantothenate kinase  47.04 
 
 
254 aa  248  8e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1296  Baf family transcriptional activator  49.01 
 
 
255 aa  246  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2186  Baf family transcriptional activator  48.03 
 
 
255 aa  245  4e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0655  pantothenate kinase  47.43 
 
 
254 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0136  pantothenate kinase  45.45 
 
 
274 aa  244  9e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291158 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0065  pantothenate kinase  46.83 
 
 
258 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000107258  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2319  pantothenate kinase  47.83 
 
 
254 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0559442  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00680  pantothenate kinase  47.22 
 
 
257 aa  244  9.999999999999999e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0126  Baf family transcriptional activator  48.82 
 
 
262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000054908  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1904  pantothenate kinase  47.43 
 
 
254 aa  242  5e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0063  pantothenate kinase  46.43 
 
 
258 aa  241  6e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1970  Baf family transcriptional regulator  47.04 
 
 
255 aa  240  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2816  pantothenate kinase  47.04 
 
 
256 aa  240  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000416191  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1868  putative transcriptional acitvator, Baf family  49.41 
 
 
254 aa  235  6e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0248735  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2784  pantothenate kinase  44.36 
 
 
259 aa  235  7e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2470  pantothenate kinase  44.36 
 
 
259 aa  235  7e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0549  pantothenate kinase  45.67 
 
 
258 aa  234  7e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0160  pantothenate kinase  47.62 
 
 
258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144798  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1265  putative transcriptional acitvator, Baf family  43.65 
 
 
262 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4446  putative transcriptional acitvator, Baf family  46.43 
 
 
261 aa  232  5e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3611  Baf family transcriptional activator  45.38 
 
 
264 aa  231  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1480  pantothenate kinase  48.22 
 
 
254 aa  230  1e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0377381  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1477  pantothenate kinase  46.06 
 
 
255 aa  226  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148615  normal  0.127378 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4483  putative transcriptional acitvator, Baf family  45.53 
 
 
262 aa  226  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2387  pantothenate kinase  45.85 
 
 
254 aa  225  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10195  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1572  pantothenate kinase  45.45 
 
 
254 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1477  pantothenate kinase  45.45 
 
 
254 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123819  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9156  pantothenate kinase  45.95 
 
 
260 aa  223  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166595  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0936  pantothenate kinase  43.53 
 
 
266 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4983  putative transcriptional acitvator, Baf family  42.02 
 
 
260 aa  218  6e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.442209  normal  0.98893 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2817  pantothenate kinase  44.88 
 
 
261 aa  218  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.767052 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1370  pantothenate kinase  42.69 
 
 
259 aa  217  1e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.682147  normal  0.0338763 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8379  pantothenate kinase  43.46 
 
 
262 aa  216  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414781  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2882  pantothenate kinase  42.97 
 
 
258 aa  215  5e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3423  putative Baf family transcriptional acitvator  42.8 
 
 
260 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.354519  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1570  pantothenate kinase  43.31 
 
 
257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.107574  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0424  Baf family transcriptional activator  40.78 
 
 
255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00396752  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1678  putative transcriptional acitvator, Baf family  41.9 
 
 
254 aa  212  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3046  Baf family transcriptional activator  44.58 
 
 
255 aa  211  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2285  pantothenate kinase  42.52 
 
 
260 aa  209  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0625  putative transcriptional acitvator, Baf family  38.85 
 
 
263 aa  206  3e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0215  pantothenate kinase  43.08 
 
 
256 aa  204  9e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.113786 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2533  pantothenate kinase  41.73 
 
 
257 aa  201  7e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0151685  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1193  pantothenate kinase  41.73 
 
 
257 aa  201  7e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.216883 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1989  pantothenate kinase  41.73 
 
 
257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.755587 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1331  pantothenate kinase  41.73 
 
 
256 aa  199  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181075  normal  0.0140716 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0196  pantothenate kinase  41.9 
 
 
253 aa  198  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0920  pantothenate kinase  37.15 
 
 
256 aa  198  7e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0943  pantothenate kinase  39.92 
 
 
256 aa  198  9e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0762  pantothenate kinase  40.94 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0973  pantothenate kinase  39.53 
 
 
256 aa  196  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3000  pantothenate kinase  42.69 
 
 
260 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2182  pantothenate kinase  40.7 
 
 
264 aa  196  3e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0183048  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0081  putative transcriptional acitvator, Baf family  42.91 
 
 
255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0327  putative transcriptional acitvator, Baf family  39.08 
 
 
261 aa  196  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4278  Baf family transcriptional activator  41.11 
 
 
254 aa  193  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.362141 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1198  pantothenate kinase  40.16 
 
 
259 aa  192  3e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4379  pantothenate kinase  41.11 
 
 
250 aa  192  5e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.174078 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1294  pantothenate kinase  40.08 
 
 
261 aa  190  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4713  Baf family transcriptional activator  40.71 
 
 
252 aa  190  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.073438  hitchhiker  0.000383315 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2229  pantothenate kinase  40.23 
 
 
259 aa  189  5.999999999999999e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1120  putative transcriptional acitvator, Baf family  41.9 
 
 
253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1063  pantothenate kinase  34.13 
 
 
255 aa  182  3e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.156837 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1724  putative transcriptional acitvator, Baf family  37.45 
 
 
266 aa  183  3e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.345789  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0569  putative transcriptional acitvator, Baf family  42.26 
 
 
285 aa  182  6e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.156963  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0464  pantothenate kinase  39.69 
 
 
257 aa  180  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35530  pantothenate kinase  39.08 
 
 
268 aa  179  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0754114  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1220  putative transcriptional acitvator, Baf family  38.19 
 
 
255 aa  178  7e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2217  pantothenate kinase  38.52 
 
 
263 aa  167  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1907  putative transcriptional acitvator, Baf family  38.11 
 
 
270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1811  pantothenate kinase  40.08 
 
 
262 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1376  putative transcriptional acitvator, Baf family  32.66 
 
 
252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0638474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>